Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_000913 803,662 C→A L54I (CTT→ATT)  ybhJ → putative hydratase YbhJ

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_000913803,6620CA100.0% 381.6 / NA 101L54I (CTT→ATT) ybhJputative hydratase YbhJ
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base A (41/60);  total (41/60)

Only 100 of 109 total aligned reads displayed.

AAGGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAACTTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGT  >  NC_000913/803603‑803717
                                                           |                                                       
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     aCTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAaattaaaattaa                                               >  1:2105241/1‑65 (MQ=255)
     aCTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAaattaaaattaa                                               >  1:340477/1‑65 (MQ=255)
     aCTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAaattaaaattaa                                               >  1:1415267/1‑65 (MQ=255)
          tGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTg                                          <  1:2417218/65‑1 (MQ=255)
             cTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGAtt                                       >  1:3393023/1‑65 (MQ=255)
             cTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGAtt                                       >  1:1628764/1‑65 (MQ=255)
              tGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTc                                      <  1:2289878/65‑1 (MQ=255)
              tGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTc                                      <  1:2990628/65‑1 (MQ=255)
              gagTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTc                                      <  1:2721864/63‑1 (MQ=255)
               ggTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCa                                     <  1:373505/65‑1 (MQ=255)
               ggTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCa                                     <  1:2412927/65‑1 (MQ=255)
               ggTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCa                                     >  1:4004481/1‑65 (MQ=255)
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               ggTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCa                                     >  1:1097551/1‑65 (MQ=255)
                 tCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTcctg                                   >  1:2781497/1‑62 (MQ=255)
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                     ttCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGcc                               <  1:81608/65‑1 (MQ=255)
                      tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                              >  1:1603992/1‑65 (MQ=255)
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                      tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                              >  1:3483378/1‑65 (MQ=255)
                      tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                              >  1:2875159/1‑65 (MQ=255)
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                      tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                              >  1:2354065/1‑65 (MQ=255)
                      tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                              >  1:590540/1‑65 (MQ=255)
                      tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                              >  1:3877947/1‑65 (MQ=255)
                      tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                              >  1:1075414/1‑65 (MQ=255)
                      tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                              >  1:1025653/1‑65 (MQ=255)
                      tctctcTTCGCAAAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                              >  1:1234454/1‑65 (MQ=255)
                       gtctctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCctc                             >  1:4302737/2‑65 (MQ=255)
                       ctctctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCctc                             <  1:2283730/65‑1 (MQ=255)
                       ctctctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCctc                             <  1:2928966/65‑1 (MQ=255)
                       ctctctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCctc                             >  1:2301945/1‑65 (MQ=255)
                       ctctctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCctc                             <  1:1212247/65‑1 (MQ=255)
                       ctctctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCctc                             <  1:1392959/65‑1 (MQ=255)
                       ctctctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCctc                             <  1:1451488/65‑1 (MQ=255)
                        tctctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCctct                            <  1:4038337/65‑1 (MQ=255)
                         ctctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCtctc                           >  1:232831/1‑65 (MQ=255)
                         ctctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCtctc                           >  1:1963488/1‑65 (MQ=255)
                         ctctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCtctc                           >  1:662841/1‑65 (MQ=255)
                         ctctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCtctc                           >  1:1568161/1‑65 (MQ=255)
                           ctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCAc                         >  1:926306/1‑65 (MQ=255)
                           ctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCAc                         >  1:147753/1‑65 (MQ=255)
                            ttCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACg                        <  1:613491/65‑1 (MQ=255)
                             tCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGa                       >  1:813963/1‑65 (MQ=255)
                             tCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGa                       <  1:1081152/65‑1 (MQ=255)
                              cGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGat                      <  1:2062551/65‑1 (MQ=255)
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                              cGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGat                      <  1:320144/65‑1 (MQ=255)
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                                             gAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGt       <  1:107181/65‑1 (MQ=255)
                                             gAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGt       <  1:857817/65‑1 (MQ=255)
                                             gAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGt       <  1:2718930/65‑1 (MQ=255)
                                             gAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGt       <  1:197632/65‑1 (MQ=255)
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                                             gAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGt       <  1:3596801/65‑1 (MQ=255)
                                             gAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGt       <  1:1489203/65‑1 (MQ=255)
                                               aaTATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTAt     <  1:1078529/65‑1 (MQ=255)
                                               aaTATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTAt     <  1:4422190/65‑1 (MQ=255)
                                               aaTATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCGTTGTTGGTAt     <  1:1227517/65‑1 (MQ=255)
                                               aaTATAGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTAt     >  1:2543049/1‑65 (MQ=255)
                                                 tatGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTg   <  1:1945567/65‑1 (MQ=255)
                                                 tatGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTg   <  1:861835/65‑1 (MQ=255)
                                                  ctGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt  <  1:3126077/64‑1 (MQ=255)
                                                  atGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCGCGATATTACCTTTGTTGGTATTGt  <  1:2954905/65‑1 (MQ=255)
                                                  atGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt  <  1:161890/65‑1 (MQ=255)
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                                                  atGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt  <  1:1763413/65‑1 (MQ=255)
                                                  atGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt  <  1:4236965/65‑1 (MQ=255)
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                                                  atGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt  <  1:3319023/65‑1 (MQ=255)
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                                                  atGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt  <  1:2066597/65‑1 (MQ=255)
                                                  atGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt  <  1:3730983/65‑1 (MQ=255)
                                                  atGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt  <  1:427916/65‑1 (MQ=255)
                                                           |                                                       
AAGGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAACTTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGT  >  NC_000913/803603‑803717

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑