Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 3,899,395 | IS1 (–) +9 bp | 100% | intergenic (‑2/+5) | yieK ← / ← yieL | putative glucosamine‑6‑phosphate deaminase YieK/putative hydrolase YieL |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | 140 (1.110) | 88/174 | NT | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | 3899395 = | 0 (0.000) | intergenic (‑2/+13) | yieK/yieL | putative glucosamine‑6‑phosphate deaminase YieK/putative hydrolase YieL | |||||
* | ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | 132 (1.040) | 82/176 | NT | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | = 3899403 | 0 (0.000) | intergenic (‑10/+5) | yieK/yieL | putative glucosamine‑6‑phosphate deaminase YieK/putative hydrolase YieL |
Only 100 of 324 total aligned reads displayed.
CCAGGTTAACACGACGCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATTCCTGGTAAT > NC_000913/3899297‑3899493 | cagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacct < 2:2676162‑M2/1‑1 (MQ=255) ggTTAACACGACGCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTaa < 1:2555469/99‑1 (MQ=255) gTTAACACGACGCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAAt < 1:3241686/99‑1 (MQ=255) ttAACACGACGCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATg < 2:909219/99‑1 (MQ=255) tAACACGACGCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGc < 1:596405/99‑1 (MQ=255) aaCACGACGCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGcc < 1:2256491/99‑1 (MQ=255) acgacgCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTgg > 1:2753430‑M2/1‑97 (MQ=255) acgacgCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTgg > 1:2159881‑M2/1‑97 (MQ=255) acaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCtta > 1:1067475‑M2/89‑99 (MQ=255) acaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCtta < 1:474655‑M2/11‑1 (MQ=255) ggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCttattt < 1:996438‑M2/14‑1 (MQ=255) acgCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaa < 2:1503094‑M2/99‑6 (MQ=255) acgCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaa > 2:2139521‑M2/1‑94 (MQ=255) cgcgTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaat > 2:3213725‑M2/1‑93 (MQ=255) agggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCttatttta < 1:443588‑M2/16‑1 (MQ=255) cgTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatga > 1:413796‑M2/1‑91 (MQ=255) ggacagctgatagacacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcgtacacaaagtcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCttattttatt > 2:1634534‑M2/82‑99 (MQ=255) ggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCttattttatt < 2:1436865‑M2/18‑1 (MQ=255) tCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgact < 1:2730568‑M2/99‑11 (MQ=255) agctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTaaa < 2:2691892‑M2/22‑1 (MQ=255) agctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTaaa > 2:879542‑M2/78‑99 (MQ=255) gctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAaat < 1:1414172‑M2/23‑1 (MQ=255) cGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaa > 1:1073557‑M2/1‑85 (MQ=255) cGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaa > 2:1891224‑M2/1‑85 (MQ=255) ctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAaata < 2:2761621‑M2/24‑1 (MQ=255) gatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAaataat < 2:2527481‑M2/26‑1 (MQ=255) gatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAaataat > 1:753901‑M2/74‑99 (MQ=255) atagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAAtt < 1:2326241‑M2/27‑1 (MQ=255) tagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAAttt < 2:3023157‑M2/28‑1 (MQ=255) agaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTc < 1:3098872‑M2/29‑1 (MQ=255) gaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCt > 1:3064100‑M2/70‑99 (MQ=255) aaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTg < 2:1264798‑M2/31‑1 (MQ=255) aCCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgat < 1:1006358‑M2/99‑24 (MQ=255) ccAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgata < 1:36065‑M2/99‑25 (MQ=255) acagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTa < 1:2740883‑M2/33‑1 (MQ=255) acagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTa < 2:661082‑M2/33‑1 (MQ=255) cagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTAc > 1:1784385‑M2/66‑99 (MQ=255) gaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACaa > 1:220443‑M2/64‑99 (MQ=255) gCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgt > 1:3359824‑M2/1‑71 (MQ=255) gCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgt < 2:2441955‑M2/99‑29 (MQ=255) agccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAg < 2:386875‑M2/38‑1 (MQ=255) 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tgtgCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgtt > 2:1475648‑M2/1‑63 (MQ=255) tgCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttca > 1:246689‑M2/1‑61 (MQ=255) gcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAgg > 2:1989260‑M2/52‑99 (MQ=255) ccGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcaga > 2:336535‑M2/1‑59 (MQ=255) ccGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcaga > 1:493331‑M2/1‑59 (MQ=255) cacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGc < 1:1720358‑M2/49‑1 (MQ=255) cgcgACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagat > 1:2094041‑M2/1‑58 (MQ=255) acctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCt > 2:854838‑M2/50‑99 (MQ=255) gcgACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagata < 2:1813547‑M2/99‑43 (MQ=255) ctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTgg < 2:1179774‑M2/52‑1 (MQ=255) caaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTc < 2:2864153‑M2/54‑1 (MQ=255) acacGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatg > 1:854357‑M2/1‑54 (MQ=255) cacGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgc > 2:2450865‑M2/1‑53 (MQ=255) ggCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccg < 1:705821‑M2/99‑50 (MQ=255) gCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccga > 2:3077648‑M2/1‑49 (MQ=255) 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> 1:157097‑M2/12‑99 (MQ=255) gcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGata < 1:2388441‑M2/88‑1 (MQ=255) tttCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgaga > 2:2267772‑M2/1‑16 (MQ=255) tttCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgaga < 1:2688697‑M2/99‑84 (MQ=255) tttCATCTTAATGCCTggtaataactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgaga < 2:719679‑M2/99‑84 (MQ=255) catcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATTcc < 1:1106381‑M2/92‑1 (MQ=255) catcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATTcc < 1:2819481‑M2/92‑1 (MQ=255) catcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATTcc < 1:3191820‑M2/92‑1 (MQ=255) 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> 1:2968613/1‑99 (MQ=255) | CCAGGTTAACACGACGCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATTCCTGGTAAT > NC_000913/3899297‑3899493 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |