Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_000913 803,662 C→A L54I (CTT→ATT)  ybhJ → putative hydratase YbhJ

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_000913803,6620CA100.0% 292.3 / NA 76L54I (CTT→ATT) ybhJputative hydratase YbhJ
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base A (28/48);  total (28/48)

AAAGGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAACTTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGT  >  NC_000913/803602‑803717
                                                            |                                                       
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 aaGGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATaaaattaaaatt                                                 >  1:1736201/1‑68 (MQ=255)
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     cACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGt                                             <  1:2991642/68‑1 (MQ=255)
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         aTTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGa                                         <  1:1652085/68‑1 (MQ=255)
            gCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTc                                      <  1:3074422/68‑1 (MQ=255)
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              cTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCAt                                    >  1:1792653/1‑68 (MQ=255)
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                ggTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTa                                  >  1:233736/1‑68 (MQ=255)
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                  tCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGc                                >  1:330006/1‑68 (MQ=255)
                  tCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGc                                >  1:2855940/1‑68 (MQ=255)
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                   cTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGcc                               <  1:1171208/68‑1 (MQ=255)
                    tATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                              <  1:510817/68‑1 (MQ=255)
                       tctctcTTCGCATAATACGTCCGGCAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCctctg                           >  1:2973285/1‑67 (MQ=255)
                       tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCtctc                           >  1:2553504/1‑68 (MQ=255)
                       tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCtctc                           >  1:2040023/1‑68 (MQ=255)
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                                                            |                                                       
AAAGGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAACTTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGT  >  NC_000913/803602‑803717

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: