| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 366,300 | Δ1 bp | 100% | coding (6/3075 nt) | lacZ ← | beta‑galactosidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 366,300 | 0 | G | . | 97.6% | 21961.7 / inf | 5051 | coding (6/3075 nt) | lacZ | beta‑galactosidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (59/59); new base . (2393/2537); total (2452/2599) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.80e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 5334 total aligned reads displayed.
GCGAAAGGGGGATGTGCTGCAAGGCGATTAAGTTGGGTAACGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGACGTTGTAAAACGACGGCCAGTGAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGA > NC_000913/366202‑366397 | ggccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCATg > 1:2579598‑M2/85‑99 (MQ=255) gccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAtgt < 1:2725942‑M2/16‑2 (MQ=255) gccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAtgt < 1:506436‑M2/16‑2 (MQ=255) cagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgggctcGAATTCGTAATcatgtca < 1:782115‑M2/18‑4 (MQ=255) agcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAAtcatgtcat < 2:1725317‑M2/19‑5 (MQ=255) aaGGGGGATGTGCTGCAAGGCGATTAAGTTGGGTAACGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGACGTTGTAAAACGACGGCCAGTGAATCCGTAATCATGGTCa < 2:650657/99‑1 (MQ=255) gcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATa > 2:2131153‑M2/80‑99 (MQ=255) cccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAg < 2:600115‑M2/21‑1 (MQ=255) gagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTg > 1:411787‑M2/76‑99 (MQ=255) agcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGt > 1:461966‑M2/75‑99 (MQ=255) agcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGt > 1:1515394‑M2/75‑99 (MQ=255) gcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGtt > 1:207223‑M2/74‑99 (MQ=255) gcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGtt < 1:1611681‑M2/26‑1 (MQ=255) gcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGtt < 2:1000003‑M2/26‑1 (MQ=255) gcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGtt < 1:1763963‑M2/26‑1 (MQ=255) tccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCtgt < 2:1894830‑M2/32‑1 (MQ=255) tgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGa > 1:2237254‑M2/64‑99 (MQ=255) ccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGaaa < 2:2655166‑M2/38‑1 (MQ=255) cggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAAt < 1:2378527‑M2/39‑1 (MQ=255) gttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTg > 2:11125‑M2/59‑99 (MQ=255) gttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTg > 2:703408‑M2/59‑99 (MQ=255) ttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGt > 2:49452‑M2/58‑99 (MQ=255) ttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGt > 1:2120150‑M2/58‑99 (MQ=255) gtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTa < 2:2812339‑M2/44‑1 (MQ=255) tgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTAt > 1:1237775‑M2/55‑99 (MQ=255) gaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATc < 1:737859‑M2/46‑1 (MQ=255) agaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCg > 2:2299304‑M2/52‑99 (MQ=255) gaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGc > 2:548907‑M2/51‑99 (MQ=255) aaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCt > 2:1161370‑M2/50‑99 (MQ=255) aaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCt > 1:877088‑M2/50‑99 (MQ=255) aaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTca > 1:1708373‑M2/48‑99 (MQ=255) gtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACaa < 2:1524167‑M2/55‑1 (MQ=255) gtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACaa < 1:939019‑M2/55‑1 (MQ=255) gtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACaa < 2:2205326‑M2/55‑1 (MQ=255) gtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACaa > 1:1445855‑M2/45‑99 (MQ=255) tgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAAt < 2:953418‑M2/56‑1 (MQ=255) tgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAAt < 1:1803258‑M2/56‑1 (MQ=255) aatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTc < 2:378635‑M2/58‑1 (MQ=255) aatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTc < 2:327295‑M2/58‑1 (MQ=255) atgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTcc > 1:2677901‑M2/41‑99 (MQ=255) acgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTcc > 1:550975‑M2/41‑99 (MQ=255) tgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCca < 1:22901‑M2/60‑1 (MQ=255) atgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCcaca < 1:365713‑M2/62‑1 (MQ=255) tgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCcacac > 1:1088858‑M2/37‑99 (MQ=255) tgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCcacac > 1:2337044‑M2/37‑99 (MQ=255) tagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACacaa > 2:751171‑M2/35‑99 (MQ=255) tCCCAGTCACGACGTTGTAAAACGACGGCCAGTGAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACacaa < 1:2789987/99‑1 (MQ=255) gccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACacaaca < 1:312241‑M2/67‑1 (MQ=255) gccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACacaaca < 2:1841276‑M2/67‑1 (MQ=255) gccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACacaaca > 2:1056003‑M2/33‑99 (MQ=255) gccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACacaaca < 2:2714329‑M2/67‑1 (MQ=255) gccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACacaaca < 1:695403‑M2/67‑1 (MQ=255) ccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACAt > 1:82536‑M2/32‑99 (MQ=255) cgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATa < 2:255039‑M2/69‑1 (MQ=255) cgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATa < 1:2534736‑M2/69‑1 (MQ=255) cgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATa < 2:800103‑M2/69‑1 (MQ=255) cgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATa < 1:1894598‑M2/69‑1 (MQ=255) cgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATGCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATGCCAAACAACATa < 2:2088573‑M2/69‑1 (MQ=255) gtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATAc < 1:1842105‑M2/70‑1 (MQ=255) caagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGa < 2:2353106‑M2/72‑1 (MQ=255) agttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGc > 2:1256468‑M2/26‑99 (MQ=255) gttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGcc < 2:1424753‑M2/75‑1 (MQ=255) ttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCg < 2:1946790‑M2/76‑1 (MQ=255) cataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAg > 1:1000958‑M2/20‑99 (MQ=255) ataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGc > 2:2439938‑M2/19‑99 (MQ=255) taattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCa > 2:1484048‑M2/18‑99 (MQ=255) aattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCAt < 2:903716‑M2/83‑1 (MQ=255) attggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATa > 2:1679239‑M2/16‑99 (MQ=255) attggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATa > 2:1575286‑M2/16‑99 (MQ=255) tggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATaaa < 2:2613274‑M2/86‑1 (MQ=255) ggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAg < 2:856573‑M2/87‑1 (MQ=255) gtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAgt < 2:1626066‑M2/88‑1 (MQ=255) gtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAgt < 2:2402378‑M2/88‑1 (MQ=255) taccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAgtg > 1:1298124‑M2/11‑99 (MQ=255) taccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAgtg > 1:1183011‑M2/11‑99 (MQ=255) taccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAgtg > 1:1391024‑M2/11‑99 (MQ=255) accgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAgtgt < 1:2631816‑M2/90‑1 (MQ=255) ccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTa > 1:1046533‑M2/9‑99 (MQ=255) ccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTa > 1:2026078‑M2/9‑99 (MQ=255) ccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTa < 1:1655142‑M2/91‑1 (MQ=255) agctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATGCGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAg < 2:2767356‑M2/94‑1 (MQ=255) gctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGc < 1:2482861‑M2/95‑1 (MQ=255) gctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGc < 2:1988766‑M2/95‑1 (MQ=255) ctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGcc > 1:1347257‑M2/4‑99 (MQ=255) tcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCt < 2:2245801‑M2/97‑1 (MQ=255) cGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTg < 2:1322049‑M2/98‑1 (MQ=255) cGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTg < 2:1212365‑M2/98‑1 (MQ=255) aaTTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTggg > 1:2178279/1‑99 (MQ=255) attcGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTgggg > 2:1790483/4‑99 (MQ=255) attcGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTgggg < 1:1143831/96‑1 (MQ=255) attcGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTgggg < 2:443702/96‑1 (MQ=255) attcGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTgggg < 1:1570567/96‑1 (MQ=255) attcGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTgggg > 2:2040693/4‑99 (MQ=255) ttcGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGt > 1:1983469/3‑99 (MQ=255) tAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGcc < 1:602970/99‑1 (MQ=255) tAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCt > 2:1377020/1‑99 (MQ=255) tAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCt < 1:653267/99‑1 (MQ=255) aaTCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTa > 1:2432261/1‑99 (MQ=255) aTCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTaa > 1:1934387/1‑99 (MQ=255) tCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTaa < 2:249776/99‑1 (MQ=255) | GCGAAAGGGGGATGTGCTGCAAGGCGATTAAGTTGGGTAACGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGACGTTGTAAAACGACGGCCAGTGAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGA > NC_000913/366202‑366397 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |