| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 71,272 | A→C | 100% | intergenic (+7/‑79) | araC → / → yabI | DNA‑binding transcriptional dual regulator AraC/DedA family protein YabI |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 71,272 | 0 | A | C | 97.5% | 18803.0 / 279.2 | 5189 | intergenic (+7/‑79) | araC/yabI | DNA‑binding transcriptional dual regulator AraC/DedA family protein YabI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (60/69); new base C (2557/2500); total (2619/2570) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.79e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 5194 total aligned reads displayed.
GAGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTTCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGAATCAGACAATTGACGGCTTGACGGAGTAGCATAGGGTTTGCAGAATCCCTGCTTCGTCCATTTGACAGGCACATTATGCAAGCATTGCTGGAACA > NC_000913/71174‑71370 | tATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGa > 1:2000735/1‑99 (MQ=255) tttAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTTCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGAAt < 2:85551/99‑1 (MQ=255) tttAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgc > 1:2655166‑M1/1‑97 (MQ=255) tttAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgc > 1:2299984‑M1/1‑97 (MQ=255) tttAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgc > 1:2092320‑M1/1‑97 (MQ=255) tttAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgc > 2:1184976‑M1/1‑97 (MQ=255) tttAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgc > 2:169490‑M1/1‑97 (MQ=255) tttAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgc > 1:1195694‑M1/1‑97 (MQ=255) ttAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgct > 1:973644‑M1/1‑96 (MQ=255) aaaaTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaa < 2:2211460‑M1/99‑8 (MQ=255) aaaTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaat < 2:2307146‑M1/99‑9 (MQ=255) aaaTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaat > 1:715432‑M1/1‑91 (MQ=255) aaTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaatt < 1:2707993‑M1/99‑10 (MQ=255) aTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattc < 2:1851791‑M1/99‑11 (MQ=255) ggggCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatca < 2:2357422‑M1/99‑18 (MQ=255) ggggCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatca < 1:2811439‑M1/99‑18 (MQ=255) ggggCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatca < 2:1804652‑M1/99‑18 (MQ=255) ggggCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatca < 2:246009‑M1/99‑18 (MQ=255) gggCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcat < 1:2040641‑M1/99‑19 (MQ=255) gggCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcat > 2:598790‑M1/1‑81 (MQ=255) gCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgt > 2:1029586‑M1/1‑79 (MQ=255) ccAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtc < 1:1764066‑M1/99‑22 (MQ=255) ccAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTGGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtc > 1:901224‑M1/1‑78 (MQ=255) cAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtca < 2:1645546‑M1/99‑23 (MQ=255) cAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtca < 1:2559467‑M1/99‑23 (MQ=255) cAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtca < 1:123790‑M1/99‑23 (MQ=255) aGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcat > 1:185162‑M1/1‑76 (MQ=255) aGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcat > 2:1996919‑M1/1‑76 (MQ=255) aGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcat < 2:1354914‑M1/99‑24 (MQ=255) ccGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagc < 2:2404633‑M1/99‑27 (MQ=255) gcgagTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtt < 2:2679960‑M1/99‑31 (MQ=255) gagTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttc > 1:2141427‑M1/1‑67 (MQ=255) agTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcc < 1:2515434‑M1/99‑34 (MQ=255) gttccgtgcCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcct < 1:1053729‑M1/95‑35 (MQ=255) ttccgtgCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctg > 1:1284602‑M1/4‑64 (MQ=255) ttccgtgCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctg > 1:573941‑M1/4‑64 (MQ=255) tccgtGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgt < 2:2251695‑M1/97‑37 (MQ=255) tGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtga > 1:1811910‑M1/1‑59 (MQ=255) tGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtga > 2:195442‑M1/1‑59 (MQ=255) tGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtga > 1:855774‑M1/1‑59 (MQ=255) ccGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaa < 2:1595261‑M1/99‑43 (MQ=255) ccGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaa < 1:527210‑M1/99‑43 (MQ=255) cGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaat < 2:388324‑M1/99‑44 (MQ=255) ggTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaatt < 2:2575408‑M1/99‑45 (MQ=255) gTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattg > 1:1379554‑M1/1‑54 (MQ=255) gTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattg > 2:703408‑M1/1‑54 (MQ=255) ttGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgt > 2:649314‑M1/1‑53 (MQ=255) gtgAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgtta > 1:1430352‑M1/1‑51 (MQ=255) tgAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttat < 1:477923‑M1/99‑50 (MQ=255) gaagaaAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatc < 2:2776103‑M1/99‑51 (MQ=255) aagaaAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatcc < 1:326365‑M1/99‑52 (MQ=255) aagaaAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatcc < 1:2352373‑M1/99‑52 (MQ=255) agaaAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccg > 1:1543180‑M1/1‑47 (MQ=255) agaaAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccg > 2:1500616‑M1/1‑47 (MQ=255) agaaAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccg > 2:284342‑M1/1‑47 (MQ=255) agaaAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccg > 1:375186‑M1/1‑47 (MQ=255) agaaAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccg > 1:753491‑M1/1‑47 (MQ=255) aaaaaGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgct > 1:2455621‑M1/1‑45 (MQ=255) aaaaaGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgct > 1:2398202‑M1/1‑45 (MQ=255) aaGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcac > 1:2246738‑M1/1‑42 (MQ=255) gTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaa < 2:2729272‑M1/99‑60 (MQ=255) gTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaa < 2:2095246‑M1/99‑60 (MQ=255) gTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaa < 1:1905844‑M1/99‑60 (MQ=255) gTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaa < 2:1134571‑M1/99‑60 (MQ=255) gTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaa < 1:801318‑M1/99‑60 (MQ=255) aaTGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGAATCAGACAATTGACGGCTTGACGGAGTAGCATAGGGTTTGCAGAATCCCTGCTTCGTCCAtt > 1:629673/1‑99 (MQ=255) tgatgTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattcca < 1:1337074‑M1/99‑65 (MQ=255) gatgTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccac > 1:674487‑M1/1‑34 (MQ=255) atgTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccaca > 2:901971‑M1/1‑33 (MQ=255) atgTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccaca > 1:426956‑M1/1‑33 (MQ=255) atgTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccaca < 2:2054024‑M1/99‑67 (MQ=255) tAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaa > 2:751171‑M1/1‑30 (MQ=255) tAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaa > 2:1085559‑M1/1‑30 (MQ=255) gCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaaca < 2:1546418‑M1/99‑72 (MQ=255) gCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaaca > 1:1609527‑M1/1‑28 (MQ=255) cGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacata < 2:1901597‑M1/99‑74 (MQ=255) cGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacata < 1:1956539‑M1/99‑74 (MQ=255) cGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacata < 1:1099710‑M1/99‑74 (MQ=255) tCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacg > 1:1148355‑M1/1‑24 (MQ=255) tCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacg > 2:2623567‑M1/1‑24 (MQ=255) tCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacg > 1:2760193‑M1/1‑24 (MQ=255) tCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacg > 1:1486630‑M1/1‑24 (MQ=255) tCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacg > 1:2197340‑M1/1‑24 (MQ=255) cAAGTTGTCATAATTGGTAACGAATCAGACAATTGACGGCTTGACGGAGTAGCATAGGGTTTGCAGAATCCCTGCTTCGTCCATTTGACAGGCACATTa < 2:1449884/99‑1 (MQ=255) aaGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgag < 2:2150001‑M1/99‑78 (MQ=255) aaGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgag > 2:54928‑M1/1‑22 (MQ=255) aGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagc < 1:1709073‑M1/99‑79 (MQ=255) ttGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccg < 1:1652642‑M1/99‑81 (MQ=255) tCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaa < 2:342802‑M1/99‑84 (MQ=255) tCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaa > 2:80465‑M1/1‑16 (MQ=255) cATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaag > 1:1000958‑M1/1‑15 (MQ=255) aTAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagc > 2:1292596‑M1/1‑14 (MQ=255) tAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagca < 2:50339‑M1/99‑87 (MQ=255) tAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagca > 1:2605346‑M1/1‑13 (MQ=255) tAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagca > 2:1239212‑M1/1‑13 (MQ=255) tAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagca > 2:1748168‑M1/1‑13 (MQ=255) tAATTGGTAACGAATCAGACAATTGACGGCTTGACGGAGTAGCATAGGGTTTGCAGAATCCCTGCTTCGTCCATTTGACAGGCACATTATGCAAGCAtt > 2:443673/1‑99 (MQ=255) aaTTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcat > 2:952156‑M1/1‑12 (MQ=255) tGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcataaa < 2:1403306‑M1/99‑91 (MQ=255) ggTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcataaag < 2:2522077‑M1/99‑92 (MQ=255) | GAGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTTCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGAATCAGACAATTGACGGCTTGACGGAGTAGCATAGGGTTTGCAGAATCCCTGCTTCGTCCATTTGACAGGCACATTATGCAAGCATTGCTGGAACA > NC_000913/71174‑71370 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |