Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 368,655 | C→T | S15S (AGC→AGT) | mhpA → | putative 3‑(3‑hydroxyphenyl)propanoate/3‑hydroxycinnamate hydroxylase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 368,655 | 0 | C | T | 99.7% | 1435.3 / ‑5.7 | 338 | S15S (AGC→AGT) | mhpA | putative 3‑(3‑hydroxyphenyl)propanoate/3‑hydroxycinnamate hydroxylase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (161/176); minor base G (1/0); total (162/176) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.79e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 341 total aligned reads displayed.
GTTGCGCTGTACTGTGCGCGCAACGACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGCGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGGAGAAACTC > NC_000913/368557‑368751 | ttGCGCTGTACTGTGCGCGCAACGACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGtt > 2:683225/1‑101 (MQ=255) ttGCGCTGTACTGTGCGCGCAACGACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGtt < 2:682585/101‑1 (MQ=255) tGCGCTGTACTGTGCGCGCAACGACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTc < 2:682774/101‑1 (MQ=255) tGCGCTGTACTGTGCGCGCAACGACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTc < 2:682758/101‑1 (MQ=255) gcgcTGTACTGTGCGCGCAACGACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACCCCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCa < 1:682752/101‑1 (MQ=255) gcgcTGTACTGTGCGCGCAACGACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCa > 1:683228/1‑101 (MQ=255) cgcTGTACTGTGCGCGCAACGACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAg > 2:683231/1‑101 (MQ=255) cgcTGTACTGTGCGCGCAACGACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAg < 1:682656/101‑1 (MQ=255) cgcTGTACTGTGCGCGCAACGACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAg > 1:683232/1‑101 (MQ=255) gcTGTACTGTGCGCGCAACGACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAgg < 1:682371/101‑1 (MQ=255) gcTGTACTGTGCGCGCAACGACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAgg > 1:683236/1‑101 (MQ=255) cTGTACTGTGCGCGCAACGACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGt < 2:682714/101‑1 (MQ=255) cTGTACTGTGCGCGCAACGACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGt > 1:683241/1‑101 (MQ=255) tGTACTGTGCGCGCAACGACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTg > 2:683243/1‑101 (MQ=255) tGTACTGTGCGCGCAACGACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTg > 1:683247/1‑101 (MQ=255) tACTGTGCGCGCAACGACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGc < 1:682808/101‑1 (MQ=255) tACTGTGCGCGCAACGACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGc < 2:682551/101‑1 (MQ=255) tACTGTGCGCGCAACGACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGc > 2:683250/1‑101 (MQ=255) tgtgCGCGCAACGACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGAt < 2:682602/101‑1 (MQ=255) tgtgCGCGCAACGACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGAt > 1:683254/1‑101 (MQ=255) gtgCGCGCAACGACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATc < 1:682745/101‑1 (MQ=255) cgcgcAACGACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCt > 1:683258/1‑101 (MQ=255) gcgcAACGACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCACTg < 1:682685/101‑1 (MQ=255) cgcAACGACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTgg > 1:683263/1‑101 (MQ=255) gcAACGACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGt < 2:682678/101‑1 (MQ=255) gcAACGACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGt > 2:683264/1‑101 (MQ=255) cAACGACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCt < 1:682630/97‑1 (MQ=255) cGACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCg < 1:682981/101‑1 (MQ=255) gACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCgg < 2:682720/101‑1 (MQ=255) gACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCgg > 1:683268/1‑101 (MQ=255) aTTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGccc > 2:683270/1‑101 (MQ=255) aTTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGccc < 1:682663/101‑1 (MQ=255) ttttGTCCGAGTCGTGAGGGACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCg > 1:683274/1‑101 (MQ=255) tGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGtt < 2:682989/101‑1 (MQ=255) gTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTg < 2:682528/101‑1 (MQ=255) ccGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGtt > 1:683279/1‑98 (MQ=255) cGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGc > 2:683282/1‑101 (MQ=255) gAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCt > 1:683283/1‑101 (MQ=255) gAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCt < 2:682964/101‑1 (MQ=255) aGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCtg < 1:682729/101‑1 (MQ=255) gTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCtga > 2:683288/1‑101 (MQ=255) tCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCtgat < 2:682733/101‑1 (MQ=255) tCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCtgat < 2:682617/101‑1 (MQ=255) cGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCtgatg > 2:683292/1‑101 (MQ=255) tGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTgatgat > 1:683299/1‑101 (MQ=255) tGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTgatgat > 2:683297/1‑101 (MQ=255) gAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGatgatg < 2:682804/101‑1 (MQ=255) gAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGatgatg < 2:683149/101‑1 (MQ=255) aGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATgg > 1:683304/1‑101 (MQ=255) aGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATgg > 2:683303/1‑101 (MQ=255) ggTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGc < 1:682817/101‑1 (MQ=255) ggTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGc < 2:682376/101‑1 (MQ=255) ggTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGc < 2:682481/101‑1 (MQ=255) gTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCg > 2:683310/1‑101 (MQ=255) tACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGa < 1:682791/101‑1 (MQ=255) tACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGa > 1:683311/1‑101 (MQ=255) aCTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCg < 2:682741/81‑1 (MQ=255) tGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACt > 2:683319/1‑101 (MQ=255) tGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACt > 1:683315/1‑101 (MQ=255) gAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTa < 1:682953/101‑1 (MQ=255) aaaTGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTAt > 2:683322/1‑101 (MQ=255) aaaTGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTAt < 2:682687/101‑1 (MQ=255) aaTGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTAtc > 1:683323/1‑101 (MQ=255) gCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCgg < 1:682504/101‑1 (MQ=255) aaTACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGcc < 1:682595/101‑1 (MQ=255) aaTACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGcc > 2:683329/1‑101 (MQ=255) aTACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCa < 2:682788/101‑1 (MQ=255) aTACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCa < 1:682768/101‑1 (MQ=255) aTACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCa < 2:682653/101‑1 (MQ=255) tACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAg < 2:682660/101‑1 (MQ=255) acaacaCCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGa < 2:682692/101‑1 (MQ=255) caacaCCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGAt > 1:683331/1‑101 (MQ=255) aacaCCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTg > 1:683334/1‑69 (MQ=255) cccTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCa > 1:683339/1‑101 (MQ=255) cTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCAtt < 2:682858/101‑1 (MQ=255) cTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCAtt > 2:683341/1‑101 (MQ=255) gACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGa > 2:683346/1‑101 (MQ=255) aCATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGAc > 1:683348/1‑101 (MQ=255) aTCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGt > 1:683353/1‑101 (MQ=255) tCCAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTg > 1:683356/1‑101 (MQ=255) ccAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGc > 2:683361/1‑101 (MQ=255) ccAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGc < 1:682455/101‑1 (MQ=255) ccAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGc > 1:683360/1‑101 (MQ=255) cAGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCt < 1:682773/101‑1 (MQ=255) aGCCTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCtg < 2:682889/101‑1 (MQ=255) ccTGCTGTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCtggt < 2:682873/101‑1 (MQ=255) ctgctgTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCtggtg < 1:682844/101‑1 (MQ=255) ctgctgTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCtggtg > 1:683366/1‑101 (MQ=255) tgctgTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCtggtgg < 1:683163/101‑1 (MQ=255) tgctgTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCtggtgg < 2:682839/101‑1 (MQ=255) gctgTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCtggtg > 2:683369/1‑99 (MQ=255) tgTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGccc < 1:682712/42‑1 (MQ=255) gTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGga < 1:682828/101‑1 (MQ=255) gTTAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGga > 2:683374/1‑101 (MQ=255) ttAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGgag > 1:683376/1‑101 (MQ=255) ttAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGgag < 1:682872/101‑1 (MQ=255) ttAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGgag > 2:683378/1‑101 (MQ=255) tAACCATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGgaga < 2:682825/101‑1 (MQ=255) ccATAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGGAGAAAc > 1:683384/1‑101 (MQ=255) aTAGTGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGGAGAAACTc < 2:683012/101‑1 (MQ=255) | GTTGCGCTGTACTGTGCGCGCAACGACATTTTGTCCGAGTCGTGAGGTACTGAAATGGCAATACAACACCCTGACATCCAGCCTGCTGTTAACCATAGCGTTCAGGTGGCGATCGCTGGTGCCGGCCCGGTTGGGCTGATGATGGCGAACTATCTCGGCCAGATGGGCATTGACGTGCTGGTGGTGGAGAAACTC > NC_000913/368557‑368751 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |