| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 70,371 | T→C | 100% | intergenic (‑323/‑16) | araB ← / → araC | ribulokinase/DNA‑binding transcriptional dual regulator AraC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 70,371 | 0 | T | C | 98.3% | 29144.0 / 234.0 | 8171 | intergenic (‑323/‑16) | araB/araC | ribulokinase/DNA‑binding transcriptional dual regulator AraC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (70/76); new base C (3856/4168); total (3927/4244) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 8324 total aligned reads displayed.
AGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGTGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAACGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGATTGAGG > NC_000913/70273‑70468 | cGGGGTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAAtggcgg < 2:2653726/99‑1 (MQ=255) gggTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGa > 1:119274/1‑99 (MQ=255) gggTTACAGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGTATGGCGGGa < 2:13210/99‑1 (MQ=255) ggTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAg < 1:3021125/99‑1 (MQ=255) ggTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAg > 1:813195/1‑99 (MQ=255) gTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGt > 2:1682155/1‑99 (MQ=255) ttACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTa > 2:856861/1‑99 (MQ=255) ttACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTa < 1:1486264/99‑1 (MQ=255) ttACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTa > 2:2515530/1‑99 (MQ=255) ttACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTa > 2:1824814/1‑99 (MQ=255) tttggTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAg < 2:2439538/96‑1 (MQ=255) tttggTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAg < 1:2591425/96‑1 (MQ=255) tggTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTa < 2:403998/98‑1 (MQ=255) tggTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTa < 1:1623089/98‑1 (MQ=255) tggTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTa < 2:2305566/98‑1 (MQ=255) tggTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTa < 2:3678237/98‑1 (MQ=255) ggTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTAt < 2:1963091/99‑1 (MQ=255) ttAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATgg > 1:2942712/1‑99 (MQ=255) ttAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATgg > 2:1248706/1‑99 (MQ=255) ttAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATgg > 2:3020578/1‑99 (MQ=255) agaagaGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAg > 2:482779/1‑99 (MQ=255) gaagaGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAgc < 1:2065257/99‑1 (MQ=255) gaagaGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAgc > 1:3098612/1‑99 (MQ=255) gaagaGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAgc > 2:3149873/1‑99 (MQ=255) aagaGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAgcg > 1:1779706/1‑99 (MQ=255) agagCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAgcgc > 1:3227733/1‑99 (MQ=255) gagCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCa > 1:1345356/1‑99 (MQ=255) agCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCaa > 2:925461/1‑99 (MQ=255) gCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCaaa > 2:3285838/1‑99 (MQ=255) ccAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCaaaa < 1:280253/99‑1 (MQ=255) ccAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCaaaa > 1:431779/1‑99 (MQ=255) ccAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCaaaa < 2:1479415/99‑1 (MQ=255) ccAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCaaaa < 1:1553883/99‑1 (MQ=255) ccAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCaaaa < 1:2734441/99‑1 (MQ=255) cAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAAt > 1:2668789/1‑99 (MQ=255) aGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATg < 2:3351816/99‑1 (MQ=255) tAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGGGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGAt > 1:499334/1‑99 (MQ=255) tAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGAt > 1:3623560/1‑99 (MQ=255) tAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGAt > 1:2410191/1‑99 (MQ=255) aaGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATccc < 1:3415846/99‑1 (MQ=255) aaGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATccc < 1:2874387/99‑1 (MQ=255) aaGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATccc < 2:1167331/99‑1 (MQ=255) aaGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATccc < 1:2337543/99‑1 (MQ=255) aCGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCctg < 2:2372007/99‑1 (MQ=255) cGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCctgc < 2:2910739/99‑1 (MQ=255) tcaCGGCAATGTCTGATGCCATATGGACAATTGGTTTCTTCCCTGATTGGGGGGAGTACG‑AACAGGATGGCTGAAGTGCATAATGATCCCCTGCTGCCg > 2:740187/3‑99 (MQ=255) tGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCg > 1:676450/1‑99 (MQ=255) tGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCg > 1:556456/1‑99 (MQ=255) tGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCg > 1:354987/1‑99 (MQ=255) gCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATa < 1:377760/99‑1 (MQ=255) gCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATa > 2:2721188/1‑99 (MQ=255) cAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATAc < 1:1984847/99‑1 (MQ=255) aTGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTc > 1:1001523/1‑99 (MQ=255) aTGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTc > 2:617580/1‑99 (MQ=255) tGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCg > 1:3162019/1‑99 (MQ=255) tGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCg > 1:348344/1‑99 (MQ=255) tGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCg < 2:3409014/99‑1 (MQ=255) tGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCg > 2:548182/1‑99 (MQ=255) tCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGtt < 2:800723/99‑1 (MQ=255) tCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGtt < 1:1120566/99‑1 (MQ=255) tCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGtt < 2:3473178/99‑1 (MQ=255) gATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTaa < 2:2795370/99‑1 (MQ=255) gATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTaa < 1:170414/99‑1 (MQ=255) gATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTaa < 2:296980/99‑1 (MQ=255) gATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTaa < 2:3217275/99‑1 (MQ=255) gATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTaa < 2:1893088/99‑1 (MQ=255) gATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTaa < 1:213243/99‑1 (MQ=255) gATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTaa < 2:1610640/99‑1 (MQ=255) tGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTaat < 2:2098827/99‑2 (MQ=255) tGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTaatg > 1:1916942/1‑97 (MQ=255) gCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTaatgc > 1:3292096/1‑96 (MQ=255) aaTATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGccc > 2:2246211/1‑99 (MQ=255) aaTATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGccc > 1:1267371/1‑99 (MQ=255) aaTATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGccc > 1:750386/1‑99 (MQ=255) atatGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCa > 2:674376/1‑99 (MQ=255) tatGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCAt < 2:2026092/99‑1 (MQ=255) atGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATc < 2:3753110/99‑1 (MQ=255) gACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCtgg > 2:2163290/1‑99 (MQ=255) aCAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCtggt > 1:219873/1‑99 (MQ=255) aCAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCtggt > 1:959350/1‑99 (MQ=255) aaTTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCtggtgg < 2:3611941/99‑1 (MQ=255) ggTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCggg < 2:1025778/99‑1 (MQ=255) tttCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGtt < 1:1840356/99‑1 (MQ=255) tttCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGtt > 1:88593/1‑99 (MQ=255) tcttctCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTa > 1:10645/1‑99 (MQ=255) cttctCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTaa < 1:618919/99‑1 (MQ=255) cttctCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTaa < 1:3351622/99‑1 (MQ=255) cttctCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTaa < 2:1402133/99‑1 (MQ=255) cttctCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTaa < 2:1552207/99‑1 (MQ=255) ttctCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAAc < 1:2524750/99‑1 (MQ=255) ttctCTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAAc > 2:2587625/1‑99 (MQ=255) tctcTGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACg < 1:2276413/99‑1 (MQ=255) ctctGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGc < 1:2469746/99‑1 (MQ=255) tctGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGcc > 2:3545102/1‑99 (MQ=255) tctGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGcc < 2:2850272/99‑1 (MQ=255) tGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGa < 2:1102440/99‑1 (MQ=255) tGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGa < 2:3078429/99‑1 (MQ=255) tGAATGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGa < 2:1745368/99‑1 (MQ=255) aaTGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGAtt < 1:3694361/99‑1 (MQ=255) aTGGCGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGATTg > 1:1424853/1‑99 (MQ=255) | AGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGTGGGAGTATG‑AAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAACGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGATTGAGG > NC_000913/70273‑70468 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |