| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 252,159 | IS1 (+) +9 bp | 100% | coding (155‑163/294 nt) | yafN → | antitoxin YafN |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 19796 = | NA (NA) | 74 (0.970) | 54/176 | NT | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 252159 = | 0 (0.000) | coding (155/294 nt) | yafN | antitoxin YafN | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 252167 | 0 (0.000) | 62 (0.810) | 50/176 | NT | 100% | coding (163/294 nt) | yafN | antitoxin YafN |
| ? | NC_000913 | = 258675 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
CTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/252070‑252167‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACT < NC_000913/258675‑258579 CTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGG > 2:703725/1‑99CTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGG > 1:389410/1‑99 TTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGG < 1:2103655/99‑1 TTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGT > 2:757385/1‑99 ATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGA < 1:1531043/99‑1 ATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGA < 1:1724866/99‑1 TTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGAT > 2:306874/1‑99 TCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTG > 1:1764461/1‑99 AACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCC > 2:1841181/1‑99 GGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACT < 1:2200746/99‑1 GTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTT > 1:1563838/1‑99 GTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTT > 2:1303679/1‑99 GTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTT > 1:823595/1‑99 TTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTA > 2:858221/1‑99 CGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTG > 1:2031563/1‑99 GGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGA > 2:1295469/1‑99 TTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 2:288696/99‑1 CTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA > 2:1092797/1‑99 TTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG < 1:1770216/99‑1 TTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT > 1:1244274/1‑99 TTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 1:503866/99‑1 TCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG > 2:2044045/1‑99 AATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT > 2:1402320/1‑99 AATCGCCCCGCAGGATACCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT < 2:753384/99‑1 ATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG > 1:955442/1‑99 TCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGG > 2:972399/1‑99 CCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTT > 2:1070846/1‑99 CAGGATATCTCTTAAATGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG > 2:662541/1‑99 AGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA > 1:1936465/1‑99 GGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG > 2:1114312/1‑99 gagATCTGTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGGTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAGGGTGTTTTTGAGG < 2:1009821/96‑1 GATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG > 2:276375/1‑99 GATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG > 1:1292046/1‑99 ATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT > 1:1335912/1‑99 ATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT < 1:594182/99‑1 TATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG > 2:74706/1‑99 CTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTC < 2:647401/99‑1 CTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTC < 2:2009816/99‑1 CTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTC < 1:978570/99‑1 CTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCA < 2:1516998/99‑1 CTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCA < 2:1765716/99‑1 TTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAG < 2:1201946/99‑1 TTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAG > 2:1180613/1‑99 AGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGG > 2:379090/1‑99 AGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGG > 2:2141172/1‑99 GTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGC > 2:1378564/1‑99 GTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGC > 1:246132/1‑99 GCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTT < 2:1913864/99‑1 GCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGT > 2:726577/1‑99 CGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTT < 1:126833/99‑1 CGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGAATTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTT < 1:43190/99‑1 GCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTT > 1:644641/1‑99 CATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTC > 1:1820306/1‑99 GAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCA > 2:1724979/1‑99 AAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG > 2:660783/1‑99 GCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCT < 1:220146/99‑1 CGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTG < 2:37176/99‑1 AATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGAGTTAGTGTATGATGGTGCTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCC > 2:2077602/1‑99 ATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCT > 1:2007753/1‑99 TGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTC < 2:2134355/99‑1 TGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTC < 2:1466987/99‑1 GACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCT < 2:508655/99‑1 GACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCT < 2:1439326/99‑1 ACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTGCTGTTTCTATCAGCTGTGCCTCCTG > 2:1302930/1‑99 ATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTT < 2:1712070/99‑1 ATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTT < 1:1455712/99‑1 TGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTC > 2:283394/1‑99 GCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCACCTGTTCA < 1:548076/99‑1 CTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTAC < 2:16654/99‑1 TGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACT < 2:200412/99‑1 TGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACT > 1:144839/1‑99 CTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/252070‑252167‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACT < NC_000913/258675‑258579 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |