| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 366,290 | C→T | 100% | D6N (GAT→AAT) | lacZ ← | beta‑galactosidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 366,290 | 0 | C | T | 98.5% | 22968.6 / 129.3 | 6281 | D6N (GAT→AAT) | lacZ | beta‑galactosidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (38/62); new base T (3014/3163); total (3054/3227) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.42e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 6283 total aligned reads displayed.
CGCCAGCTGGCGAAAGGGGGATGTGCTGCAAGGCGATTAAGTTGGGTAACGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGACGTTGTAAAACGACGGCCAGTGAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGT > NC_000913/366193‑366388 | gcaccggggccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGt < 2:589590‑M2/8‑1 (MQ=255) accggggccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTaa < 1:1816261‑M2/10‑1 (MQ=255) ccggggccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAAt < 1:301803‑M2/11‑1 (MQ=255) ccggggccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAAt < 2:1253887‑M2/11‑1 (MQ=255) ggggccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCa < 1:1735559‑M2/13‑1 (MQ=255) ggggccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCa < 1:1646115‑M2/13‑1 (MQ=255) ggggccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCa < 1:1596609‑M2/13‑1 (MQ=255) gggccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAt > 2:1932794‑M2/86‑99 (MQ=255) gccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAtgt > 1:2184209‑M2/84‑98 (MQ=255) gccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAtgt > 2:49846‑M2/84‑98 (MQ=255) ccagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCatgtc < 2:1542153‑M2/17‑3 (MQ=255) cagcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATcatgtca < 1:2354652‑M2/18‑4 (MQ=255) agcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAAtcatgtcat > 1:910271‑M2/81‑95 (MQ=255) agcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAAtcatgtcat > 1:129778‑M2/81‑95 (MQ=255) gcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATa > 2:1884068‑M2/80‑99 (MQ=255) gcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATa < 1:1256782‑M2/20‑1 (MQ=255) gcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATa > 1:1425493‑M2/80‑99 (MQ=255) gcccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATa > 1:1045512‑M2/80‑99 (MQ=255) cccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAg < 2:1592208‑M2/21‑1 (MQ=255) cccgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAg < 1:2142258‑M2/21‑1 (MQ=255) cgagcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCt > 1:1776564‑M2/77‑99 (MQ=255) agcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGt > 2:2406338‑M2/75‑99 (MQ=255) agcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGt < 1:439196‑M2/25‑1 (MQ=255) agcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGt > 2:676249‑M2/75‑99 (MQ=255) agcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGt > 1:1562833‑M2/75‑99 (MQ=255) gcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGtt < 1:1384674‑M2/26‑1 (MQ=255) gcgagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGtt < 1:1516687‑M2/26‑1 (MQ=255) gagttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTc < 2:301810‑M2/28‑1 (MQ=255) agttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTcc > 2:1753318‑M2/71‑99 (MQ=255) gttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCt < 2:2028409‑M2/30‑1 (MQ=255) ttccgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCtg > 1:1906616‑M2/69‑99 (MQ=255) cgtgccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgaaggcgacaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑ATCATAGCTGTTTCCtgtgt < 2:952070‑M2/34‑1 (MQ=255) gccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGaa < 1:651202‑M2/37‑1 (MQ=255) ccggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGaaa < 1:529296‑M2/38‑1 (MQ=255) cGATTAAGTTGGGTAACGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGACGTTGTAAAACGACGGCCAGTGAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGaaa < 1:984373/99‑1 (MQ=255) ggttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAAtt > 1:1000972‑M2/60‑99 (MQ=255) gttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTg > 2:400561‑M2/59‑99 (MQ=255) ttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGt > 2:262022‑M2/58‑99 (MQ=255) ttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGt < 2:1842341‑M2/42‑1 (MQ=255) ttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGt > 1:2263927‑M2/58‑99 (MQ=255) ttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGt < 1:949661‑M2/42‑1 (MQ=255) ttgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattgctaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGt < 2:815002‑M2/42‑1 (MQ=255) tgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGtt < 2:721161‑M2/43‑1 (MQ=255) tgtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGtt < 2:2304657‑M2/43‑1 (MQ=255) gtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTa < 1:394197‑M2/44‑1 (MQ=255) gtgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTa < 2:234885‑M2/44‑1 (MQ=255) tgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTAt < 1:2096086‑M2/45‑1 (MQ=255) tgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTAt > 2:1336651‑M2/55‑99 (MQ=255) tgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTAt > 1:73391‑M2/55‑99 (MQ=255) tgaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTAt > 1:826095‑M2/55‑99 (MQ=255) gaagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATc > 1:121989‑M2/54‑99 (MQ=255) aagaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATcc > 2:1430962‑M2/53‑99 (MQ=255) gaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGc > 1:1144263‑M2/51‑99 (MQ=255) gaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGc < 1:59846‑M2/49‑1 (MQ=255) gaaaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGc > 2:910717‑M2/51‑99 (MQ=255) aaaagtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTc > 1:24014‑M2/49‑99 (MQ=255) agtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTcaca > 2:1164571‑M2/46‑99 (MQ=255) gtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACaa > 2:1643559‑M2/45‑99 (MQ=255) gtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACaa < 1:1473908‑M2/55‑1 (MQ=255) gtgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACaa < 2:225811‑M2/55‑1 (MQ=255) tgaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAAt < 1:1182783‑M2/56‑1 (MQ=255) gaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAAtt < 2:1293951‑M2/57‑1 (MQ=255) gaatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAAtt < 1:1952175‑M2/57‑1 (MQ=255) aatgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTc > 2:2449109‑M2/42‑99 (MQ=255) atgatgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTcc > 2:1078284‑M2/41‑99 (MQ=255) ggTTTTCCCAGTCACGACGTTGTAAAACGACGGCCAGTGAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCca > 2:112620/1‑99 (MQ=255) atgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCcaca < 1:774762‑M2/62‑1 (MQ=255) atgtagccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCcaca < 2:2116473‑M2/62‑1 (MQ=255) gccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACacaaca < 2:1799584‑M2/67‑1 (MQ=255) gccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACacaaca < 1:1689397‑M2/67‑1 (MQ=255) gccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACacaaca < 1:87031‑M2/67‑1 (MQ=255) ccgtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACAt > 1:2223452‑M2/32‑99 (MQ=255) gtcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATAc < 1:562904‑M2/70‑1 (MQ=255) tcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACg > 1:1855176‑M2/29‑99 (MQ=255) tcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACg > 1:695169‑M2/29‑99 (MQ=255) tcaagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACg > 2:1030270‑M2/29‑99 (MQ=255) aagttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATACGCTCACAATTCCACACAACATACGAg > 1:2306307‑M2/27‑99 (MQ=255) agttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGc < 2:1719781‑M2/74‑1 (MQ=255) agttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGc < 2:2202053‑M2/74‑1 (MQ=255) gttgtcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGcc > 1:266672‑M2/25‑99 (MQ=255) ttttaattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGaa < 2:2078960‑M2/79‑1 (MQ=255) tcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGaa > 2:633261‑M2/21‑99 (MQ=255) tcataattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGaa < 2:865433‑M2/79‑1 (MQ=255) taattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCa < 1:2049275‑M2/82‑1 (MQ=255) taattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCa > 2:1480491‑M2/18‑99 (MQ=255) aattggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCAt > 2:354464‑M2/17‑99 (MQ=255) attggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACGATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATa < 1:482274‑M2/84‑1 (MQ=255) attggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATa > 2:764149‑M2/16‑99 (MQ=255) ttggtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATaa < 2:44694‑M2/85‑1 (MQ=255) gtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAgt < 1:1349393‑M2/88‑1 (MQ=255) gtaccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAgt < 2:2161003‑M2/88‑1 (MQ=255) taccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAgtg > 2:139312‑M2/11‑99 (MQ=255) ccgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTa > 2:5429‑M2/9‑99 (MQ=255) cgagctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTaa < 1:1089109‑M2/92‑1 (MQ=255) ctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGcc < 2:1681449‑M2/96‑1 (MQ=255) ctcGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGcc < 1:2002756‑M2/96‑1 (MQ=255) aaTTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTggg > 2:1981462/1‑99 (MQ=255) aaTTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTggg > 2:1211064/1‑99 (MQ=255) aaTTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTggg > 1:348149/1‑99 (MQ=255) aaTTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGCGTAAAGCCTggg > 1:2444843/1‑99 (MQ=255) | CGCCAGCTGGCGAAAGGGGGATGTGCTGCAAGGCGATTAAGTTGGGTAACGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGACGTTGTAAAACGACGGCCAGTGAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGT > NC_000913/366193‑366388 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |