Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_000913 803,662 C→A L54I (CTT→ATT)  ybhJ → putative hydratase YbhJ

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_000913803,6620CA100.0% 321.7 / NA 84L54I (CTT→ATT) ybhJputative hydratase YbhJ
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base A (36/48);  total (36/48)

GGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAACTTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGT  >  NC_000913/803605‑803717
                                                         |                                                       
ggCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGAtaaaattaaaat                                                  <  1:254131/65‑1 (MQ=255)
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     tATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGt                                             <  1:383478/65‑1 (MQ=255)
        tGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTg                                          >  1:1941246/1‑65 (MQ=255)
        tGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTg                                          >  1:2904675/1‑65 (MQ=255)
           cTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGAtt                                       >  1:2088887/1‑65 (MQ=255)
           cTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGAtt                                       >  1:2030559/1‑65 (MQ=255)
           cTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGAtt                                       >  1:685872/1‑65 (MQ=255)
           cTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGAtt                                       >  1:2363927/1‑65 (MQ=255)
           cTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGAtt                                       >  1:434498/1‑65 (MQ=255)
             gtgcTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCa                                     <  1:1461639/62‑1 (MQ=255)
             ggTCTATTCTCTCTTCGCGTAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCa                                     <  1:353668/65‑1 (MQ=255)
             ggTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCa                                     >  1:984418/1‑65 (MQ=255)
             ggTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCa                                     >  1:2191017/1‑65 (MQ=255)
             ggTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCa                                     >  1:2825922/1‑65 (MQ=255)
             ggTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCa                                     >  1:3066126/1‑65 (MQ=255)
             ggTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCa                                     >  1:1579926/1‑65 (MQ=255)
             ggTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCa                                     >  1:12823/1‑65 (MQ=255)
               tCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAACATTAAAATTAAGTTTGATTCAtt                                   >  1:2214777/1‑65 (MQ=255)
               tCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCAtt                                   >  1:2921558/1‑65 (MQ=255)
               tCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCAtt                                   >  1:408665/1‑65 (MQ=255)
                  aTTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGc                                <  1:1877685/65‑1 (MQ=255)
                  aTTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGc                                <  1:685787/65‑1 (MQ=255)
                   ttCTCGCGTCGCATAATACGTCCGGAAAGATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGcc                               <  1:2125095/65‑1 (MQ=255)
                    tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                              >  1:3267530/1‑65 (MQ=255)
                    tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                              >  1:387635/1‑65 (MQ=255)
                    tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                              >  1:639947/1‑65 (MQ=255)
                    tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                              >  1:2381801/1‑65 (MQ=255)
                    tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                              >  1:704338/1‑65 (MQ=255)
                    tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                              >  1:2889878/1‑65 (MQ=255)
                    tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                              >  1:1535873/1‑65 (MQ=255)
                    tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                              >  1:1810888/1‑65 (MQ=255)
                    tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                              >  1:1496353/1‑65 (MQ=255)
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                     ctctctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCctc                             <  1:3084457/65‑1 (MQ=255)
                     ctctctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCctc                             <  1:1486397/65‑1 (MQ=255)
                       ctctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCtctc                           >  1:1982310/1‑65 (MQ=255)
                         ctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCAc                         >  1:44932/1‑65 (MQ=255)
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                           tCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGa                       <  1:189142/65‑1 (MQ=255)
                           gcGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGa                       <  1:74259/64‑1 (MQ=255)
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                                             aaTATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTATTGGTAt     <  1:3211587/65‑1 (MQ=255)
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                                                         |                                                       
GGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAACTTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGT  >  NC_000913/803605‑803717

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: