BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_000913	803,662	C→A	L54I (CTT→ATT)	ybhJ →	putative hydratase YbhJ

Read alignment evidence...
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*	NC_000913	803,662	0	C	A	100.0%	409.9 / NA	106	L54I (CTT→ATT)	ybhJ	putative hydratase YbhJ
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (42/64); total (42/64)

Only 100 of 115 total aligned reads displayed.

AAAGGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAACTTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGA  >  NC_000913/803602‑803722

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 aaGGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTaaa                                                         <  1:51412/65‑1 (MQ=255)

  aGGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTaaaa                                                        >  1:526352/1‑65 (MQ=255)

       cTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAg                                                   >  1:2968572/1‑65 (MQ=255)

         aTTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGtt                                                 >  1:1617403/1‑65 (MQ=255)

              cTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGAtt                                            >  1:1041494/1‑65 (MQ=255)

              cTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGAtt                                            >  1:1730438/1‑65 (MQ=255)

              cTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGAtt                                            >  1:3434227/1‑65 (MQ=255)

              cTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGAtt                                            >  1:3607247/1‑65 (MQ=255)

              cTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGCTTGAtt                                            >  1:444580/1‑65 (MQ=255)

               tGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAGAATTAAGTTTGATTc                                           <  1:3033966/65‑1 (MQ=255)

               tGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTc                                           <  1:131955/65‑1 (MQ=255)

               gggTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTc                                           <  1:2712331/64‑1 (MQ=255)

                ggTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAACATTAAGTTTGATTCa                                          >  1:3464189/1‑65 (MQ=255)

                ggTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCa                                          <  1:162432/65‑1 (MQ=255)

                ggTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCa                                          >  1:28131/1‑65 (MQ=255)

                ggTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCa                                          >  1:792828/1‑65 (MQ=255)

                ggTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCa                                          <  1:3024877/65‑1 (MQ=255)

                ggTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCa                                          >  1:2056785/1‑65 (MQ=255)

                ggTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCa                                          <  1:3235546/65‑1 (MQ=255)

                ggTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCa                                          <  1:1475641/65‑1 (MQ=255)

                ggTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCa                                          >  1:1343734/1‑65 (MQ=255)

                  tCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCAtt                                        >  1:2290129/1‑65 (MQ=255)

                  tCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCAtt                                        >  1:1775595/1‑65 (MQ=255)

                  tCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCAtt                                        >  1:2806356/1‑65 (MQ=255)

                   cTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTa                                       >  1:1686501/1‑65 (MQ=255)

                       tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATGAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                                   >  1:3185543/1‑65 (MQ=255)

                       tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                                   >  1:1055733/1‑65 (MQ=255)

                       tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                                   >  1:2749095/1‑65 (MQ=255)

                       tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                                   >  1:2887652/1‑65 (MQ=255)

                       tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                                   >  1:2948283/1‑65 (MQ=255)

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                       tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                                   >  1:559981/1‑65 (MQ=255)

                       tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                                   >  1:3172197/1‑65 (MQ=255)

                       tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                                   >  1:3222037/1‑65 (MQ=255)

                       tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                                   >  1:3646296/1‑65 (MQ=255)

                       tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                                   >  1:181255/1‑65 (MQ=255)

                       tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                                   >  1:1185358/1‑65 (MQ=255)

                       tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                                   >  1:2021033/1‑65 (MQ=255)

                       tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                                   >  1:1682092/1‑65 (MQ=255)

                       tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                                   >  1:1828538/1‑65 (MQ=255)

                       tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                                   >  1:2355734/1‑65 (MQ=255)

                       tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                                   >  1:1333022/1‑65 (MQ=255)

                        ctctctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCctc                                  <  1:2471615/65‑1 (MQ=255)

                         tctctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCctct                                 <  1:2051632/65‑1 (MQ=255)

                         tctctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCctct                                 <  1:304862/65‑1 (MQ=255)

                           tctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCa                               <  1:1142593/65‑1 (MQ=255)

                           tctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCa                               <  1:3003591/65‑1 (MQ=255)

                             ttCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACg                             <  1:268601/65‑1 (MQ=255)

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                             ttCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACg                             <  1:2027621/65‑1 (MQ=255)

                             ttCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACg                             <  1:2956425/65‑1 (MQ=255)

                              tCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGa                            <  1:3111264/65‑1 (MQ=255)

                              tCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGa                            <  1:204792/65‑1 (MQ=255)

                              tCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGa                            <  1:1466250/65‑1 (MQ=255)

                              tCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGa                            <  1:2560944/65‑1 (MQ=255)

                               ggCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGat                           <  1:811757/64‑1 (MQ=255)

                               cGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGat                           <  1:1562804/65‑1 (MQ=255)

                               cGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGat                           <  1:3577731/65‑1 (MQ=255)

                               cGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGat                           <  1:649736/65‑1 (MQ=255)

                               cGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGat                           <  1:3223048/65‑1 (MQ=255)

                               cGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGat                           <  1:522972/65‑1 (MQ=255)

                               cGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGat                           <  1:1207504/65‑1 (MQ=255)

                               cGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGat                           <  1:689401/65‑1 (MQ=255)

                               cGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGat                           <  1:3034714/65‑1 (MQ=255)

                               cGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGat                           <  1:1961785/65‑1 (MQ=255)

                               cGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGat                           <  1:2700854/65‑1 (MQ=255)

                                     ataCGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTAcc                     <  1:3146818/65‑1 (MQ=255)

                                     ataCGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTAcc                     <  1:3360995/65‑1 (MQ=255)

                                     ataCGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTAcc                     >  1:830346/1‑65 (MQ=255)

                                      taCGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCt                    <  1:662585/65‑1 (MQ=255)

                                         gTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTttg                 <  1:804408/65‑1 (MQ=255)

                                           ccGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTttgtt               <  1:786106/65‑1 (MQ=255)

                                           ccGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTttgtt               <  1:3233350/65‑1 (MQ=255)

                                              gAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTGGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGt            <  1:1526006/65‑1 (MQ=255)

                                              gAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCTCGATATTACCTTTGTTGGt            <  1:444767/65‑1 (MQ=255)

                                              gAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGt            <  1:3554004/65‑1 (MQ=255)

                                              gAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGt            <  1:2650634/65‑1 (MQ=255)

                                              gAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGt            <  1:2193838/65‑1 (MQ=255)

                                              gAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGt            <  1:3065762/65‑1 (MQ=255)

                                                aaTATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTAt          <  1:896271/65‑1 (MQ=255)

                                                aaTATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTAt          <  1:1336355/65‑1 (MQ=255)

                                                aaTATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTAt          <  1:833102/65‑1 (MQ=255)

                                                  tatGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTg        <  1:3375130/65‑1 (MQ=255)

                                                  tatGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTg        >  1:1741521/1‑65 (MQ=255)

                                                   atGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt       <  1:1536929/65‑1 (MQ=255)

                                                   atGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt       <  1:934824/65‑1 (MQ=255)

                                                   atGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt       <  1:2677167/65‑1 (MQ=255)

                                                   atGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt       <  1:2794741/65‑1 (MQ=255)

                                                   atGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt       <  1:202601/65‑1 (MQ=255)

                                                   atGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt       <  1:1395302/65‑1 (MQ=255)

                                                   atGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt       <  1:1530721/65‑1 (MQ=255)

                                                   atGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt       <  1:251855/65‑1 (MQ=255)

                                                   atGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt       <  1:3293697/65‑1 (MQ=255)

                                                   atGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt       <  1:3458295/65‑1 (MQ=255)

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                                                        taaaattaaaatTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGa  <  1:650577/65‑1 (MQ=255)

                                                        taaaattaaaatTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGa  <  1:1202736/65‑1 (MQ=255)

AAAGGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAACTTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGA  >  NC_000913/803602‑803722

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 18 ≤` `ATCG/ATCG` `< 28 ≤` `ATCG/ATCG` `< 33 ≤` `ATCG/ATCG` `< 34 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`