Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_000913 803,662 C→A L54I (CTT→ATT)  ybhJ → putative hydratase YbhJ

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_000913803,6620CA100.0% 288.1 / NA 75L54I (CTT→ATT) ybhJputative hydratase YbhJ
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base A (30/45);  total (30/45)

CCAAAAAAGGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAACTTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGACCGC  >  NC_000913/803597‑803726
                                                                  |                                                                
ccAAAAAAGGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAAtt                                                                >  1:536597/1‑68 (MQ=255)
ccAAAAAAGGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAAtt                                                                >  1:1466296/1‑68 (MQ=255)
    aaaaGGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTaaaa                                                            <  1:276916/68‑1 (MQ=255)
      aaGGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATaaaattaaaatt                                                          >  1:2405829/1‑68 (MQ=255)
          cACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGt                                                      >  1:2647085/1‑68 (MQ=255)
          cACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGt                                                      <  1:1393658/68‑1 (MQ=255)
                tGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGAtt                                                >  1:1044354/1‑68 (MQ=255)
                 gCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTc                                               <  1:1014343/68‑1 (MQ=255)
                 gCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTc                                               <  1:2248442/68‑1 (MQ=255)
                  ccTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCa                                              <  1:1890268/68‑1 (MQ=255)
                  ccTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCa                                              <  1:3333318/68‑1 (MQ=255)
                  ccTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCa                                              <  1:3224038/68‑1 (MQ=255)
                   cTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCAt                                             <  1:2256065/68‑1 (MQ=255)
                   cTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCAt                                             >  1:2172792/1‑68 (MQ=255)
                   cTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCAt                                             >  1:2708582/1‑68 (MQ=255)
                   cTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCAt                                             >  1:1524477/1‑68 (MQ=255)
                     ggTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTa                                           >  1:1098089/1‑68 (MQ=255)
                       tCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGc                                         >  1:3112738/1‑68 (MQ=255)
                       tCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGc                                         >  1:2065042/1‑68 (MQ=255)
                       tCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGc                                         >  1:467451/1‑68 (MQ=255)
                       tCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGc                                         >  1:1786276/1‑68 (MQ=255)
                       tCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGc                                         <  1:1175575/68‑1 (MQ=255)
                        cTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGcc                                        <  1:223507/68‑1 (MQ=255)
                          aTTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCctc                                      <  1:2831140/68‑1 (MQ=255)
                           ttCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCctct                                     <  1:393600/68‑1 (MQ=255)
                           ttCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCctct                                     <  1:2493097/68‑1 (MQ=255)
                            tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCtctc                                    >  1:3230040/1‑68 (MQ=255)
                            tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCtctc                                    >  1:1141118/1‑68 (MQ=255)
                            tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCtctc                                    >  1:849806/1‑68 (MQ=255)
                            tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCtctc                                    >  1:1238363/1‑68 (MQ=255)
                            tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCtctc                                    >  1:1868927/1‑68 (MQ=255)
                            tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCtctc                                    >  1:1576953/1‑68 (MQ=255)
                               ctctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACg                                 <  1:1933981/68‑1 (MQ=255)
                               ctctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACg                                 <  1:1848441/68‑1 (MQ=255)
                               ctctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACg                                 <  1:3134453/68‑1 (MQ=255)
                               ctctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACg                                 >  1:3355252/1‑68 (MQ=255)
                                tctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGa                                <  1:2894596/68‑1 (MQ=255)
                                 ctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAGAATTAAGTTTGATTCATTCGCCTCTCACGat                               >  1:203965/1‑68 (MQ=255)
                                 ctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGat                               <  1:982194/68‑1 (MQ=255)
                                 ctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGat                               <  1:2416866/68‑1 (MQ=255)
                                 ctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGat                               >  1:825856/1‑68 (MQ=255)
                                 ctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGat                               <  1:3215011/68‑1 (MQ=255)
                                 ctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGat                               <  1:136732/68‑1 (MQ=255)
                                 ctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGat                               <  1:141834/68‑1 (MQ=255)
                                 ctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATCAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGat                               <  1:959135/68‑1 (MQ=255)
                                 cagcGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGat                               <  1:1190867/65‑1 (MQ=255)
                                       ataataCGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTAcc                         <  1:2153692/68‑1 (MQ=255)
                                       ataataCGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTAcc                         <  1:2534867/68‑1 (MQ=255)
                                          ataCGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCttt                      >  1:2876569/1‑68 (MQ=255)
                                           taCGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTttg                     >  1:2209381/1‑68 (MQ=255)
                                           taCGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTttg                     <  1:2550204/68‑1 (MQ=255)
                                            aCGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTttgt                    >  1:1018128/1‑68 (MQ=255)
                                            aCGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTttgt                    >  1:2283025/1‑68 (MQ=255)
                                            aCGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTttgt                    >  1:2009988/1‑68 (MQ=255)
                                             cGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTttgtt                   >  1:1665307/1‑68 (MQ=255)
                                             cGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTttgtt                   >  1:1281424/1‑68 (MQ=255)
                                                ccGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTGCCTTTGTTGGt                <  1:1289746/68‑1 (MQ=255)
                                                ccGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGt                <  1:2931314/68‑1 (MQ=255)
                                                ccGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGt                <  1:3016737/68‑1 (MQ=255)
                                                ccGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGt                <  1:1590815/68‑1 (MQ=255)
                                                ccGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGt                <  1:3175378/68‑1 (MQ=255)
                                                ccGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGt                <  1:609918/68‑1 (MQ=255)
                                                ccGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGt                <  1:1735040/68‑1 (MQ=255)
                                                ccGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGt                <  1:2047617/68‑1 (MQ=255)
                                                  ggAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTAt              <  1:857191/68‑1 (MQ=255)
                                                    aaaTATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTg            >  1:1422984/1‑68 (MQ=255)
                                                     aaaatGGATTAAAATTAAATTTAATTTGAATCAATAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt           <  1:447644/65‑1 (MQ=255)
                                                     aaTATGGATAAAATTAAAATTAATTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt           <  1:2167495/68‑1 (MQ=255)
                                                     aaTATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt           <  1:1277347/68‑1 (MQ=255)
                                                     aaTATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt           <  1:2639669/68‑1 (MQ=255)
                                                     aaTATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt           <  1:3179415/68‑1 (MQ=255)
                                                     aaTATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt           <  1:1155063/68‑1 (MQ=255)
                                                     aaTATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt           <  1:838985/68‑1 (MQ=255)
                                                     aaTATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt           <  1:1148295/68‑1 (MQ=255)
                                                     aaTATGGATAAAATCAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATGTTACCTTTGTTGGTATTGt           <  1:479872/68‑1 (MQ=255)
                                                      atatGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTa          >  1:1624800/1‑68 (MQ=255)
                                                          ggATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGa      <  1:74858/68‑1 (MQ=255)
                                                            aTAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTGCCTTTGTTGGTATTGTACAGAcc    <  1:241580/68‑1 (MQ=255)
                                                            aTAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGAcc    <  1:2692614/68‑1 (MQ=255)
                                                            aTAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGAcc    <  1:1281419/68‑1 (MQ=255)
                                                            aTAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGAcc    <  1:1630577/68‑1 (MQ=255)
                                                               aaaattaaaattAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGACCGc  <  1:89213/68‑1 (MQ=255)
                                                                  |                                                                
CCAAAAAAGGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAACTTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGACCGC  >  NC_000913/803597‑803726

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: