| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 71,272 | A→C | 91.4% | intergenic (+7/‑79) | araC → / → yabI | DNA‑binding transcriptional dual regulator AraC/DedA family protein YabI |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 71,272 | 0 | A | C | 91.4% | 3306.5 / 225.8 | 903 | intergenic (+7/‑79) | araC/yabI | DNA‑binding transcriptional dual regulator AraC/DedA family protein YabI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (41/37); new base C (401/424); total (442/461) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.54e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.79e-01 | |||||||||||
Only 100 of 907 total aligned reads displayed.
GAGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTTCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGAATCAGACAATTGACGGCTTGACGGAGTAGCATAGGGTTTGCAGAATCCCTGCTTCGTCCATTTGACAGGCACATTATGCAAGCATTGCTGGAACA > NC_000913/71174‑71370 | tATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGa > 2:230458/1‑99 (MQ=255) aTTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAg < 2:1377744‑M1/99‑2 (MQ=255) aTTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAg > 1:576103‑M1/1‑98 (MQ=255) aaaaTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTTCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGAATCAGAc < 2:658276/99‑1 (MQ=255) aaaaTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaa > 1:136155‑M1/1‑92 (MQ=255) aaaaTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaa < 2:585616‑M1/99‑8 (MQ=255) aaaaTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaa < 1:1350178‑M1/99‑8 (MQ=255) aaaTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaat < 2:1024209‑M1/99‑9 (MQ=255) aaaTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaat > 2:1274227‑M1/1‑91 (MQ=255) aaTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaatt < 1:1379171‑M1/99‑10 (MQ=255) aaTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaatt < 2:540079‑M1/99‑10 (MQ=255) aaTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaatt > 1:20560‑M1/1‑90 (MQ=255) aTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattc > 1:524394‑M1/1‑89 (MQ=255) gCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgt < 2:379933‑M1/99‑13 (MQ=255) aCCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaa < 1:681164‑M1/99‑15 (MQ=255) aCCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaa < 1:1078566‑M1/99‑15 (MQ=255) ggggCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatca < 1:539532‑M1/99‑18 (MQ=255) ggggCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatca < 1:397145‑M1/99‑18 (MQ=255) ggggCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatca < 1:732647‑M1/99‑18 (MQ=255) ggggCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatca < 2:1468606‑M1/99‑18 (MQ=255) ggggCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatca < 1:1166027‑M1/99‑18 (MQ=255) gggCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcat < 1:987345‑M1/99‑19 (MQ=255) gggCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcat < 1:558969‑M1/99‑19 (MQ=255) ggCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatg < 1:1032168‑M1/99‑20 (MQ=255) ccAGCCCGAGCGAGTTTCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGAATCAGACAATTGACGGCTTGa < 1:254560/99‑1 (MQ=255) cAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtca < 2:1074335‑M1/99‑23 (MQ=255) cAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtca < 1:969206‑M1/99‑23 (MQ=255) aGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcat > 2:476255‑M1/1‑76 (MQ=255) aGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcat < 2:718493‑M1/99‑24 (MQ=255) gCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcata > 1:1270002‑M1/1‑75 (MQ=255) gCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcata > 2:1168251‑M1/1‑75 (MQ=255) ccGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagc < 1:917175‑M1/99‑27 (MQ=255) cgagcgagTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagct > 1:1251424‑M1/1‑72 (MQ=255) gagcgagTTTCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGAATCAGACAATTGACGGCTTGACGGAGTa < 1:754751/99‑1 (MQ=255) gagcgagTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctg < 2:125843‑M1/99‑29 (MQ=255) agcgagTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgt > 2:303275‑M1/1‑70 (MQ=255) gcgagTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtt < 2:606236‑M1/99‑31 (MQ=255) gcgagTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtt < 2:1343547‑M1/99‑31 (MQ=255) gcgagTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtt > 1:320405‑M1/1‑69 (MQ=255) gcgagTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtt < 2:888804‑M1/99‑31 (MQ=255) gcgagTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtt < 2:808005‑M1/99‑31 (MQ=255) cgagTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgttt > 1:1056284‑M1/1‑68 (MQ=255) gagTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttc < 2:1447859‑M1/99‑33 (MQ=255) gagTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTAAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttc < 2:344170‑M1/99‑33 (MQ=255) agTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcc < 2:770233‑M1/99‑34 (MQ=255) agTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcc < 2:455968‑M1/99‑34 (MQ=255) gttccgtgcCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcct < 1:357408‑M1/95‑35 (MQ=255) gttccgtgcCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcct < 2:911680‑M1/95‑35 (MQ=255) ttccgtgCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctg < 1:1149972‑M1/96‑36 (MQ=255) ttccgtgCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctg > 1:603613‑M1/4‑64 (MQ=255) ccgTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtg < 2:50122‑M1/98‑38 (MQ=255) ccgTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtg < 1:1437924‑M1/98‑38 (MQ=255) tGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtga < 2:1104901‑M1/99‑41 (MQ=255) gCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaa < 2:1403361‑M1/99‑42 (MQ=255) gCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaataatgtcatagctgtttcctgtgtgaa > 1:64504‑M1/1‑58 (MQ=255) ccGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaa < 1:165940‑M1/99‑43 (MQ=255) ccGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaa < 1:432964‑M1/99‑43 (MQ=255) cGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaat < 1:1406088‑M1/99‑44 (MQ=255) gTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattg < 1:148635‑M1/99‑46 (MQ=255) gTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattg > 2:1218481‑M1/1‑54 (MQ=255) ttGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgcccgaactcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgt > 2:183617‑M1/1‑53 (MQ=255) tgtgAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgtt > 2:97648‑M1/1‑52 (MQ=255) gtgAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgtta > 1:889797‑M1/1‑51 (MQ=255) gaagaaAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatc < 2:934708‑M1/99‑51 (MQ=255) agaaAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccg > 2:269907‑M1/1‑47 (MQ=255) gaaAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgc > 1:184740‑M1/1‑46 (MQ=255) aaaaaGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgct > 1:1015746‑M1/1‑45 (MQ=255) aaaaaGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgct > 2:25224‑M1/1‑45 (MQ=255) aaaaGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGAATCAGACAATTGACGGCTTAACGGAGTAGCATAGGGTTTGCAGAATCCCTGCTTc > 1:1329335/1‑99 (MQ=255) aaGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcac < 2:856203‑M1/99‑58 (MQ=255) gTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaa < 1:833718‑M1/99‑60 (MQ=255) gTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaa < 2:431332‑M1/99‑60 (MQ=255) gTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaa < 1:1128544‑M1/99‑60 (MQ=255) gTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaa < 2:643899‑M1/99‑60 (MQ=255) gTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaa < 1:710851‑M1/99‑60 (MQ=255) gTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaa > 1:1222509‑M1/1‑40 (MQ=255) gTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaa > 2:1129447‑M1/1‑40 (MQ=255) tGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaat > 2:566290‑M1/1‑39 (MQ=255) tGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaat < 2:1314208‑M1/99‑61 (MQ=255) aaTGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattc < 2:124493‑M1/99‑63 (MQ=255) aaTGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGAATCAGACAATTGACGGCTTGACGGAGTAGCATAGGGTTTGCAGAATCCCTGCTTCGTCCAtt > 2:750683/1‑99 (MQ=255) atgatgTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGAATCAGACAATTGACGGCTTGACGGAGTAGCATAGGGTTTGCAGAATCCCTGCTTCGTCCAttt < 1:286716/99‑1 (MQ=255) tgatgTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattcca > 2:1200086‑M1/1‑35 (MQ=255) tgatgTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattcca > 1:802414‑M1/1‑35 (MQ=255) gCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaaca < 2:1052351‑M1/99‑72 (MQ=255) cGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacata < 1:499170‑M1/99‑74 (MQ=255) cGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacata < 1:861563‑M1/99‑74 (MQ=255) gTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatac > 1:228950‑M1/1‑25 (MQ=255) aaGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgag > 2:158290‑M1/1‑22 (MQ=255) aGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagc < 2:365368‑M1/99‑79 (MQ=255) ttGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccg > 1:778466‑M1/1‑19 (MQ=255) cATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaag > 1:1198848‑M1/1‑15 (MQ=255) aTAATTGGTAACGAATCAGACAATTGACGGCTTGACGGAGTAGCATAGGGTTTGCAGAATCCCTGCTTCGTCCATTTGACAGGCACATTATGCAAGCAt < 1:1314425/99‑1 (MQ=255) tAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagca > 2:690931‑M1/1‑13 (MQ=255) gaatTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagca < 2:411419‑M1/98‑87 (MQ=255) aaTTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcat < 1:4678‑M1/99‑88 (MQ=255) aaTTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcat > 1:1293899‑M1/1‑12 (MQ=255) aTTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcata > 2:825576‑M1/1‑11 (MQ=255) tGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcataaa < 1:935131‑M1/99‑91 (MQ=255) gTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcataaagt < 1:1101340‑M1/99‑93 (MQ=255) | GAGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTTCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGAATCAGACAATTGACGGCTTGACGGAGTAGCATAGGGTTTGCAGAATCCCTGCTTCGTCCATTTGACAGGCACATTATGCAAGCATTGCTGGAACA > NC_000913/71174‑71370 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |