| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 71,175 | A→G | R263R (CGA→CGG) | araC → | DNA‑binding transcriptional dual regulator AraC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 71,175 | 0 | A | G | 97.8% | 23502.1 / 254.0 | 6638 | R263R (CGA→CGG) | araC | DNA‑binding transcriptional dual regulator AraC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (72/75); new base G (3254/3230); total (3330/3308) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.03e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 6639 total aligned reads displayed.
CGCATTAGTCAGGCGAAGCTGCTTTTGAGCACTACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGAGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTTCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAA > NC_000913/71077‑71272 | cagccAGGCGAAGCTGCTTTTGAGCACCACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTAtt < 2:3284073/95‑1 (MQ=255) gccAGGCGAAGCTGCTTTTGAGCACCACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTa > 2:2200181/3‑99 (MQ=255) gTCAGGCGAAGCTGCTTTTGAGCACTACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGAGTATTTa < 2:1512729/99‑1 (MQ=255) ccAGGCGAAGCTGCTTTTGAGCACCACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTaa < 1:2855093/98‑1 (MQ=255) cAGGCGAAGCTGCTTTTGAGCACCACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTaaa > 2:1311343/1‑99 (MQ=255) cAGGCGAAGCTGCTTTTGAGCACCACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGCCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTaaa > 1:3300432/1‑99 (MQ=255) aGGCGAAGCTGCTTTTGAGCACCACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTaaaa < 1:3055725/99‑1 (MQ=255) aGGCGAAGCTGCTTTTGAGCACCACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTaaaa < 2:3216897/99‑1 (MQ=255) aGGCGAAGCTGCTTTTGAGCACCACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTaaaa < 1:1757610/99‑1 (MQ=255) ggCGAAGCTGCTTTTGAGCACCACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTaaaaa > 1:2090816/1‑99 (MQ=255) ggCGAAGCTGCTTTTGAGCACCACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTaaaaa > 2:3353127/1‑99 (MQ=255) gCGAAGCTGCTTTTGAGCACCACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTaaaaaa < 1:1133469/99‑1 (MQ=255) gCGAAGCTGCTTTTGAGCACCACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTaaaaaa < 1:3172692/99‑1 (MQ=255) gCGAAGCTGCTTTTGAGCACCACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTaaaaaa > 1:363298/1‑99 (MQ=255) gAAGCTGCTTTTGAGCACCACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATg > 2:3490552/1‑99 (MQ=255) aaGCTGCTTTTGAGCACCACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGc > 2:2894642/1‑99 (MQ=255) aaGCTGCTTTTGAGCACCACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGc > 2:626512/1‑99 (MQ=255) aaGCTGCTTTTGAGCACCACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGAGTATTTAAAAAATGc > 1:1063686/1‑99 (MQ=255) aGCTGCTTTTGAGCACCACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCa > 1:2511700/1‑99 (MQ=255) gctgctTTTGAGCACCACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCAc < 1:3235434/99‑1 (MQ=255) ctTTTGAGCACCACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCggg > 2:1563800/1‑99 (MQ=255) ctTTTGAGCACCACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCggg > 1:3365819/1‑99 (MQ=255) ttttGAGCACCACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCgggg < 2:2269159/99‑1 (MQ=255) tttGAGCACCACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGc < 2:670570/99‑1 (MQ=255) tttGAGCACCACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGc < 2:257816/99‑1 (MQ=255) tttGAGCACCACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGc < 1:2923567/99‑1 (MQ=255) ttGAGCACCACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGcc < 1:2993193/99‑1 (MQ=255) aGCACCACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGc < 1:665513/99‑1 (MQ=255) gCACCACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGcc < 2:1625199/99‑1 (MQ=255) caccacCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGccc < 1:1832672/99‑1 (MQ=255) caCCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCcgag < 2:1968165/98‑1 (MQ=255) ccGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCcgagcga < 1:1313733/99‑1 (MQ=255) ggATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGt > 1:1002732/1‑99 (MQ=255) gATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGtt < 2:1240878/99‑1 (MQ=255) gATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGtt > 2:2511969/1‑99 (MQ=255) gATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGtt > 1:1242300/1‑99 (MQ=255) gATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGtt > 2:497071/1‑99 (MQ=255) aTGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGAGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGttt < 1:851978/99‑1 (MQ=255) ccTATCGCCACCTTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGt < 2:867489/99‑1 (MQ=255) ccTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGt > 1:1702990/1‑99 (MQ=255) tATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGc < 2:1762847/99‑1 (MQ=255) tATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGc < 1:1179374/99‑1 (MQ=255) tATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGc < 2:3146820/99‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCg > 2:1881606/1‑99 (MQ=255) ccACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGtt < 1:202310/99‑1 (MQ=255) cACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTtg < 2:2321943/99‑1 (MQ=255) aCCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTtgt < 2:1451525/99‑1 (MQ=255) ccGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTtgtg < 2:2152951/99‑1 (MQ=255) tcggtcgCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTgaag > 1:545217/1‑99 (MQ=255) tcggtcgCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTgaag > 2:275352/1‑99 (MQ=255) cggtcgCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTgaaga < 2:1692634/99‑1 (MQ=255) ggtcgCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTgaagaa > 2:1111922/1‑99 (MQ=255) gtcgCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGaaa > 1:1946310/1‑99 (MQ=255) tcgCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGaaaa > 2:931602/1‑99 (MQ=255) cgCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGaaaaa < 1:2211975/99‑1 (MQ=255) cgCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGaaaaa < 1:1882365/99‑1 (MQ=255) gCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAg < 1:998388/99‑1 (MQ=255) gCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAg < 1:415711/99‑1 (MQ=255) gCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAg < 1:485005/99‑1 (MQ=255) aaTGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTg > 1:1589400/1‑99 (MQ=255) aaTGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTg > 2:2829685/1‑99 (MQ=255) aaTGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTg > 2:37162/1‑99 (MQ=255) aaTGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTg > 1:732687/1‑99 (MQ=255) aaTGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTg < 1:1457443/99‑1 (MQ=255) aTGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGa > 1:798973/1‑99 (MQ=255) aTGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGa > 2:808267/1‑99 (MQ=255) aTGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGa > 1:2261279/1‑99 (MQ=255) tGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAatga > 2:2448033/1‑99 (MQ=255) ggTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAatgat > 1:1382518/1‑99 (MQ=255) gTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAatgatg < 1:152639/99‑1 (MQ=255) gTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAatgatg < 1:2325258/99‑1 (MQ=255) tttGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTa < 1:3108560/99‑1 (MQ=255) ttGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAg < 1:612459/99‑1 (MQ=255) ttGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAg < 2:3023232/99‑1 (MQ=255) tGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGc > 2:2690908/1‑99 (MQ=255) tGACGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGc < 1:2391123/99‑1 (MQ=255) aCGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCg > 1:2581324/1‑99 (MQ=255) aCGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCg > 2:182526/1‑99 (MQ=255) aCGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCg > 2:2027300/1‑99 (MQ=255) cGATCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGt < 2:2634377/99‑1 (MQ=255) tCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCaa > 1:2726594/1‑99 (MQ=255) tCAACTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCaa > 2:436010/1‑99 (MQ=255) tCAACTCTATTTCTCGCGAGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTTCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCaa > 1:921807/1‑99 (MQ=255) aCTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGtt > 2:56666/1‑99 (MQ=255) aCTCTATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGATCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGtt > 2:1169787/1‑99 (MQ=255) ctctATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTg > 1:2452268/1‑99 (MQ=255) tctATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGt < 2:750496/99‑1 (MQ=255) tctATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGt < 1:3492051/99‑1 (MQ=255) ctATTTCTCGTGGGTATTTAAAAATTGCACCGGGGCCAGCCCGGGCGAGTTCCGTGCTGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTAGTc < 2:2095597/99‑1 (MQ=255) ctATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTc > 1:2666918/1‑99 (MQ=255) tATTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCa < 2:3418666/99‑1 (MQ=255) aTTTCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCAt < 2:1046392/99‑1 (MQ=255) ttCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATaa > 2:3094362/1‑99 (MQ=255) ttCTCGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATaa < 2:2382543/99‑1 (MQ=255) tctcGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAAt < 1:2792743/99‑1 (MQ=255) tcGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTg > 1:2148621/1‑99 (MQ=255) tcGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTg > 2:2967516/1‑99 (MQ=255) tcGCGGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTg < 2:138246/99‑1 (MQ=255) cgcgGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTgg < 1:163921/99‑1 (MQ=255) gcgGGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGt > 1:3432679/1‑99 (MQ=255) | CGCATTAGTCAGGCGAAGCTGCTTTTGAGCACTACCCGGATGCCTATCGCCACCGTCGGTCGCAATGTTGGTTTTGACGATCAACTCTATTTCTCGCGAGTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTTCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAA > NC_000913/71077‑71272 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |