| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,978,503 | Δ776 bp | insB‑5–insA‑5 | insB‑5, insA‑5 | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1978503–1979270 | 1979278 | 9–776 | 90 [0] | [0] 89 | insB‑5–insA‑5 | insB‑5,insA‑5 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1978502 | 0 (0.000) | 69 (1.570) | 24/112 | 0.2 | 100% | intergenic (‑305/+16) | flhD/insB‑5 | DNA‑binding transcriptional dual regulator FlhD/IS1 protein InsB |
| ? | NC_000913 | 1979279 = | 0 (0.000) | intergenic (‑64/‑474) | insA‑5/uspC | IS1 protein InsA/universal stress protein C | |||||
GCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATG > NC_000913/1978440‑1978565 | gCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGta > 1:3871892‑M1/1‑63 (MQ=255)gCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGta > 1:2059998‑M1/1‑63 (MQ=255)gCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGaa > 1:44437‑M1/1‑63 (MQ=255) gCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataa < 1:2867796‑M1/65‑6 (MQ=255) cGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataag < 1:941380‑M1/65‑7 (MQ=255) cGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataag < 1:3584716‑M1/65‑7 (MQ=255) gATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagt < 1:2888520‑M1/65‑8 (MQ=255) gATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagt < 1:1715844‑M1/65‑8 (MQ=255) gATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagt > 1:658308‑M1/1‑58 (MQ=255) cAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatact < 1:1984203‑M1/65‑14 (MQ=255) cAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatact < 1:1433760‑M1/65‑14 (MQ=255) aatGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttg > 1:3093513‑M1/1‑48 (MQ=255) aatGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttg < 1:2022796‑M1/65‑18 (MQ=255) aatGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttg > 1:3192392‑M1/1‑48 (MQ=255) aatGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttg < 1:573923‑M1/65‑18 (MQ=255) tGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgg < 1:3251279‑M1/65‑24 (MQ=255) tGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgg < 1:928369‑M1/65‑24 (MQ=255) gATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttggg < 1:3171833‑M1/65‑25 (MQ=255) gATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttggg < 1:700233‑M1/65‑25 (MQ=255) 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aGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtat < 1:1987355‑M1/65‑30 (MQ=255) tCACACAAAACACTCGATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttc > 1:1630414‑M1/1‑33 (MQ=255) tCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttc > 1:200848‑M1/1‑33 (MQ=255) tCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttc > 1:3681100‑M1/1‑33 (MQ=255) tCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttc > 1:2921484‑M1/1‑33 (MQ=255) tCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttc > 1:1954267‑M1/1‑33 (MQ=255) tCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttc > 1:55393‑M1/1‑33 (MQ=255) tCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttc > 1:140470‑M1/1‑33 (MQ=255) tCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttc > 1:616310‑M1/1‑33 (MQ=255) tCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttc > 1:1775429‑M1/1‑33 (MQ=255) tCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttc > 1:1748426‑M1/1‑33 (MQ=255) tCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttc > 1:2942215‑M1/1‑33 (MQ=255) tCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttc > 1:3997077‑M1/1‑33 (MQ=255) tCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttc > 1:2648246‑M1/1‑33 (MQ=255) tCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttc > 1:2724940‑M1/1‑33 (MQ=255) acaAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatc > 1:447955‑M1/1‑29 (MQ=255) acaAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatc > 1:242649‑M1/1‑29 (MQ=255) acaAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatc > 1:3740237‑M1/1‑29 (MQ=255) acaAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatc > 1:1346639‑M1/1‑29 (MQ=255) caAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatct > 1:2685420‑M1/1‑28 (MQ=255) caAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatct > 1:2930052‑M1/1‑28 (MQ=255) caAAACACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatct > 1:1733‑M1/1‑28 (MQ=255) aaaCACTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgt < 1:2282822‑M1/65‑40 (MQ=255) acacTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgtta > 1:3733253‑M1/1‑24 (MQ=255) acacTCAATTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgtta > 1:858962‑M1/1‑24 (MQ=255) aTTACTTAACATAAATGtataagtcatgcttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtt > 1:3933412‑M1/1‑17 (MQ=255) aTTACTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtt > 1:1755401‑M1/1‑17 (MQ=255) aCTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaacgttttt > 1:1570877‑M1/1‑14 (MQ=255) aCTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagttttt > 1:369939‑M1/1‑14 (MQ=255) aCTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagttttt > 1:3534203‑M1/1‑14 (MQ=255) aCTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagttttt > 1:882887‑M1/1‑14 (MQ=255) aCTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagttttt > 1:2965880‑M1/1‑14 (MQ=255) aCTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagttttt > 1:1930555‑M1/1‑14 (MQ=255) aCTTAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagttttt > 1:137666‑M1/1‑14 (MQ=255) ttAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcg > 1:1066406‑M1/1‑12 (MQ=255) ttAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcg > 1:3366421‑M1/1‑12 (MQ=255) ttAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcg > 1:1188974‑M1/1‑12 (MQ=255) ttAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcg > 1:1439219‑M1/1‑12 (MQ=255) ttAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcg > 1:2910834‑M1/1‑12 (MQ=255) ttAACATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcg > 1:1938105‑M1/1‑12 (MQ=255) aaCATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgct < 1:2498562‑M1/65‑56 (MQ=255) cATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctac < 1:1912630‑M1/65‑58 (MQ=255) cATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctac < 1:1339905‑M1/65‑58 (MQ=255) cATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctac < 1:1807244‑M1/65‑58 (MQ=255) cATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctac < 1:35810‑M1/65‑58 (MQ=255) cATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctac < 1:2056114‑M1/65‑58 (MQ=255) cATAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctac < 1:2355733‑M1/65‑58 (MQ=255) aTAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacg > 1:394378‑M1/1‑7 (MQ=255) aTAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacg > 1:3731364‑M1/1‑7 (MQ=255) aTAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacg > 1:1120763‑M1/1‑7 (MQ=255) aTAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacg > 1:1041733‑M1/1‑7 (MQ=255) tAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgc > 1:604334‑M1/1‑6 (MQ=255) tAAATGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgc > 1:1525915‑M1/1‑6 (MQ=255) tGtataagtcatgcttttgttttgggggtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagc > 1:508066‑M1/1‑2 (MQ=255) tGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagc > 1:2444938‑M1/1‑2 (MQ=255) tGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagc > 1:1782095‑M1/1‑2 (MQ=255) tGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagc > 1:3252079‑M1/1‑2 (MQ=255) tGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagc > 1:3280832‑M1/1‑2 (MQ=255) tGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagc > 1:1183038‑M1/1‑2 (MQ=255) tGtataagtcatacttttgttttgggtgtatttcaatctgttaaaaagtttttcgctacgctagc > 1:971901‑M1/1‑2 (MQ=255) tGtataagtcatacttttgttttgggcggatttcactctgttaaaaagtttttcgctacgctagc > 1:1570851‑M1/1‑2 (MQ=255) | GCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACACAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATG > NC_000913/1978440‑1978565 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |