| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 70,371 | T→C | 100% | intergenic (‑323/‑16) | araB ← / → araC | ribulokinase/DNA‑binding transcriptional dual regulator AraC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 70,371 | 0 | T | C | 97.8% | 12716.8 / 140.1 | 3528 | intergenic (‑323/‑16) | araB/araC | ribulokinase/DNA‑binding transcriptional dual regulator AraC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (49/31); new base C (1698/1747); total (1748/1780) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.12e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 3604 total aligned reads displayed.
AGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGTGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAACGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGATTGAGGC > NC_000913/70273‑70469 | ggTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAg > 1:709026/1‑99 (MQ=255) ggTTACCGGTTTGGTAAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAg < 2:1838096/99‑1 (MQ=255) gTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGt > 1:1667751/1‑99 (MQ=255) ttACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTa > 2:612660/1‑99 (MQ=255) ttACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTa < 1:2193235/99‑1 (MQ=255) ttACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTa < 1:499096/99‑1 (MQ=255) tACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTAt > 1:1741715/1‑99 (MQ=255) aCCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATg > 1:668371/1‑99 (MQ=255) ggTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGaaa < 2:1064135/99‑1 (MQ=255) gTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGaaaa > 1:1027801/1‑99 (MQ=255) tttggTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAg < 2:2134598/96‑1 (MQ=255) tttggTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAg > 2:282603/4‑99 (MQ=255) tggTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTa < 1:596890/98‑1 (MQ=255) tggTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTa < 1:1982104/98‑1 (MQ=255) tggTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTa > 1:1785764/2‑99 (MQ=255) tggTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTa < 2:1802955/98‑1 (MQ=255) tggTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTa < 2:1533535/98‑1 (MQ=255) ggTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTAt < 2:863499/99‑1 (MQ=255) ggTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTAt < 1:1510837/99‑1 (MQ=255) gTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATg < 1:2154491/99‑1 (MQ=255) ttAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATgg < 1:427133/99‑1 (MQ=255) tAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGc < 2:1033756/99‑1 (MQ=255) aGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCt > 1:2028989/1‑99 (MQ=255) aGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCt < 2:423920/99‑1 (MQ=255) gCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTg > 1:105815/1‑99 (MQ=255) agaagaGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAg > 1:1354330/1‑99 (MQ=255) agaagaGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAg < 2:1765640/99‑1 (MQ=255) agaagaGCCACGAAACGACGCAGTGACGGCAATGTCTGTTGCAATATCGACAATTGGTTTCTTCACTGAATAGCGGGACTACGAAAAGTATGGCTGAAg > 2:755421/1‑99 (MQ=255) gaagaGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAgc > 1:1551714/1‑99 (MQ=255) gaagaGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAgc < 1:762919/99‑1 (MQ=255) aagaGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAgcg > 2:714562/1‑99 (MQ=255) agagCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTAGGAAAAGTATGGCTGAAgcgg > 2:1726192/1‑98 (MQ=255) gagCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCa > 1:1904863/1‑99 (MQ=255) ccAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCaaaa < 2:117925/99‑1 (MQ=255) ccAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCaaaa < 2:2102165/99‑1 (MQ=255) ccAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCaaaa < 1:1314506/99‑1 (MQ=255) ccAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCaaaa < 1:809308/99‑1 (MQ=255) ccAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCaaaa > 2:218756/1‑99 (MQ=255) cAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAAt < 2:1622160/99‑1 (MQ=255) aGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATg > 2:680894/1‑99 (MQ=255) gTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGa > 1:858633/1‑99 (MQ=255) tAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGAt > 2:1979714/1‑99 (MQ=255) tAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGAt < 1:1713310/99‑1 (MQ=255) aaaGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATcc > 1:1146699/1‑99 (MQ=255) aaaGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATcc > 2:2020664/1‑99 (MQ=255) aaGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATccc > 1:252771/1‑99 (MQ=255) aGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATcccc < 2:1866497/99‑1 (MQ=255) aGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATACAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATcccc > 2:642752/1‑99 (MQ=255) gACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCct < 1:1586509/99‑1 (MQ=255) gACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCct < 1:945048/99‑1 (MQ=255) cGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGTAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCctgc < 2:1332902/99‑1 (MQ=255) cGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCctgc < 1:1623640/99‑1 (MQ=255) gTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGcc > 2:328518/1‑99 (MQ=255) tGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCg > 1:370333/1‑99 (MQ=255) ggCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGAt > 1:1001776/1‑99 (MQ=255) gCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATa > 1:289938/1‑99 (MQ=255) aTGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTc > 1:1824258/1‑99 (MQ=255) tGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCg > 2:23974/1‑99 (MQ=255) tGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCg < 1:467273/99‑1 (MQ=255) tGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCg > 2:2057797/1‑99 (MQ=255) gTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGt < 2:1139595/99‑1 (MQ=255) tCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGtt < 2:523585/99‑1 (MQ=255) tCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGtt > 2:1480692/1‑99 (MQ=255) tGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTa > 2:141091/1‑99 (MQ=255) gATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTaa < 2:962198/99‑1 (MQ=255) gATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTaa < 1:1431087/99‑1 (MQ=255) gATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTaa < 1:2071963/99‑1 (MQ=255) tGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTaatg > 1:1096430/1‑97 (MQ=255) gCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGc < 2:1696200/99‑1 (MQ=255) atatGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCa > 1:1189639/1‑99 (MQ=255) tGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCt > 2:1448430/1‑99 (MQ=255) tGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCt > 2:467317/1‑99 (MQ=255) tGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCt > 2:157978/1‑99 (MQ=255) ggACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCtg < 1:126767/99‑1 (MQ=255) ggACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCtg < 2:557702/99‑1 (MQ=255) cAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCtggtg > 1:330771/1‑99 (MQ=255) aTTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCtggtggg > 2:1657310/1‑98 (MQ=255) aTTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGc > 2:1264717/1‑99 (MQ=255) ggTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAGATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAGTGCCCATCTGGTGGCggg > 2:1366807/1‑99 (MQ=255) ggTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCggg > 1:1947725/1‑99 (MQ=255) gTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGt < 1:40131/99‑1 (MQ=255) gTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGt < 1:2115363/99‑1 (MQ=255) gTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGt > 2:381222/1‑99 (MQ=255) gTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGt < 2:1904145/99‑1 (MQ=255) gTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGt > 1:1395624/1‑99 (MQ=255) tttCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGtt > 1:1866753/1‑99 (MQ=255) cttctCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTaa < 2:909274/99‑1 (MQ=255) cttctCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTaa > 2:1298032/1‑99 (MQ=255) cttctCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTaa < 1:897391/99‑1 (MQ=255) cttctCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTaa < 2:820021/99‑1 (MQ=255) cttctCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTaa > 1:1235526/1‑99 (MQ=255) cttctCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTaa > 2:790671/1‑99 (MQ=255) ttctCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAAc > 1:988788/1‑99 (MQ=255) tctcTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACg > 1:565339/1‑99 (MQ=255) tctGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGcc > 1:533144/1‑99 (MQ=255) tGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGa < 2:1107393/99‑1 (MQ=255) tGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGa > 2:1941546/1‑99 (MQ=255) tggcggGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGATTGa > 1:1469601/1‑99 (MQ=255) tggcggGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGATTGa > 2:1222859/1‑99 (MQ=255) tggcggGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGATTGa > 1:637904/1‑99 (MQ=255) | AGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGTGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAACGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGATTGAGGC > NC_000913/70273‑70469 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |