| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,734,355 | G→A | P212P (CCG→CCA) | xylH → | xylose ABC transporter membrane subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,734,355 | 0 | G | A | 99.7% | 1218.0 / ‑4.3 | 284 | P212P (CCG→CCA) | xylH | xylose ABC transporter membrane subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (149/134); total (149/135) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.79e-01 | |||||||||||
Only 100 of 284 total aligned reads displayed.
AGTACCGGCTTCATCATTGGCGCGCTTGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCGGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTGGCTGTTGAATGATTACCGTGGCGTTCCCACTCCTG > NC_000913/3734257‑3734452 | aGTACCGGCTTCATCATTGGCGCGCTTGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGc < 2:6942045/101‑1 (MQ=255) tACCGGCTTCATCATTGGCGCGCTTGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCct > 1:6942359/1‑101 (MQ=255) tACCGGCTTCATCATTGGCGCGCTTGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCct < 2:6941792/101‑1 (MQ=255) aCCGGCTTCATCATTGGCGCGCTTGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCctc > 1:6942362/1‑101 (MQ=255) aCCGGCTTCATCATTGGCGCGCTTGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCctc > 2:6942364/1‑101 (MQ=255) ccGGCTTCATCATTGGCGCGCTTGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCctct > 1:6942366/1‑101 (MQ=255) ggCTTCATCATTGGCGCGCTTGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTAc < 1:6941657/101‑1 (MQ=255) ggCTTCATCATTGGCGCGCTTGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTAc > 2:6942368/1‑101 (MQ=255) cTTCATCATTGGCGCGCTTGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCg < 1:6941820/101‑1 (MQ=255) cTTCATCATTGGCGCGCTTGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCg > 1:6942372/1‑101 (MQ=255) ttCATCATTGGCGCGCTTGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGc > 2:6942373/1‑101 (MQ=255) tcatcaTTGGCGCGCTTGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCa < 2:6941939/101‑1 (MQ=255) catcatTGGCGCGCTTGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCag > 2:6942378/1‑101 (MQ=255) atcatTGGCGCGCTTGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCagt > 1:6942379/1‑101 (MQ=255) tcatTGGCGCGCTTGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCagta < 2:6941833/101‑1 (MQ=255) tcatTGGCGCGCTTGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCagta < 1:6941975/101‑1 (MQ=255) tcatTGGCGCGCTTGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCagta > 2:6942383/1‑101 (MQ=255) atTGGCGCGCTTGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCagtagt < 2:6941942/101‑1 (MQ=255) atTGGCGCGCTTGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCagtagt > 1:6942387/1‑101 (MQ=255) ttGGCGCGCTTGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAgtc < 2:6942056/101‑1 (MQ=255) ttGGCGCGCTTGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAgtc > 2:6942388/1‑101 (MQ=255) ttGGCGCGCTTGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAgtc < 1:6941567/101‑1 (MQ=255) tGGCGCGCTTGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAgtcg < 1:6941943/101‑1 (MQ=255) cgcgcTTGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAgtcggtc > 2:6942393/1‑101 (MQ=255) cgcTTGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGc > 1:6942397/1‑101 (MQ=255) cgcTTGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGc > 2:6942396/1‑101 (MQ=255) cTTGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCa > 1:6942399/1‑101 (MQ=255) cTTGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCa < 2:6942173/101‑1 (MQ=255) ttGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAg < 1:6941794/101‑1 (MQ=255) tGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAgg < 1:6942093/101‑1 (MQ=255) tGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAgg < 1:6942039/101‑1 (MQ=255) ggCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGc > 1:6942404/1‑101 (MQ=255) gCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCt > 2:6942406/1‑101 (MQ=255) ttAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGcc < 2:6941885/94‑1 (MQ=255) ttAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCttt < 2:6941918/101‑1 (MQ=255) tAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTa > 1:6942410/1‑101 (MQ=255) aTGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAAc > 1:6942413/1‑101 (MQ=255) aTGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAAc < 2:6942031/101‑1 (MQ=255) tGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAAcc < 1:6941831/101‑1 (MQ=255) tGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAAcc < 1:6941865/101‑1 (MQ=255) cTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCt < 2:6941757/101‑1 (MQ=255) ttttGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTa < 1:6941896/101‑1 (MQ=255) ttttGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTa > 2:6942415/1‑101 (MQ=255) tttGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTat < 2:6941866/101‑1 (MQ=255) ttgttgGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTatc < 1:6941958/101‑1 (MQ=255) ttggttggCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTatcatc < 2:6942068/101‑1 (MQ=255) ttggttggCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTatcatc > 2:6942420/1‑101 (MQ=255) tggttggCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCg > 1:6942423/1‑101 (MQ=255) gttggCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTa < 2:6941878/101‑1 (MQ=255) gttggCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTa < 1:6941842/101‑1 (MQ=255) gttggCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTa > 2:6942426/1‑101 (MQ=255) ttggCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTa < 2:6942017/92‑1 (MQ=255) ttggCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTAt > 1:6942427/1‑101 (MQ=255) ggCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTa < 1:6941747/101‑1 (MQ=255) gCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAg > 2:6942431/1‑101 (MQ=255) gCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAg > 1:6942433/1‑101 (MQ=255) gCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAg < 2:6941902/101‑1 (MQ=255) cAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAgg < 1:6941971/101‑1 (MQ=255) aaTGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGgc > 1:6942436/1‑101 (MQ=255) tGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGgcgc < 1:6941914/101‑1 (MQ=255) ggCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCa > 2:6942439/1‑101 (MQ=255) cgcgGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAgg > 1:6942441/1‑95 (MQ=255) gcgGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATc > 2:6942443/1‑101 (MQ=255) cgGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCt < 1:6942032/101‑1 (MQ=255) cgGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCt < 2:6941924/101‑1 (MQ=255) ggAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTg > 1:6942447/1‑101 (MQ=255) gaagaaTGCGCCGTCAGTCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCt < 1:6942014/99‑1 (MQ=255) gaagaaTGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTgg > 1:6942452/1‑101 (MQ=255) gaagaaTGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTgg > 2:6942450/1‑101 (MQ=255) aagaaTGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTGGc < 1:6941967/101‑1 (MQ=255) gaaTGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTGGCTg < 1:6941855/101‑1 (MQ=255) gaaTGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTGGCTg > 2:6942456/1‑101 (MQ=255) tGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTGGCTGTTg > 1:6942460/1‑101 (MQ=255) tGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTGGCTGTTg > 2:6942461/1‑101 (MQ=255) gcgcCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCt < 2:6941501/92‑1 (MQ=255) cgcCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCagt > 2:6942465/1‑44 (MQ=255) gcCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTGGCTGTTGAAt > 1:6942466/1‑101 (MQ=255) ccGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTGGCTGTTGAATg < 1:6941991/101‑1 (MQ=255) ccGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTGGCTGTTGAATg > 2:6942469/1‑101 (MQ=255) cGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTGGCTGTTGAATGa > 1:6942473/1‑101 (MQ=255) tCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTGGCTGTTGAATGAtt > 2:6942475/1‑101 (MQ=255) aGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCt > 1:6942480/1‑62 (MQ=255) aGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTGGCTGTTGAATGATTAc > 2:6942478/1‑101 (MQ=255) aGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTGGCTGTTGAATGATTAc < 1:6942054/101‑1 (MQ=255) gCTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTGGCTGTTGAATGATTACCg > 1:6942483/1‑101 (MQ=255) cTTTGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTGGCTGTTGAATGATTACCGt < 2:6942297/101‑1 (MQ=255) ttGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTGGCTGTTGAATGATTACCGTgg > 2:6942488/1‑101 (MQ=255) ttGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTGGCTGTTGAATGATTACCGTgg > 1:6942489/1‑101 (MQ=255) tGGGTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTGGCTGTTGAATGATTACCGTGGc < 2:6942109/101‑1 (MQ=255) gggTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTGGCTGTTGAATGATTACCGTGGCg < 2:6942245/101‑1 (MQ=255) gTTTACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTGGCTGTTGAATGATTACCGTGGCGtt < 2:6941994/101‑1 (MQ=255) tttACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTGGCTGTTGAATGATTACCGTGGCGTTc > 1:6942494/1‑101 (MQ=255) ttACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTGGCTGTTGAATGATTACCGTGGCGTTcc < 2:6942131/101‑1 (MQ=255) tACAGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTGGCTGTTGAATGATTACCGTGGCGTTccc > 2:6942496/1‑101 (MQ=255) aGTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTGGCTGTTGAATGATTACCGTGGCGTTCCCACt < 1:6942239/101‑1 (MQ=255) gTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTGGCTGTTGAATGATTACCGTGGCGTTCCCACTc > 2:6942500/1‑101 (MQ=255) gTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTGGCTGTTGAATGATTACCGTGGCGTTCCCACTc > 1:6942501/1‑101 (MQ=255) gTCTCCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTGGCTGTTGAATGATTACCGTGGCGTTCCCACTc < 1:6941762/101‑1 (MQ=255) ctcCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTGGCTGTTGAATGATTACCGTGGCGTTCCCACTCCt > 1:6942504/1‑101 (MQ=255) tcCAGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTGGCTGTTGAATGATTACCGTGGCGTTCCCACTCCTg < 1:6942142/101‑1 (MQ=255) | AGTACCGGCTTCATCATTGGCGCGCTTGGCTTAATGGCTTTTGTTGGTTGGCAATGGCGCGGAAGAATGCGCCGTCAGGCTTTGGGTTTACAGTCTCCGGCCTCTACCGCAGTAGTCGGTCGCCAGGCTTTAACCGCTATCATCGTATTAGGCGCAATCTGGCTGTTGAATGATTACCGTGGCGTTCCCACTCCTG > NC_000913/3734257‑3734452 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |