New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 71275 | 122 (1.190) | 4291 (44.020) +GCTC |
157/168 | NT | 97.6% | intergenic (+10/‑76) | araC/yabI | DNA‑binding transcriptional dual regulator AraC/DedA family protein YabI |
? | NC_000913 | 366286 = | 98 (0.960) | coding (20/3075 nt) | lacZ | beta‑galactosidase |
Only 100 of 5608 total aligned reads displayed.
ATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTTCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/71178‑71275 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTG > NC_000913/366286‑366384 |||| ATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAG < 1:802749/99‑1 TTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGC > 2:520599/1‑99 TTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGC > 1:1189235/1‑99 TTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGC > 2:296012/1‑99 TTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGC > 2:2267212/1‑99 AAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAA < 2:1604921/99‑1 AAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAA > 2:1088478/1‑99 AAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAA < 2:2736243/99‑1 AAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAAT > 2:2592689/1‑99 CCGGGGCCAGCCCGAGCGCGTTCCGTGCCGTTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAAT < 2:1403781/99‑1 CCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAAT < 1:1509988/99‑1 CCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAAT < 2:2101223/99‑1 GGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCA < 1:1566369/99‑1 GGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCA < 2:2539523/99‑1 GGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCA < 2:1139785/99‑1 GGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCA < 1:200292/99‑1 GGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT > 1:1851564/1‑99 CAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCATGtca < 1:2559467/99‑4 CAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCATGtca < 2:1035770/99‑4 CAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCATGtca < 2:460201/99‑4 CAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCATGtca < 1:1051152/99‑4 CAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCATGtca < 1:123790/99‑4 CCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAG < 1:2453693/99‑1 CCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAG < 2:807915/99‑1 CCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGC < 2:40995/99‑1 CCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGC < 2:1866438/99‑1 GAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTG > 1:913422/1‑99 GAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTG < 1:85679/99‑1 GCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTT < 2:351385/99‑1 GAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTC > 2:1506914/1‑99 AGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCC < 1:1666059/99‑1 GTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCT > 1:114784/1‑99 ttcCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTG > 2:903876/4‑99 ttcCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTG > 2:714269/4‑99 ttcCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTG < 1:2760724/96‑1 ttcCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTG > 1:573941/4‑99 GGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATT > 2:612104/1‑99 GTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTG > 2:2221343/1‑99 GTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTG > 1:721801/1‑99 TTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGT > 1:1288892/1‑99 TGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTT < 2:2423024/99‑1 TGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTT < 1:1712110/99‑1 TGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTAT < 1:1618377/99‑1 GAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATC < 1:1769819/99‑1 AAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCC < 1:326365/99‑1 AAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCC > 1:758788/1‑99 AAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCC < 1:2352373/99‑1 AAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTC > 2:165481/1‑99 AAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTA > 2:760350/1‑91 AAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCAC > 2:1355978/1‑99 GTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAA < 1:2656180/99‑1 GTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAA < 2:2059805/99‑1 TGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAAT > 1:1810872/1‑99 GAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATT < 2:1909738/99‑1 AATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTC < 1:2396181/99‑1 ATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCC > 1:1440447/1‑99 TGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCA > 2:1962485/1‑99 TGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCA > 1:627921/1‑99 GATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCAC < 1:372995/99‑1 ATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACA < 2:200341/99‑1 ATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACA < 2:2784056/99‑1 ATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACA > 2:564120/1‑99 TGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACAC > 1:976595/1‑99 TAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAA < 2:2636640/99‑1 TAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAA < 1:2511173/99‑1 TAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAA > 2:1242788/1‑99 CGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATA < 1:1956539/99‑1 CGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATA < 1:1095011/99‑1 CGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATA < 2:1190523/99‑1 CGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATA < 1:1343293/99‑1 GTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATAC > 2:2326753/1‑99 TCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACG > 1:2706872/1‑99 TCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACG > 1:478964/1‑99 TCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACG > 1:2251403/1‑99 TCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCCCACAATTCCACACAACATACG > 2:1810783/1‑99 AAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAG < 2:2160494/99‑1 AAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAG > 1:2607359/1‑99 TTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCG > 2:860944/1‑99 TTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCG > 1:2093723/1‑99 TCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAA < 1:2300253/99‑1 TCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAA > 2:2375879/1‑99 CATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAG > 1:1000958/1‑99 ATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGC > 1:423464/1‑99 TAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCA > 2:662464/1‑99 TAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCA < 1:2143503/99‑1 TAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCA < 2:1758101/99‑1 ATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATA > 2:1548121/1‑99 TGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAA < 1:1387777/99‑1 TGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAA < 2:1302892/99‑1 GGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAG < 1:2199836/99‑1 tacCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTG > 1:1905181/4‑99 tacCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTG > 2:1702244/4‑99 acctAGCTCGAATTCGTGATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGCGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGT > 2:1455443/5‑99 CGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAA < 1:2045389/99‑1 CGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAA > 2:2688730/1‑99 AGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAG > 1:531130/1‑99 GCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGC < 1:677858/99‑1 CTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCC > 1:2813225/1‑99 CTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCC < 2:2481177/99‑1 TCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCtt > 2:954399/1‑97 |||| ATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTTCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/71178‑71275 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTG > NC_000913/366286‑366384 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |