| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 70,371 | T→C | 100% | intergenic (‑323/‑16) | araB ← / → araC | ribulokinase/DNA‑binding transcriptional dual regulator AraC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 70,371 | 0 | T | C | 99.1% | 46021.9 / 128.4 | 13751 | intergenic (‑323/‑16) | araB/araC | ribulokinase/DNA‑binding transcriptional dual regulator AraC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (67/58); new base C (6520/7096); total (6593/7158) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.09e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 13972 total aligned reads displayed.
AGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGTGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAACGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGATTGAGGC > NC_000913/70273‑70469 | gggTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGa > 1:1095332/1‑99 (MQ=255) gggTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGa > 1:863143/1‑99 (MQ=255) gggTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGa > 1:1420144/1‑99 (MQ=255) ggTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAg < 2:2525034/99‑1 (MQ=255) gTTACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGt > 2:938669/1‑99 (MQ=255) ttACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTa > 2:1196474/1‑99 (MQ=255) ttACCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTa > 2:200308/1‑99 (MQ=255) aCCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCGATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATg < 1:2573939/99‑1 (MQ=255) aCCGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATg > 2:1654205/1‑99 (MQ=255) cGGTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGaa > 2:1381370/1‑99 (MQ=255) ggTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGaaa < 1:456936/99‑1 (MQ=255) gTTTGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGaaaa > 1:239061/1‑99 (MQ=255) tggTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTa < 1:1556031/98‑1 (MQ=255) tggTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTa > 1:1916250/2‑99 (MQ=255) ggTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTAt < 1:406069/99‑1 (MQ=255) ggTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTAt > 1:1508510/1‑99 (MQ=255) ttAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATgg > 2:2291521/1‑99 (MQ=255) tAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGc < 2:1856008/99‑1 (MQ=255) gCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTg > 1:997524/1‑99 (MQ=255) gagaAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGCATGGCTGaa < 1:1687188/99‑1 (MQ=255) gaagaGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAgc > 1:683909/1‑99 (MQ=255) gaagaGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAgc < 2:798148/99‑1 (MQ=255) agagCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAgcgc > 2:473254/1‑99 (MQ=255) agagCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAgcgc > 2:2244694/1‑99 (MQ=255) gCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCaaa > 1:550555/1‑99 (MQ=255) ccAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCaaaa < 2:1759148/99‑1 (MQ=255) ccAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCaaaa < 1:2488371/99‑1 (MQ=255) gTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGa > 1:1375521/1‑99 (MQ=255) gTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGa > 1:2438410/1‑99 (MQ=255) gTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGa > 1:1781738/1‑99 (MQ=255) tAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGAt > 2:2045542/1‑99 (MQ=255) tAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGAt > 2:1520002/1‑99 (MQ=255) tAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGAt > 2:61664/1‑99 (MQ=255) aaGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATccc < 2:1340798/99‑1 (MQ=255) aGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATcccc < 2:2382221/99‑1 (MQ=255) aGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATcccc < 1:644158/99‑1 (MQ=255) aGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATcccc < 1:1464856/99‑1 (MQ=255) gACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCct < 2:1149374/99‑1 (MQ=255) cGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCctgc < 1:1281136/99‑1 (MQ=255) cGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCctgc < 2:1709513/99‑1 (MQ=255) gCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCctgct < 2:1952266/99‑1 (MQ=255) aGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCtgctgc < 2:243237/99‑1 (MQ=255) aGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCtgctgc < 1:911556/99‑1 (MQ=255) aGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCtgctgc < 1:114614/99‑1 (MQ=255) gTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGcc > 1:503623/1‑99 (MQ=255) tGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCg > 1:72363/1‑99 (MQ=255) gACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCgg < 1:1599590/99‑1 (MQ=255) cGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGa < 1:224391/99‑1 (MQ=255) cGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGa < 2:704907/99‑1 (MQ=255) ggCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGAt < 2:1424344/99‑1 (MQ=255) ggCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGAt < 2:2571715/99‑1 (MQ=255) gCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATa < 2:571272/99‑1 (MQ=255) gCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATa > 2:37788/1‑99 (MQ=255) gCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATa < 1:2100913/99‑1 (MQ=255) aaTGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACt < 2:281297/99‑1 (MQ=255) gTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGt > 1:1042140/1‑99 (MQ=255) tCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGtt > 2:124448/1‑99 (MQ=255) tCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGtt > 1:1185685/1‑99 (MQ=255) tGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTa < 1:956942/99‑1 (MQ=255) gATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTaa < 1:1643642/99‑1 (MQ=255) gATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTaa < 2:2144279/99‑1 (MQ=255) gATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTaa < 1:2342831/99‑1 (MQ=255) gATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTaa < 2:657281/99‑1 (MQ=255) gATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTaa < 1:1231040/99‑1 (MQ=255) gATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTaa < 2:1049948/99‑1 (MQ=255) aTGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTaat > 2:845586/1‑98 (MQ=255) aTGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTaat > 1:2288550/1‑98 (MQ=255) tGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTaatg > 2:1105009/1‑97 (MQ=255) cAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGcc < 1:360270/99‑1 (MQ=255) tatGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCAt > 1:2003286/1‑99 (MQ=255) atGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATc < 2:522211/99‑1 (MQ=255) atGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATc < 1:273592/99‑1 (MQ=255) atGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATc < 1:2054378/99‑1 (MQ=255) gACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAGGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCtgg < 2:328649/99‑1 (MQ=255) gACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCtgg < 2:426526/99‑1 (MQ=255) gACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCtgg < 1:2146949/99‑1 (MQ=255) aCAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCtggt > 2:892373/1‑99 (MQ=255) aCAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCtggt < 1:2191294/99‑1 (MQ=255) aCAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCtggt > 2:2335747/1‑99 (MQ=255) aaTTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCtggtgg < 1:768313/99‑1 (MQ=255) aTTGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGc > 1:1333478/1‑99 (MQ=255) ttGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCg > 2:1286679/1‑99 (MQ=255) ttGGTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCg < 1:1961441/99‑1 (MQ=255) ggTTTCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCggg > 1:598004/1‑99 (MQ=255) tttCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGtt > 2:218989/1‑99 (MQ=255) tttCTTCTCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGtt < 1:1736026/99‑1 (MQ=255) cttctCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTaa < 1:316809/99‑1 (MQ=255) cttctCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTaa < 1:810942/99‑1 (MQ=255) cttctCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTaa < 2:1903637/99‑1 (MQ=255) cttctCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTaa > 1:2532936/1‑99 (MQ=255) ttctCTGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAAc > 2:1609390/1‑99 (MQ=255) ctctGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGc < 1:100017/99‑1 (MQ=255) tctGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGcc > 2:754146/1‑99 (MQ=255) tGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGa < 1:1832044/99‑1 (MQ=255) tGAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGa < 1:1872062/99‑1 (MQ=255) gAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGAt < 2:2094722/99‑1 (MQ=255) gAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGAt < 2:1563823/99‑1 (MQ=255) gAATGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGAt < 2:1470512/99‑1 (MQ=255) aaTGGCGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGAtt > 2:181376/1‑99 (MQ=255) tggcggGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAATGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGATTGa > 2:2478062/1‑99 (MQ=255) | AGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCGAGAAGAGCCAGTAAAAGACGCAGTGACGGCAATGTCTGATGCAATATGGACAATTGGTTTCTTCTCTGAATGGTGGGAGTATGAAAAGTATGGCTGAAGCGCAAAATGATCCCCTGCTGCCGGGATACTCGTTTAACGCCCATCTGGTGGCGGGTTTAACGCCGATTGAGGC > NC_000913/70273‑70469 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |