BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_000913	803,662	C→A	L54I (CTT→ATT)	ybhJ →	putative hydratase YbhJ

Read alignment evidence...
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*	NC_000913	803,662	0	C	A	100.0%	383.1 / NA	100	L54I (CTT→ATT)	ybhJ	putative hydratase YbhJ
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (41/59); total (41/59)

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AAAGGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAACTTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGA  >  NC_000913/803602‑803722

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                       tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                                   >  1:407334/1‑65 (MQ=255)

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                       tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                                   >  1:640058/1‑65 (MQ=255)

                       tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                                   >  1:1121103/1‑65 (MQ=255)

                       tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGCTTGATTCATTAGcca                                   >  1:3254049/1‑64 (MQ=255)

                        ctctctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCctc                                  <  1:3063999/65‑1 (MQ=255)

                        ctctctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCctc                                  <  1:2408237/65‑1 (MQ=255)

                        ctctctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCctc                                  <  1:2318406/65‑1 (MQ=255)

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                         tctctTCGCAGAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCctct                                 <  1:873418/65‑1 (MQ=255)

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                           tctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCa                               <  1:2647175/65‑1 (MQ=255)

                            ctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCAc                              >  1:3183025/1‑65 (MQ=255)

                            ctTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCAc                              >  1:2780677/1‑65 (MQ=255)

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                             ttCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACg                             <  1:2739683/65‑1 (MQ=255)

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                               cGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGat                           <  1:1836614/65‑1 (MQ=255)

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                                     ataCGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTAcc                     <  1:1208618/65‑1 (MQ=255)

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                                         gTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTttg                 <  1:2385510/65‑1 (MQ=255)

                                         gTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTttg                 <  1:1289929/65‑1 (MQ=255)

                                           ccGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTttgtt               <  1:2221430/65‑1 (MQ=255)

                                           ccGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTttgtt               <  1:2729434/65‑1 (MQ=255)

                                              gAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGt            <  1:508131/65‑1 (MQ=255)

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                                              gAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGt            <  1:3101275/65‑1 (MQ=255)

                                              gAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGt            <  1:1889467/65‑1 (MQ=255)

                                              gAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGt            <  1:2605694/65‑1 (MQ=255)

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                                                aaTATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTAt          <  1:738707/65‑1 (MQ=255)

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                                                aaTATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTAt          <  1:405169/65‑1 (MQ=255)

                                                aaTATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTAt          <  1:1571561/65‑1 (MQ=255)

                                                 atatGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTAtt         >  1:2917039/1‑65 (MQ=255)

                                                   atGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt       <  1:1424144/65‑1 (MQ=255)

                                                   atGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt       <  1:1408038/65‑1 (MQ=255)

                                                   atGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt       <  1:401757/65‑1 (MQ=255)

                                                   atGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt       <  1:3201440/65‑1 (MQ=255)

                                                   atGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt       <  1:650624/65‑1 (MQ=255)

                                                   atGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt       <  1:670003/65‑1 (MQ=255)

                                                   atGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt       <  1:1894111/65‑1 (MQ=255)

                                                   atGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt       <  1:1980605/65‑1 (MQ=255)

                                                   atGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGt       <  1:2471437/65‑1 (MQ=255)

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                                                     ggATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTAc     >  1:871417/1‑65 (MQ=255)

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AAAGGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAACTTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGA  >  NC_000913/803602‑803722

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 17 ≤` `ATCG/ATCG` `< 27 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 34 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`