| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | 68 (1.270) | 32/134 | 0.1 | 57.1% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3844020 | 51 (0.960) | coding (57/1767 nt) | adeD | adenine deaminase | |||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
TGAGAAAAATATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTGTTAGCCGTTTCCCGTGGCGACGCTGTTGCCGATTATATTATTGATAATGTCTCTATTCTCGAC > NC_000913/3843954‑3844086 | tGAGAAAAATATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCAGATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAg > 1:1634151‑M2/1‑67 (MQ=255)tGAGAAAAATATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAt < 1:2075777/68‑1 (MQ=255)tGAGAAAAATATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAt < 1:2943857/68‑1 (MQ=255)tGAGAAAAATATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAg < 1:1758195‑M2/68‑2 (MQ=255) agaAAAATATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAggt > 1:483356‑M2/1‑65 (MQ=255) agaAAAATATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAATTg < 1:1171381/68‑1 (MQ=255) aaaaaTATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACTAGGAAggtga < 1:1132007‑M2/68‑6 (MQ=255) aaTATGAATAATTCTATTAACCATAAATTTCATCACATTAGCCGGGCTGAATACCAGGAAggtgatgc > 1:3018478‑M2/1‑60 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |