Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_000913 803,662 C→A L54I (CTT→ATT)  ybhJ → putative hydratase YbhJ

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_000913803,6620CA100.0% 316.6 / NA 83L54I (CTT→ATT) ybhJputative hydratase YbhJ
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base A (30/53);  total (30/53)

AAAGGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAACTTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGA  >  NC_000913/803602‑803722
                                                            |                                                            
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aaaGGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTaa                                                          >  1:141575/1‑65 (MQ=255)
 aaGGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTaaa                                                         >  1:1116325/1‑65 (MQ=255)
 aaGGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTaaa                                                         >  1:757423/1‑65 (MQ=255)
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  aGGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTaaaa                                                        <  1:628319/65‑1 (MQ=255)
     cACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAaaattaaaatta                                                     >  1:469459/1‑65 (MQ=255)
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        tATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGt                                                  <  1:888479/65‑1 (MQ=255)
        tATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATAGATAAAATTAAAATTAAGt                                                  <  1:1364106/65‑1 (MQ=255)
         aTTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGtt                                                 >  1:2335112/1‑65 (MQ=255)
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           tGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTg                                               <  1:237055/65‑1 (MQ=255)
           tGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTg                                               >  1:391204/1‑65 (MQ=255)
           tGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTg                                               >  1:1283863/1‑65 (MQ=255)
              cTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGAtt                                            >  1:2871884/1‑65 (MQ=255)
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                  tCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCAtt                                        >  1:62613/1‑65 (MQ=255)
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                  tCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCAtt                                        >  1:1257453/1‑65 (MQ=255)
                     aTTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGc                                     <  1:592840/65‑1 (MQ=255)
                     aTTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGc                                     <  1:1313623/65‑1 (MQ=255)
                     aTTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGc                                     <  1:2897687/65‑1 (MQ=255)
                       tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                                   >  1:2593943/1‑65 (MQ=255)
                       tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                                   >  1:2671173/1‑65 (MQ=255)
                       tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                                   >  1:2482347/1‑65 (MQ=255)
                       tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                                   >  1:2481788/1‑65 (MQ=255)
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                       tctctcTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAAATTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCct                                   >  1:467588/1‑65 (MQ=255)
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                                                            |                                                            
AAAGGCACTATTGCCTGGTCTATTCTCTCTTCGCATAATACGTCCGGAAATATGGATAAACTTAAAATTAAGTTTGATTCATTAGCCTCTCACGATATTACCTTTGTTGGTATTGTACAGA  >  NC_000913/803602‑803722

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: