| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 71275 | 134 (1.190) | 19692 (181.800) +GCTC |
177/188 | -0.0 | 99.4% | intergenic (+10/‑76) | araC/yabI | DNA‑binding transcriptional dual regulator AraC/DedA family protein YabI |
| ? | NC_000913 | 366286 = | 125 (1.110) | coding (20/3075 nt) | lacZ | beta‑galactosidase | |||||
Only 100 of 21000 total aligned reads displayed.
GTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTTCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGAATCAGACAATTGACGGCTTGACGGAGTAGCATAGGGTTTGCAGAATCCCTGCTTCGTCCATTTGACAGGCACATTATGCAAGCATTGCTGGAACACTT > NC_000913/71176‑71373 | tATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGa > 1:552707/1‑99 (MQ=255) tttAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgc > 1:225379‑M1/1‑97 (MQ=255) tttAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgc > 2:2853478‑M1/1‑97 (MQ=255) tAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctc < 1:1646935‑M1/99‑5 (MQ=255) aaaaaTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcga > 1:2524848‑M1/1‑93 (MQ=255) aaaaaTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcga > 2:2577666‑M1/1‑93 (MQ=255) aaaaTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaa > 1:3066910‑M1/1‑92 (MQ=255) aaaaTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaa > 2:3040349‑M1/1‑92 (MQ=255) aaaTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaat < 1:1435880‑M1/99‑9 (MQ=255) aaaTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaat > 1:2846854‑M1/1‑91 (MQ=255) aaTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaatt > 1:1820252‑M1/1‑90 (MQ=255) aTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattc < 2:1281120‑M1/99‑11 (MQ=255) aTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattc > 1:1380810‑M1/1‑89 (MQ=255) aTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattc > 2:472565‑M1/1‑89 (MQ=255) aTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattc < 1:1702922‑M1/99‑11 (MQ=255) aTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattc > 2:1394390‑M1/1‑89 (MQ=255) tGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcg < 2:827125‑M1/99‑12 (MQ=255) ccGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaat > 1:2359430‑M1/1‑84 (MQ=255) ccGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaat > 2:2241139‑M1/1‑84 (MQ=255) cGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatc < 1:947781‑M1/99‑17 (MQ=255) ggggCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatca < 2:599137‑M1/99‑18 (MQ=255) ggggCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatca < 2:1455277‑M1/99‑18 (MQ=255) gggCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcat > 1:1000174‑M1/1‑81 (MQ=255) ggCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatg < 2:2296757‑M1/99‑20 (MQ=255) ggCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatg > 2:532758‑M1/1‑80 (MQ=255) gCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgt < 2:313728‑M1/99‑21 (MQ=255) gCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgt > 2:362449‑M1/1‑79 (MQ=255) cAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtca < 1:246874‑M1/99‑23 (MQ=255) aGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcat > 2:1742611‑M1/1‑76 (MQ=255) gCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcata < 2:1335348‑M1/99‑25 (MQ=255) gCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcata > 2:2405784‑M1/1‑75 (MQ=255) cctggcgggttccGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCACGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagc < 2:765612‑M1/95‑27 (MQ=255) ccGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagc > 1:609290‑M1/1‑73 (MQ=255) gagcgagTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctg < 1:440604‑M1/99‑29 (MQ=255) agcgagTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgt > 2:2019740‑M1/1‑70 (MQ=255) agcgagTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgt > 2:942590‑M1/1‑70 (MQ=255) agTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcc < 1:2627882‑M1/99‑34 (MQ=255) agTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcc < 2:1691318‑M1/99‑34 (MQ=255) gTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcct > 1:241390‑M1/1‑65 (MQ=255) gTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcct > 2:414790‑M1/1‑65 (MQ=255) gTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcct > 1:1486468‑M1/1‑65 (MQ=255) ttccgtgCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctg > 1:2197922‑M1/4‑64 (MQ=255) ccGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaa < 2:1221550‑M1/99‑43 (MQ=255) ccGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaa < 1:894466‑M1/99‑43 (MQ=255) gTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattg < 1:1219119‑M1/99‑46 (MQ=255) ttGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgt < 2:2353322‑M1/99‑47 (MQ=255) gtgAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgtta < 1:10502‑M1/99‑49 (MQ=255) gtgAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgtta < 2:2921617‑M1/99‑49 (MQ=255) gaagaaAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatc < 2:18533‑M1/99‑51 (MQ=255) gaagaaAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatc < 1:1325258‑M1/99‑51 (MQ=255) aagaaAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatcc < 2:2517165‑M1/99‑52 (MQ=255) gaaAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgc > 2:2748410‑M1/1‑46 (MQ=255) gaaAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgc < 2:100790‑M1/99‑54 (MQ=255) gaaAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgc < 1:1159166‑M1/99‑54 (MQ=255) aaaaGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctc > 2:1964619‑M1/1‑44 (MQ=255) aaaGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctca < 1:2895650‑M1/99‑57 (MQ=255) aaaGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctca > 2:2463846‑M1/1‑43 (MQ=255) gTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaa < 1:1878908‑M1/99‑60 (MQ=255) gTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaa > 1:1272659‑M1/1‑40 (MQ=255) tGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaat > 1:2742795‑M1/1‑39 (MQ=255) gAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaatt > 1:1935915‑M1/1‑38 (MQ=255) aaTGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattc < 1:2307651‑M1/99‑63 (MQ=255) aaTGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattc > 2:1112789‑M1/1‑37 (MQ=255) atgTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccaca < 1:1590441‑M1/99‑67 (MQ=255) aGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaac < 2:1578026‑M1/99‑71 (MQ=255) aGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaac < 1:667081‑M1/99‑71 (MQ=255) gCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaaca < 1:499407‑M1/99‑72 (MQ=255) gCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaaca > 2:2802987‑M1/1‑28 (MQ=255) gCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaaca < 2:269277‑M1/99‑72 (MQ=255) gCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaaca > 1:2948484‑M1/1‑28 (MQ=255) cGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacata < 1:1537960‑M1/99‑74 (MQ=255) cGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacata < 1:1987959‑M1/99‑74 (MQ=255) gTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatac > 1:832992‑M1/1‑25 (MQ=255) gTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatac > 1:2041786‑M1/1‑25 (MQ=255) tCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacg > 1:2574389‑M1/1‑24 (MQ=255) tCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacg > 1:782064‑M1/1‑24 (MQ=255) aaGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgag < 2:179872‑M1/99‑78 (MQ=255) aGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagc > 2:29799‑M1/1‑21 (MQ=255) aGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaactgttatccgctcacaattccacacaacatacgagc > 2:2073419‑M1/1‑21 (MQ=255) aGTTGTCATAATTGGTACCAAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagc > 2:2189960‑M1/1‑21 (MQ=255) tCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaa > 2:2128423‑M1/1‑16 (MQ=255) aTAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagc > 1:2144239‑M1/1‑14 (MQ=255) tAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagca < 1:382472‑M1/99‑87 (MQ=255) aTTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcata < 1:2793609‑M1/99‑89 (MQ=255) aTTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcata > 2:1517314‑M1/1‑11 (MQ=255) ttGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcataa > 1:3005336‑M1/1‑10 (MQ=255) ttGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcataa < 1:1104426‑M1/99‑90 (MQ=255) ttGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcataa < 1:1761480‑M1/99‑90 (MQ=255) tGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcataaa < 2:1636488‑M1/99‑91 (MQ=255) tGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcataaa > 2:711065‑M1/1‑9 (MQ=255) ggTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgttccctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcataaag < 2:65568‑M1/99‑92 (MQ=255) gtaccgagctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcataaagt < 1:720275‑M1/95‑93 (MQ=255) taccgagctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcataaagtg > 2:1912504‑M1/4‑6 (MQ=255) cGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcataaagtgtaa > 2:1059835‑M1/1‑3 (MQ=255) gAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcataaagtgtaaa < 2:2632038‑M1/99‑98 (MQ=255) gAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcataaagtgtaaa < 2:887228‑M1/99‑98 (MQ=255) gAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcataaagtgtaaa < 1:2688671‑M1/99‑98 (MQ=255) agctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcataaagtgtaaag < 1:2093621‑M1/99‑99 (MQ=255) agctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcataaagtgtaaag > 1:325173‑M1/1‑1 (MQ=255) agctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcataaagtgtaaag < 2:1164927‑M1/99‑99 (MQ=255) | GTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTTCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGAATCAGACAATTGACGGCTTGACGGAGTAGCATAGGGTTTGCAGAATCCCTGCTTCGTCCATTTGACAGGCACATTATGCAAGCATTGCTGGAACACTT > NC_000913/71176‑71373 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |