| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,899,395 | IS1 (–) +9 bp | 100% | intergenic (‑2/+5) | yieK ← / ← yieL | putative glucosamine‑6‑phosphate deaminase YieK/putative hydrolase YieL |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | 131 (1.490) | 82/174 | NT | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3899395 = | 0 (0.000) | intergenic (‑2/+13) | yieK/yieL | putative glucosamine‑6‑phosphate deaminase YieK/putative hydrolase YieL | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | 105 (1.180) | 69/176 | NT | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3899403 | 0 (0.000) | intergenic (‑10/+5) | yieK/yieL | putative glucosamine‑6‑phosphate deaminase YieK/putative hydrolase YieL | |||||
Only 100 of 272 total aligned reads displayed.
CCAGGTTAACACGACGCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATTCCTGGTAAT > NC_000913/3899297‑3899493 | ccAGGTTAACACGACGCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCt > 1:1074333/1‑99 (MQ=255)cagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacct > 2:473081‑M2/99‑99 (MQ=255)cagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacct > 2:1787174‑M2/99‑99 (MQ=255)cagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacct < 2:2023197‑M2/1‑1 (MQ=255) cAGGTTAACACGACGCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCtt > 2:1744972/1‑99 (MQ=255) agtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacctt < 1:118528‑M2/2‑1 (MQ=255) agtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacctt < 2:919532‑M2/2‑1 (MQ=255) gtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTa < 1:1280016‑M2/3‑1 (MQ=255) ggTTAACACGACGCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTaa > 2:1335629/1‑99 (MQ=255) ttAACACGACGCCTCTTCGACATATAACCAAGCAGGTGGTGTGCCGCGACACGGCCCATTTCCTGGTAACCATCGGTAATGACTGATTTCCTCTTAATg > 2:242482/1‑99 (MQ=255) aaCACGACGCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGCCACGGCTCATCTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGcc > 2:1283543/1‑99 (MQ=255) gaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCt < 2:2275964‑M2/9‑1 (MQ=255) gaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCt < 1:379013‑M2/9‑1 (MQ=255) acacGACGCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCt < 1:771102/99‑1 (MQ=255) acacGACGCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCt < 1:731767/99‑1 (MQ=255) acgacgCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTgg > 2:2070980‑M2/1‑97 (MQ=255) cgacgCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggt < 1:877330‑M2/99‑4 (MQ=255) caggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCttat < 1:1897695‑M2/12‑1 (MQ=255) aggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCttatt < 1:467630‑M2/13‑1 (MQ=255) ggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCttattttatt > 2:1150114‑M2/82‑99 (MQ=255) tCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgact < 2:1341387‑M2/99‑11 (MQ=255) cTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaacgactc > 1:2220451‑M2/1‑88 (MQ=255) cGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaa > 1:1982769‑M2/1‑85 (MQ=255) gatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAaataat < 2:1546521‑M2/26‑1 (MQ=255) ataACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttatt < 2:608902‑M2/99‑21 (MQ=255) ataACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttatt < 1:1844146‑M2/99‑21 (MQ=255) taACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattg < 2:615125‑M2/99‑22 (MQ=255) aaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTg < 1:2303996‑M2/31‑1 (MQ=255) aaCCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattga > 1:1713711‑M2/1‑77 (MQ=255) aacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGt > 2:376118‑M2/68‑99 (MQ=255) acagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTa < 1:431822‑M2/33‑1 (MQ=255) gaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACaa > 2:1556904‑M2/64‑99 (MQ=255) aagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACaaa > 2:2338681‑M2/63‑99 (MQ=255) agccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAg < 2:2295896‑M2/38‑1 (MQ=255) aGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttt > 2:1502155‑M2/1‑69 (MQ=255) gATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgtttt < 1:1529463‑M2/99‑32 (MQ=255) gATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgtttt < 1:641055‑M2/99‑32 (MQ=255) gATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgtttt < 1:1290499‑M2/99‑32 (MQ=255) ccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGc < 1:1484563‑M2/40‑1 (MQ=255) aTGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgtttta > 1:196677‑M2/1‑67 (MQ=255) ctggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGc > 1:579470‑M2/57‑99 (MQ=255) tgtgCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgtt > 2:343338‑M2/1‑63 (MQ=255) tgtgCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgtt < 1:1562902‑M2/99‑37 (MQ=255) tgtgCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAACGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgtt < 1:910427‑M2/99‑37 (MQ=255) ggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCAt > 1:707401‑M2/55‑99 (MQ=255) gcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAgg > 2:1965564‑M2/52‑99 (MQ=255) ccGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcaga > 1:653278‑M2/1‑59 (MQ=255) cgcgACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagat > 2:1196534‑M2/1‑58 (MQ=255) gcgACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagata > 1:22823‑M2/1‑57 (MQ=255) tcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGt < 1:140732‑M2/53‑1 (MQ=255) cacGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgc < 1:1346111‑M2/99‑47 (MQ=255) acGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcc < 1:1622468‑M2/99‑48 (MQ=255) aaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGc < 2:1462986‑M2/56‑1 (MQ=255) aacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCa > 1:962106‑M2/42‑99 (MQ=255) gCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccga < 1:2129001‑M2/99‑51 (MQ=255) gCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccga < 1:260287‑M2/99‑51 (MQ=255) caccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGa > 2:595566‑M2/40‑99 (MQ=255) ccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACa > 2:141485‑M2/38‑99 (MQ=255) cATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatga > 1:530736‑M2/1‑46 (MQ=255) catcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACAt < 1:1004268‑M2/63‑1 (MQ=255) atcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATc < 1:104403‑M2/64‑1 (MQ=255) catacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCa > 2:1087751‑M2/34‑99 (MQ=255) atacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCAt > 1:296351‑M2/33‑99 (MQ=255) atacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCAt > 2:15146‑M2/33‑99 (MQ=255) cTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgt < 2:1767390‑M2/99‑60 (MQ=255) tGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtc < 1:2059558‑M2/99‑61 (MQ=255) tGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtc < 1:47868‑M2/99‑61 (MQ=255) ggTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtca > 2:2176002‑M2/1‑38 (MQ=255) ggTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtca < 1:1440928‑M2/99‑62 (MQ=255) actaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCa < 1:2036454‑M2/71‑1 (MQ=255) ctaaatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCAt < 1:309259‑M2/72‑1 (MQ=255) tCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcag < 2:1624388‑M2/99‑67 (MQ=255) tCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcag > 1:1355364‑M2/1‑33 (MQ=255) tCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcag < 1:211364‑M2/99‑67 (MQ=255) aatcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGt > 2:662079‑M2/25‑99 (MQ=255) ttcagtaagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATGTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGtt < 2:101219‑M2/76‑1 (MQ=255) ggTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctcca < 2:1203097‑M2/99‑72 (MQ=255) taagttggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGAc < 1:1158788‑M2/81‑1 (MQ=255) gTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccac < 2:752719‑M2/99‑73 (MQ=255) aTGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccga < 2:26571‑M2/99‑76 (MQ=255) tGATTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgat > 2:863679‑M2/1‑23 (MQ=255) tggcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGa < 2:1599759‑M2/86‑1 (MQ=255) aTTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattt > 1:2135398‑M2/1‑21 (MQ=255) aTTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattt < 2:821726‑M2/99‑79 (MQ=255) aTTAATTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattt < 2:304791‑M2/99‑79 (MQ=255) gcagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGata < 1:848093‑M2/88‑1 (MQ=255) cagcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGatat < 1:1765925‑M2/89‑1 (MQ=255) agcatcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATAtt < 1:1807418‑M2/90‑1 (MQ=255) aaTTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttga < 1:1874395‑M2/99‑82 (MQ=255) aTTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgag < 2:2155853‑M2/99‑83 (MQ=255) aTTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgag < 2:135153‑M2/99‑83 (MQ=255) aTTTCATCTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgag > 1:1679218‑M2/1‑17 (MQ=255) catcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATTcc < 2:1881141‑M2/92‑1 (MQ=255) tcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATTCCTg > 1:821071‑M2/6‑99 (MQ=255) tcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATTCCTg > 1:544614‑M2/6‑99 (MQ=255) tcaccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATTCCTg > 1:2172146‑M2/6‑99 (MQ=255) ccTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATTCCTGGTa > 2:2083867‑M2/3‑99 (MQ=255) cTTAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgaca < 2:2193686‑M2/99‑90 (MQ=255) ttAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacag < 1:1776450‑M2/99‑91 (MQ=255) ttAATGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacag < 2:964642‑M2/99‑91 (MQ=255) | CCAGGTTAACACGACGCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATTCCTGGTAAT > NC_000913/3899297‑3899493 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |