Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_000913 803,662 C→A L54I (CTT→ATT)  ybhJ → putative hydratase YbhJ

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_000913803,6620CA100.0% 268.2 / NA 70L54I (CTT→ATT) ybhJputative hydratase YbhJ
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base A (31/39);  total (31/39)

AAAGGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAACTTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGT  >  NC_000913/803602‑803717
                                                            |                                                       
aaaGGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTaa                                                     >  1:21111/1‑65 (MQ=255)
 aaGGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTaaa                                                    >  1:1199472/1‑65 (MQ=255)
 aaGGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTAGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTaaa                                                    >  1:3074458/1‑65 (MQ=255)
   ggCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGAtaaaattaaaat                                                  >  1:1719827/1‑65 (MQ=255)
      aCTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAaattaaaattaa                                               >  1:361071/1‑65 (MQ=255)
      aCTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAaattaaaattaa                                               >  1:874008/1‑65 (MQ=255)
        cagtGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGt                                             <  1:2969070/62‑1 (MQ=255)
           tGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTg                                          >  1:825048/1‑65 (MQ=255)
             ccTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGAt                                        >  1:2923436/1‑65 (MQ=255)
              cTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGAtt                                       >  1:580059/1‑65 (MQ=255)
              cTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGAtt                                       >  1:5252/1‑65 (MQ=255)
              cTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGAtt                                       >  1:494743/1‑65 (MQ=255)
                ggTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCa                                     >  1:3177040/1‑65 (MQ=255)
                  tCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCAtt                                   >  1:2986893/1‑65 (MQ=255)
                  tCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCAtt                                   >  1:183385/1‑65 (MQ=255)
                  tCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCAtt                                   >  1:764163/1‑65 (MQ=255)
                       tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                              >  1:2411532/1‑65 (MQ=255)
                       tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                              >  1:496212/1‑65 (MQ=255)
                       tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                              >  1:702194/1‑65 (MQ=255)
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                        ctctctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCctc                             <  1:1416270/65‑1 (MQ=255)
                          ctctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCtctc                           >  1:2261502/1‑65 (MQ=255)
                             ttCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACg                        <  1:2141102/65‑1 (MQ=255)
                              tCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGa                       <  1:2015067/65‑1 (MQ=255)
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                               cGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGat                      <  1:60892/65‑1 (MQ=255)
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                                 cATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGatat                    >  1:2781619/1‑65 (MQ=255)
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                                         gTCCGGAAATATGGATAAAATTAACATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTttg            <  1:2809222/65‑1 (MQ=255)
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                                                            |                                                       
AAAGGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAACTTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGT  >  NC_000913/803602‑803717

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: