| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1050545 | NA (NA) | 12 (0.100) | 12/174 | NT | 12.2% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1292998 = | 86 (0.730) | intergenic (‑76/‑529) | hns/tdk | DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine/deoxyuridine kinase | |||||
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
AGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATT > NC_000913/1292900‑1293095 | gaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattacccc > 1:2514396‑M2/98‑99 (MQ=255) gAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCa > 1:1738827/1‑99 (MQ=255) tttAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGaa < 1:110388/99‑1 (MQ=255) tttAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGaa < 1:1493840/99‑1 (MQ=255) cgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGaa < 2:1347838‑M2/7‑1 (MQ=255) ttAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAAt < 2:100278/99‑1 (MQ=255) ttAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAAt > 2:3152942/1‑99 (MQ=255) aaGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGt < 2:2123139/99‑1 (MQ=255) gtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTa < 1:2849981‑M2/11‑1 (MQ=255) tcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGAATGTAAg > 2:447412‑M2/88‑99 (MQ=255) tGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAg > 1:1136357/1‑99 (MQ=255) tGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAg < 1:168001/99‑1 (MQ=255) cTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGa < 1:848679/99‑1 (MQ=255) cTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGa > 2:1578011/1‑99 (MQ=255) ttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGAATGTAAGGaa < 2:2177835‑M2/15‑1 (MQ=255) ttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGAATGTAAGGaa > 1:1412203‑M2/85‑99 (MQ=255) ttCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGaa > 1:1938571/1‑99 (MQ=255) tCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgc < 2:2658931‑M2/99‑9 (MQ=255) acaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacatataacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCa < 2:1071583‑M2/20‑1 (MQ=255) ttGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAAt > 2:1199213/1‑99 (MQ=255) ttGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAAt < 1:552237/99‑1 (MQ=255) tGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAAtt < 2:746729/99‑1 (MQ=255) gtagtaATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTg < 2:1128453/99‑1 (MQ=255) gtagtaATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTg > 1:348308/1‑99 (MQ=255) gtagtaATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTg > 2:1714622/1‑99 (MQ=255) tagtaATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaactta < 1:2653862‑M2/99‑19 (MQ=255) tagtaATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGt < 1:659054/99‑1 (MQ=255) gtaATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTc > 1:2033940/1‑99 (MQ=255) agctgcatgacaaagtcatcgggcattatctggacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCtt < 2:1916016‑M2/31‑1 (MQ=255) aaTCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCtt < 1:1655774/99‑1 (MQ=255) tctcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTa < 2:645847/99‑1 (MQ=255) gctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTa < 2:2859128‑M2/32‑1 (MQ=255) ctcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTGATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgattt < 1:1209857‑M2/99‑26 (MQ=255) ctcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTAt < 2:3072400/99‑1 (MQ=255) ctcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTAt < 2:153718/99‑1 (MQ=255) catgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTAttt > 2:834444‑M2/64‑99 (MQ=255) aaaCTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTAtttt > 1:1041171/1‑99 (MQ=255) aaCTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTtg < 1:1477795/99‑1 (MQ=255) aaCTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTtg > 1:3135544/1‑99 (MQ=255) aCTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTtgt < 1:2176189/99‑1 (MQ=255) atatTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga < 2:2362609‑M2/99‑35 (MQ=255) tatTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTgccgc < 1:2642677/99‑1 (MQ=255) tatTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTgccgc > 2:1267698/1‑99 (MQ=255) tatTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTgccgc > 2:2795884/1‑99 (MQ=255) tGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCaa < 2:3116003/99‑1 (MQ=255) catcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCaa < 2:86920‑M2/47‑1 (MQ=255) ggggTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCaat < 2:2954529/99‑1 (MQ=255) ggggTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCaat < 2:2106029/99‑1 (MQ=255) ggggTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCaat < 1:1264265/99‑1 (MQ=255) ggtggtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtt < 2:204506‑M2/99‑42 (MQ=255) gtggtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCaataaa < 2:1284188/99‑1 (MQ=255) tggtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCaataaat < 2:1104877/99‑1 (MQ=255) ggtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCaataaata > 2:745914/1‑99 (MQ=255) gcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAatat > 2:1304406‑M2/47‑99 (MQ=255) tttGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATc < 1:127046/99‑1 (MQ=255) attatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCt < 2:1788645‑M2/55‑1 (MQ=255) tgttgAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgagg > 2:2938321‑M2/1‑51 (MQ=255) tgttgAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgagg > 2:570955‑M2/1‑51 (MQ=255) atctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCttt < 2:2631416‑M2/58‑1 (MQ=255) atctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCtttt < 1:154234‑M2/58‑1 (MQ=255) tctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTc > 1:179921‑M2/41‑99 (MQ=255) gAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCa > 2:1603540/1‑99 (MQ=255) ggTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctcc < 2:1928358‑M2/99‑55 (MQ=255) gTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATaa > 1:1232770/1‑99 (MQ=255) gTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATaa > 1:628923/1‑99 (MQ=255) taataGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAAtt > 1:1024535/1‑99 (MQ=255) aataGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTa < 2:1692105/99‑1 (MQ=255) aataGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTa < 1:2785832/99‑1 (MQ=255) ataGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCTATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAg < 2:357187/99‑1 (MQ=255) taGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGc > 2:674493/1‑99 (MQ=255) acactatcaataagttggagtcattaccCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGc < 1:2474610‑M2/71‑1 (MQ=255) aacactatcaataagttggagtcattaccCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGc > 1:812090‑M2/30‑99 (MQ=255) gagCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCa < 2:3009380/99‑1 (MQ=255) gagCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCa < 2:2771474/99‑1 (MQ=255) gagCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCa < 1:1978300/99‑1 (MQ=255) ccTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGaa < 2:1611288/99‑1 (MQ=255) ttAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGaaaa < 2:2615505/99‑1 (MQ=255) tAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAg > 2:2446254/1‑99 (MQ=255) aaaTTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGa < 2:2235100/99‑1 (MQ=255) aaaTTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGa < 2:1791665/99‑1 (MQ=255) aaaTTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGa < 2:2040404/99‑1 (MQ=255) aaTTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctat < 1:2888248‑M2/99‑73 (MQ=255) aaTTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctat > 1:1429339‑M2/1‑27 (MQ=255) aaTTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctat < 1:2171396‑M2/99‑73 (MQ=255) tCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGAcgcg > 1:1020812/1‑99 (MQ=255) agttggagtcattaccCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGAcgcg > 2:1381377‑M2/17‑99 (MQ=255) gTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCa > 2:294153/1‑99 (MQ=255) tgtgCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCata > 1:40662/1‑99 (MQ=255) cattaccCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGc > 1:1996236‑M2/8‑99 (MQ=255) cAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGc < 2:2720390/99‑1 (MQ=255) cAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGc < 1:948804/99‑1 (MQ=255) aaTAGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcc > 1:478214‑M2/1‑14 (MQ=255) aaTAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGcc < 1:1275545/99‑1 (MQ=255) aaTAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGcc < 1:22608/99‑1 (MQ=255) taccCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCt < 2:357007‑M2/95‑1 (MQ=255) tAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCt < 1:1329172/99‑1 (MQ=255) aGCCAGGAATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgt > 2:157493‑M2/1‑11 (MQ=255) gCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTAt > 2:371825/1‑99 (MQ=255) gCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTAt < 2:2208222/99‑1 (MQ=255) cCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTAtt < 1:1332161‑M2/98‑1 (MQ=255) | AGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATT > NC_000913/1292900‑1293095 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |