| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 483,542 | C→T | 100% | G288S (GGT→AGT) | acrB ← | multidrug efflux pump RND permease AcrB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 483,542 | 0 | C | T | 100.0% | 391.7 / NA | 92 | G288S (GGT→AGT) | acrB | multidrug efflux pump RND permease AcrB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (50/42); total (50/42) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
CGACGGGAAGAACGGTTCCATCTTCGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACCGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTCGCGACGTCACGCAGCAGCACGCGGGAACCAT > NC_000913/483447‑483637 | cGACGGGAAGAACGGTTCCATCTTCGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGa < 1:2576718/99‑1 (MQ=255)cGACGGGAAGAACGGTTCCATCTTCGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGa > 2:1826893/1‑99 (MQ=255) gACGGGAAGAACGGTTCCATCTTCGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGaa < 1:2479202/99‑1 (MQ=255) gggAAGAACGGTTCCATCTTCGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGcc > 1:1653685/1‑99 (MQ=255) ggAAGAACGGTTCCATCTTCGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCg > 1:786219/1‑99 (MQ=255) ggAAGAACGGTTCCATCTTCGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCg > 1:1334590/1‑99 (MQ=255) gaagaaCGGTTCCATCTTCGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCgg > 2:1255089/1‑99 (MQ=255) agaaCGGTTCCATCTTCGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGtt > 2:1562588/1‑99 (MQ=255) agaaCGGTTCCATCTTCGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGtt > 2:115381/1‑99 (MQ=255) gaaCGGTTCCATCTTCGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTg < 1:634078/99‑1 (MQ=255) gaaCGGTTCCATCTTCGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTg > 2:1077242/1‑99 (MQ=255) aaCGGTTCCATCTTCGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTgg < 1:2400985/99‑1 (MQ=255) aaCGGTTCCATCTTCGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTgg < 1:1192282/99‑1 (MQ=255) aaCGGTTCCATCTTCGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTgg < 2:1902549/99‑1 (MQ=255) aCGGTTCCATCTTCGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGc > 2:1254306/1‑99 (MQ=255) cGGTTCCATCTTCGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGcc > 1:878610/1‑99 (MQ=255) ggTTCCATCTTCGCCAGTTCAGCACGCATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCg < 2:1469053/99‑1 (MQ=255) gTTCCATCTTCGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGt > 1:1771405/1‑99 (MQ=255) gTTCCATCTTCGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGt > 1:182845/1‑99 (MQ=255) gTTCCATCTTCGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGt > 1:1029141/1‑99 (MQ=255) gTTCCATCTTCGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGt > 2:644294/1‑99 (MQ=255) ttCCATCTTCGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGtt > 1:1609824/1‑99 (MQ=255) ttCCATCTTCGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGtt < 2:475301/99‑1 (MQ=255) aTCTTCGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAAc > 1:2196743/1‑99 (MQ=255) cTTCGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAActc < 2:1177115/99‑1 (MQ=255) cTTCGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAActc < 1:770818/99‑1 (MQ=255) ttCGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAActct < 1:2262694/99‑1 (MQ=255) ttCGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAActct > 1:2617093/1‑99 (MQ=255) ttCGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAActct > 2:1127863/1‑99 (MQ=255) ttCGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAActct > 2:2088958/1‑99 (MQ=255) cGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGc < 2:1653685/99‑1 (MQ=255) aGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCgatg > 2:2358743/1‑99 (MQ=255) aGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCgatg > 1:1592951/1‑99 (MQ=255) gTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCgatga < 2:1088292/99‑1 (MQ=255) gTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCgatga < 1:107652/99‑1 (MQ=255) ttCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCgatgat > 1:230320/1‑99 (MQ=255) ttCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCgatgat < 2:352471/99‑1 (MQ=255) tCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGatgatg < 2:1216071/99‑1 (MQ=255) aCGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTa < 2:558254/99‑1 (MQ=255) cGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAg < 1:2256325/99‑1 (MQ=255) cGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAg > 1:2015779/1‑99 (MQ=255) gATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGtt > 1:2472072/1‑99 (MQ=255) gATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGtt < 1:1966371/99‑1 (MQ=255) ttGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTtct < 1:1981745/99‑1 (MQ=255) gCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTcacca < 1:864336/99‑1 (MQ=255) gCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTcacca < 1:17497/99‑1 (MQ=255) gCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTcacca < 1:1034632/99‑1 (MQ=255) gCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTcacca < 1:2150477/99‑1 (MQ=255) gCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCAccc > 2:2127802/1‑99 (MQ=255) gCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCAccc > 1:2446209/1‑99 (MQ=255) gCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCAccc < 1:2076097/99‑1 (MQ=255) ggTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAg > 2:779643/1‑99 (MQ=255) gTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGc > 1:2168733/1‑99 (MQ=255) tATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCt > 1:1077105/1‑99 (MQ=255) cAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAAt > 2:1604140/1‑99 (MQ=255) aGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATc < 2:1262556/99‑1 (MQ=255) gcgcGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCt > 1:2480000/1‑99 (MQ=255) cgcgTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCtt < 1:1472324/99‑1 (MQ=255) cgcgTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCtt < 2:370938/99‑1 (MQ=255) cgcgTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCtt > 2:2325880/1‑99 (MQ=255) gcgTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTc > 1:1819821/1‑99 (MQ=255) gcgTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTc > 1:2229432/1‑99 (MQ=255) gcgTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTc < 1:2004101/99‑1 (MQ=255) gcgTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTc < 1:1196883/99‑1 (MQ=255) cgTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTcg < 2:2581406/99‑1 (MQ=255) gTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTcgc > 2:2606151/1‑99 (MQ=255) tttGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTcgcg > 2:167362/1‑99 (MQ=255) tttGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTcgcg > 1:2318033/1‑99 (MQ=255) ttGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTCGCGa < 2:627805/99‑1 (MQ=255) ttGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTCGCGa < 1:2369838/99‑1 (MQ=255) cACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTCGCGACGt < 2:1127030/99‑1 (MQ=255) aCCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTCGCGACGTc > 2:1768343/1‑99 (MQ=255) aCCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTCGCGACGTc > 1:1882628/1‑99 (MQ=255) aCCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTCGCGACGTc > 1:1070939/1‑99 (MQ=255) ccGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTCGCGACGTCa > 1:627307/1‑99 (MQ=255) ggTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTCGCGACGTCACg > 1:1449179/1‑99 (MQ=255) ggTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTCGCGACGTCACg > 1:486471/1‑99 (MQ=255) gTCGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTCGCGACGTCACgc > 2:1316470/1‑99 (MQ=255) cGCCAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTCGCGACGTCACgcag < 1:744962/99‑1 (MQ=255) ccAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTCGCGACGTCACgcagca < 2:907542/99‑1 (MQ=255) ccAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTCGCGACGTCACgcagca < 1:13681/99‑1 (MQ=255) cAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTCGCGACGTCACgcagcag > 2:1353063/1‑99 (MQ=255) cAGCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTCGCGACGTCACgcagcag > 1:1267622/1‑99 (MQ=255) gCTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTCGCGACGTCACgcagcagca < 1:210159/99‑1 (MQ=255) cTTGATCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTCGCGACGTCACGCAGCAGCAc < 2:2211346/99‑1 (MQ=255) aTCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTCGCGACGTCACGCAGCAGCACGCgg < 2:224153/99‑1 (MQ=255) aTCCCCAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTCGCGACGTCACGCAGCAGCACGCgg > 1:695939/1‑99 (MQ=255) cccAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTCGCGACGTCACGCAGCAGCACGCGGGaa < 2:2413332/99‑1 (MQ=255) ccAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTCGCGACGTCACGCAGCAGCACGCGGGAAc < 2:1449795/99‑1 (MQ=255) cAGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTCGCGACGTCACGCAGCAGCACGCGGGAAcc > 2:774305/1‑99 (MQ=255) aGACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTCGCGACGTCACGCAGCAGCACGCGGGAACCa > 1:517153/1‑99 (MQ=255) gACTGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTCGCGACGTCACGCAGCAGCACGCGGGAACCAt > 2:1052737/1‑99 (MQ=255) | CGACGGGAAGAACGGTTCCATCTTCGCCAGTTCAGCACGGATTGCCGCAGCGGTATCCAGCGCGTTTGCACCGGTCGCCAGCTTGATCCCCAGACCGGAAGCCGGTTGGCCGTTAAACTCTGCGATGATGTCGTAGTTCTCACCACCCAGCTCAATCTTCGCGACGTCACGCAGCAGCACGCGGGAACCAT > NC_000913/483447‑483637 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |