New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 71275 | 119 (1.310) | 17605 (201.990) +GCTC |
177/188 | -0.0 | 99.4% | intergenic (+10/‑76) | araC/yabI | DNA‑binding transcriptional dual regulator AraC/DedA family protein YabI |
? | NC_000913 | 366286 = | 96 (1.060) | coding (20/3075 nt) | lacZ | beta‑galactosidase |
Only 100 of 19159 total aligned reads displayed.
ATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTTCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/71178‑71275 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTG > NC_000913/366286‑366384 |||| ATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAG < 1:892093/99‑1 TTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGC > 2:95539/1‑99 TTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGC < 1:360903/99‑1 TTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGC < 1:1728945/99‑1 TTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGC > 1:1685329/1‑99 TTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCT < 2:1614940/99‑1 AAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAA > 1:1454713/1‑99 AAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAA < 1:1551070/99‑1 AAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGGATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAAT > 2:2141036/1‑99 AAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAAT < 2:1756264/99‑1 AATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATt < 2:2275501/99‑2 ATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATtc < 1:2506366/99‑3 ATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATtc > 2:297785/1‑97 TGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCG < 1:705227/99‑1 CACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTA > 2:2092598/1‑99 ACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAA < 2:863347/99‑1 ACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAA > 2:346001/1‑99 CCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAAT < 1:177793/99‑1 CGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATC < 1:114598/99‑1 GGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCA < 2:1216674/99‑1 GGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCA < 2:1942705/99‑1 GGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCA < 1:490610/99‑1 GGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCATG < 2:125776/99‑1 GGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCATG < 1:753611/99‑1 GCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCATGt > 1:1958777/1‑98 GCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCATGt < 2:1167796/99‑2 GCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCATGt < 2:2232514/99‑2 CAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCATGtca > 2:1074604/1‑96 CAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCATGtca < 2:2489612/99‑4 GCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATA > 1:984129/1‑99 GCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATA > 1:1415958/1‑99 GCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATA > 1:2001456/1‑99 CCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGC < 2:905925/99‑1 CCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGC < 2:444739/99‑1 GAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTG > 1:1240828/1‑99 GCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTT < 2:2044913/99‑1 GCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTT < 2:1576121/99‑1 GCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTT < 2:1487313/99‑1 GCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTT < 1:2462892/99‑1 GAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTC > 1:660187/1‑99 AGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGATCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCC < 2:1441583/99‑1 AGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCC > 2:1393238/1‑99 AGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCC > 1:448564/1‑99 GTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCCAGTTGTCATAATTGGTATCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCT > 2:1846782/1‑99 GTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCT > 1:1100866/1‑99 ttcCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTG > 2:1799380/4‑99 ttcCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTG > 1:1282209/4‑99 CGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGT < 2:1896872/99‑1 CGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGT < 1:1000780/99‑1 CGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGT > 2:491503/1‑99 CCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAA < 2:2533358/99‑1 CCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAA < 2:780484/99‑1 CGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAAT < 1:312741/99‑1 TTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGT > 1:575933/1‑99 TGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTAT > 1:84867/1‑99 TGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTAT > 1:797712/1‑99 GAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATC < 2:1713016/99‑1 GAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATC > 1:616548/1‑99 GAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGC < 1:1050108/99‑1 AAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTC > 1:2229238/1‑99 AAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTC > 1:1501443/1‑99 AAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCAC > 2:130257/1‑99 GTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAA > 2:821949/1‑99 TGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAAT < 1:191307/99‑1 TGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAAT > 1:2377429/1‑99 TGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAAT < 2:1534919/99‑1 TGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAAT > 2:631986/1‑99 GAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATT > 1:1324547/1‑99 ATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCC < 2:1349094/99‑1 TGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCA > 2:2446098/1‑99 GATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCAC > 1:1195261/1‑99 GATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCAC < 1:2417937/99‑1 TAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAA < 2:1665295/99‑1 AGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAAC > 2:2404610/1‑99 GCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACA > 2:535223/1‑99 CCGTGAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACAT > 2:2365459/1‑99 CCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACAT > 1:159503/1‑99 TCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTATTCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACG < 1:2045180/99‑1 TCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACG > 2:1122540/1‑99 AAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAG < 2:395612/99‑1 AGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGC < 2:584219/99‑1 AGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGC > 1:1826595/1‑99 TTGTCATAATTGGTACCGAGCGCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCG > 2:683436/1‑99 TCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAA < 1:2332723/99‑1 CATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAG < 1:940431/99‑1 ATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGC > 1:2088163/1‑99 TTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAA < 1:534716/99‑1 TTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAA > 1:404990/1‑99 TGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAA < 2:1993503/99‑1 GTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGT > 1:2183425/1‑99 GTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGT > 1:1641123/1‑99 cCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTA > 1:213357/2‑99 cCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTA > 2:218657/2‑99 cCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTA > 2:734529/2‑99 CGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAA > 1:2277202/1‑99 AGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAG < 1:1368770/99‑1 GCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGC < 2:231836/99‑1 GCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGC < 1:26437/99‑1 TCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCT > 1:1870357/1‑99 TCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCT > 2:1027430/1‑99 |||| ATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTTCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/71178‑71275 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTG > NC_000913/366286‑366384 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |