| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 71275 | 96 (1.250) | 6938 (95.000) +GCTC |
157/168 | NT | 98.8% | intergenic (+10/‑76) | araC/yabI | DNA‑binding transcriptional dual regulator AraC/DedA family protein YabI |
| ? | NC_000913 | 366286 = | 76 (0.990) | coding (20/3075 nt) | lacZ | beta‑galactosidase | |||||
Only 100 of 8596 total aligned reads displayed.
ATTACGCCAGCTGGCGAAAGGGGGATGTGCTGCAAGGCGATTAAGTTGGGTAACGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGACGTTGTAAAACGACGGCCAGTGAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGG > NC_000913/366189‑366385 | aaaaatgcaccggggccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGa > 1:873965‑M2/98‑99 (MQ=255)aaaaatgcaccggggccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGa > 1:312530‑M2/98‑99 (MQ=255)aaaaatgcaccggggccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGa > 2:554207‑M2/98‑99 (MQ=255) aaaatgcaccggggccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGaa < 2:1220952‑M2/3‑1 (MQ=255) aaaatgcaccggggccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGaa < 2:1031457‑M2/3‑1 (MQ=255) aaaatgcaccggggccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGaa < 1:1248610‑M2/3‑1 (MQ=255) aaatgcaccggggccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAAt > 2:1708272‑M2/96‑99 (MQ=255) aaatgcaccggggccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAAt < 2:227214‑M2/4‑1 (MQ=255) aatgcaccggggccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAatt > 2:315153‑M2/95‑98 (MQ=255) atgcaccggggccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGaattc > 1:1834128‑M2/94‑97 (MQ=255) tgcaccggggccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcgaattcg > 2:1071595‑M2/93‑96 (MQ=255) tgcaccggggccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcgaattcg > 2:2130247‑M2/93‑96 (MQ=255) tgcaccggggccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCg < 1:1325341‑M2/7‑1 (MQ=255) tgcaccggggccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCg < 2:741952‑M2/7‑1 (MQ=255) accggggccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTaa > 2:1862076‑M2/90‑99 (MQ=255) accggggccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTaa < 1:1486993‑M2/10‑1 (MQ=255) ccggggccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAAt > 1:714678‑M2/89‑99 (MQ=255) ggggccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCa < 1:1956592‑M2/13‑1 (MQ=255) ggggccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCa < 1:1763501‑M2/13‑1 (MQ=255) ggggccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCa < 2:1428300‑M2/13‑1 (MQ=255) ggccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCATg > 1:1801731‑M2/85‑99 (MQ=255) gccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAtgt > 1:435362‑M2/84‑98 (MQ=255) ccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCatgtc > 2:512234‑M2/83‑97 (MQ=255) cagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATcatgtca < 2:1112349‑M2/18‑4 (MQ=255) cagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATcatgtca < 1:1367459‑M2/18‑4 (MQ=255) agcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgcgctcGAATTCGTAAtcatgtcat > 2:671510‑M2/81‑95 (MQ=255) gcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATa > 1:2107133‑M2/80‑99 (MQ=255) gagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTg < 1:1039774‑M2/24‑1 (MQ=255) gagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTg > 2:1977277‑M2/76‑99 (MQ=255) gcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGtt < 2:1936560‑M2/26‑1 (MQ=255) cgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGttt > 1:1726762‑M2/73‑99 (MQ=255) agttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTcc < 1:1915559‑M2/29‑1 (MQ=255) agttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTcc < 1:280087‑M2/29‑1 (MQ=255) ttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCtg > 2:1383274‑M2/69‑99 (MQ=255) ttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCtg > 1:545707‑M2/69‑99 (MQ=255) ttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCtg < 2:1179917‑M2/31‑1 (MQ=255) ttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCtg < 2:1148420‑M2/31‑1 (MQ=255) ccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCtgtg < 1:1609371‑M2/33‑1 (MQ=255) cgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCtgtgt < 2:633482‑M2/34‑1 (MQ=255) gtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCtgtgtg > 2:708376‑M2/65‑99 (MQ=255) tgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGa > 2:594184‑M2/64‑99 (MQ=255) ccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGaaa > 1:593683‑M2/62‑99 (MQ=255) cggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAAt < 2:2019152‑M2/39‑1 (MQ=255) cggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAAt > 1:1286745‑M2/61‑99 (MQ=255) ggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAAtt > 2:951455‑M2/60‑99 (MQ=255) gttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTg > 2:826649‑M2/59‑99 (MQ=255) gttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTg < 2:2097600‑M2/41‑1 (MQ=255) aTTAAGTTGGGTAACGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGACGTTGTAAAACGACGGCCAGTGAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAAtt > 2:391744/1‑99 (MQ=255) ttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGt > 2:1344774‑M2/58‑99 (MQ=255) tgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTAt > 1:1000059‑M2/55‑99 (MQ=255) tgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTAt > 2:784748‑M2/55‑99 (MQ=255) tgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTAt > 1:1868451‑M2/55‑99 (MQ=255) aagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATcc > 1:962066‑M2/53‑99 (MQ=255) aagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATcc > 2:1825741‑M2/53‑99 (MQ=255) agaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCg > 1:750923‑M2/52‑99 (MQ=255) gaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGc < 1:2073594‑M2/49‑1 (MQ=255) gaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGc > 2:431241‑M2/51‑99 (MQ=255) aaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTca < 2:1301393‑M2/52‑1 (MQ=255) agtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTcaca > 1:1449565‑M2/46‑99 (MQ=255) gtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACaa < 2:1464758‑M2/55‑1 (MQ=255) gtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACaa < 2:356311‑M2/55‑1 (MQ=255) gtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACaa > 2:2168755‑M2/45‑99 (MQ=255) gtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACaa < 1:470972‑M2/55‑1 (MQ=255) tgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAAt < 2:1514120‑M2/56‑1 (MQ=255) atgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTcc > 1:631096‑M2/41‑99 (MQ=255) tgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCca < 1:676615‑M2/60‑1 (MQ=255) atgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCcaca < 2:867562‑M2/62‑1 (MQ=255) atgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCcaca < 1:1206247‑M2/62‑1 (MQ=255) gtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCcacaca < 2:1898045‑M2/64‑1 (MQ=255) tagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACacaa < 2:1001688‑M2/65‑1 (MQ=255) tagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACacaa > 1:2181088‑M2/35‑99 (MQ=255) tagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACacaa < 1:115834‑M2/65‑1 (MQ=255) tagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACacaa < 1:1562316‑M2/65‑1 (MQ=255) agccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACacaac > 1:1681215‑M2/34‑99 (MQ=255) tcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACg > 1:83067‑M2/29‑99 (MQ=255) tcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACg < 1:2140876‑M2/71‑1 (MQ=255) tcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACg > 2:1786704‑M2/29‑99 (MQ=255) caagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGa < 1:506362‑M2/72‑1 (MQ=255) aagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAg > 1:2029276‑M2/27‑99 (MQ=255) agttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGc > 2:126363‑M2/26‑99 (MQ=255) gttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGcc > 2:1671012‑M2/25‑99 (MQ=255) gttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGcc > 1:1518359‑M2/25‑99 (MQ=255) ttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCg > 1:392564‑M2/24‑99 (MQ=255) tgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCgg > 2:1633055‑M2/23‑99 (MQ=255) tcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGaa > 1:1645303‑M2/21‑99 (MQ=255) cataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAg > 2:264662‑M2/20‑99 (MQ=255) taattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCa > 1:349625‑M2/18‑99 (MQ=255) aattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCAt > 1:918671‑M2/17‑99 (MQ=255) aattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCAt < 2:46942‑M2/83‑1 (MQ=255) attggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATa > 1:1083335‑M2/16‑99 (MQ=255) ttggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATaa < 1:1992593‑M2/85‑1 (MQ=255) tggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATaaa < 2:1747426‑M2/86‑1 (MQ=255) accgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAgtgt < 1:1406211‑M2/90‑1 (MQ=255) ccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTa < 2:915832‑M2/91‑1 (MQ=255) ccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTa > 1:789667‑M2/9‑99 (MQ=255) agctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAg < 2:2059199‑M2/94‑1 (MQ=255) ctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGcc < 2:159171‑M2/96‑1 (MQ=255) ctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGcc < 1:1119820‑M2/96‑1 (MQ=255) ctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGcc > 1:23849‑M2/4‑99 (MQ=255) cGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTg < 2:1555329‑M2/98‑1 (MQ=255) | ATTACGCCAGCTGGCGAAAGGGGGATGTGCTGCAAGGCGATTAAGTTGGGTAACGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGACGTTGTAAAACGACGGCCAGTGAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGG > NC_000913/366189‑366385 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |