| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 252,159 | IS1 (+) +9 bp | 100% | coding (155‑163/294 nt) | yafN → | antitoxin YafN |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 19796 = | NA (NA) | 76 (1.060) | 56/176 | NT | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 252159 = | 0 (0.000) | coding (155/294 nt) | yafN | antitoxin YafN | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 252167 | 0 (0.000) | 77 (1.080) | 56/176 | NT | 100% | coding (163/294 nt) | yafN | antitoxin YafN |
| ? | NC_000913 | = 258675 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
CTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/252070‑252167‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTA < NC_000913/258675‑258581 CTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGG > 1:84964/1‑99CTTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGG > 1:99711/1‑99 TTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGG < 1:850123/99‑1 TTTATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGG < 2:1270246/99‑1 TATTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTG > 1:404676/1‑99 TTGATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGAT < 2:1590823/99‑1 GATCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGC < 2:538207/99‑1 TCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTG > 1:194254/1‑99 TCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTG > 1:67970/1‑99 TCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTG > 2:1087565/1‑99 TCAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTG > 2:744092/1‑99 CAACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGC > 1:1530950/1‑99 ACCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCA > 2:569308/1‑99 CCGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAA < 2:651071/99‑1 CGGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAAC > 1:1425141/1‑99 GGTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACT > 2:290429/1‑99 GTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTT > 2:1772961/1‑99 GTTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTCAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTT > 1:1402135/1‑99 TTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTA < 1:714253/99‑1 TTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTA > 2:1091027/1‑99 TTGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTA > 1:698592/1‑99 TGCGGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTAC < 2:1556400/99‑1 GGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGA > 2:1057957/1‑99 GGTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGA < 2:368774/99‑1 GTTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT > 2:510151/1‑99 TTCTTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT > 2:1209049/1‑99 TTTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG < 2:1322448/99‑1 TTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 2:143753/99‑1 TTCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 2:244444/99‑1 TCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG > 1:390772/1‑99 TCTAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG > 1:1013773/1‑99 TAATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTA > 2:676770/1‑99 AATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT > 2:1787721/1‑99 ATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG > 1:1749273/1‑99 ATAATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG > 2:687525/1‑99 ATCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG < 2:1157434/99‑1 TCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGG < 2:1579030/99‑1 TCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGG > 1:282306/1‑99 TCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGG < 2:219445/99‑1 TCGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGG < 1:232668/99‑1 CGCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGT < 2:809438/99‑1 GCCCCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTG < 1:914164/99‑1 CCGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT < 2:465342/99‑1 CGCAGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT > 2:1589171/1‑99 AGGATATCTCTTAAGTGCCAGCGCATTCGAAGCGTTAATGGACATGCTTGCTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA > 2:970787/1‑99 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NC_000913/252070‑252167‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTA < NC_000913/258675‑258581 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |