| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,899,395 | IS1 (–) +9 bp | 100% | intergenic (‑2/+5) | yieK ← / ← yieL | putative glucosamine‑6‑phosphate deaminase YieK/putative hydrolase YieL |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | 110 (1.250) | 74/174 | NT | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3899395 = | 0 (0.000) | intergenic (‑2/+13) | yieK/yieL | putative glucosamine‑6‑phosphate deaminase YieK/putative hydrolase YieL | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | 98 (1.100) | 66/176 | NT | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3899403 | 0 (0.000) | intergenic (‑10/+5) | yieK/yieL | putative glucosamine‑6‑phosphate deaminase YieK/putative hydrolase YieL | |||||
Only 100 of 240 total aligned reads displayed.
ACACGACGCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATTCCTGGTAATCAAAGTTA > NC_000913/3899305‑3899501 | gaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCt < 1:1818227‑M2/9‑1 (MQ=255)gaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCt > 2:1480661‑M2/91‑99 (MQ=255) aacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCtt > 1:465907‑M2/90‑99 (MQ=255) aacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagcaagttggcagcatcaccTTAATGCCtt > 2:2275128‑M2/90‑99 (MQ=255) acaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactagatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCtta < 2:1853611‑M2/11‑1 (MQ=255) acaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCtta < 1:1032289‑M2/11‑1 (MQ=255) cgacgCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggt < 1:888639‑M2/99‑4 (MQ=255) cgacgCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggt > 1:1486034‑M2/1‑96 (MQ=255) aggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCttatt < 2:701799‑M2/13‑1 (MQ=255) aggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCttatt < 2:2236729‑M2/13‑1 (MQ=255) ggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCttattt < 1:1097669‑M2/14‑1 (MQ=255) gagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCttatttt < 1:716721‑M2/15‑1 (MQ=255) gcgTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatg < 2:1419537‑M2/99‑8 (MQ=255) 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aagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACaaa > 2:64151‑M2/63‑99 (MQ=255) cAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgtt < 1:963035‑M2/99‑30 (MQ=255) agccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAg < 2:2362859‑M2/38‑1 (MQ=255) gccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAgg > 2:1138952‑M2/61‑99 (MQ=255) cactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCt > 1:1893535‑M2/59‑99 (MQ=255) aTGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgtttta < 2:1690462‑M2/99‑33 (MQ=255) aTGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgtttta < 2:1227018‑M2/99‑33 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |