| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 71,272 | A→C | intergenic (+7/‑79) | araC → / → yabI | DNA‑binding transcriptional dual regulator AraC/DedA family protein YabI |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 71,272 | 0 | A | C | 99.7% | 80702.2 / 58.2 | 26280 | intergenic (+7/‑79) | araC/yabI | DNA‑binding transcriptional dual regulator AraC/DedA family protein YabI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (39/43); new base C (13003/13176); total (13054/13226) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.41e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 | |||||||||||
Only 100 of 26284 total aligned reads displayed.
GTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTTCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGAATCAGACAATTGACGGCTTGACGGAGTAGCATAGGGTTTGCAGAATCCCTGCTTCGTCCATTTGACAGGCACATTATGCAAGCATTGCTGGAACA > NC_000913/71176‑71370 | tATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCGAGTTGTCAGACTTAGTACCGa > 2:2036698/1‑99 (MQ=255) aTTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAg > 2:1613751‑M1/1‑98 (MQ=255) aTTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAg > 1:985899‑M1/1‑98 (MQ=255) aTTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAg > 1:1682397‑M1/1‑98 (MQ=255) tttAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgc > 1:1048977‑M1/1‑97 (MQ=255) tttAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgc > 2:265021‑M1/1‑97 (MQ=255) tttAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgc > 1:1775513‑M1/1‑97 (MQ=255) aaaaTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaa > 1:623633‑M1/1‑92 (MQ=255) aaaaTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGCGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaa > 2:1029427‑M1/1‑92 (MQ=255) aaTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaatt > 1:1457177‑M1/1‑90 (MQ=255) aaTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaatt > 2:1570955‑M1/1‑90 (MQ=255) aaTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaatt < 1:128066‑M1/99‑10 (MQ=255) aaTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaatt > 1:2443809‑M1/1‑90 (MQ=255) aTGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattc > 1:1729661‑M1/1‑89 (MQ=255) ccGGGGCCAGCCCGGGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaat < 2:82232‑M1/99‑16 (MQ=255) ggggCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatca > 1:231284‑M1/1‑82 (MQ=255) ggggCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatca < 2:304423‑M1/99‑18 (MQ=255) gggCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcat > 1:150686‑M1/1‑81 (MQ=255) gCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgt < 2:684613‑M1/99‑21 (MQ=255) cAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtca < 2:353711‑M1/99‑23 (MQ=255) cAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtca < 2:1660604‑M1/99‑23 (MQ=255) gCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcata > 2:1524875‑M1/1‑75 (MQ=255) cccGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatag > 2:729488‑M1/1‑74 (MQ=255) ccGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagc < 2:1112872‑M1/99‑27 (MQ=255) cgagcgagTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagct < 1:804396‑M1/99‑28 (MQ=255) gagcgagTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctg > 1:1097144‑M1/1‑71 (MQ=255) agcgagTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCTGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgt > 1:848079‑M1/1‑70 (MQ=255) agcgagTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgt < 1:574968‑M1/99‑30 (MQ=255) agcgagTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgt > 1:1141776‑M1/1‑70 (MQ=255) gcgagTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtt < 2:589664‑M1/99‑31 (MQ=255) cgagTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgttt < 2:2127835‑M1/99‑32 (MQ=255) cgagTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgttt < 2:2225240‑M1/99‑32 (MQ=255) cgagTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgttt < 1:940923‑M1/99‑32 (MQ=255) agTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcc < 1:2174060‑M1/99‑34 (MQ=255) agTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcc > 1:213465‑M1/1‑66 (MQ=255) agTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcc > 1:2087408‑M1/1‑66 (MQ=255) ttccgtgCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctg > 1:204110‑M1/4‑64 (MQ=255) ttccgtgCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctg < 2:2270898‑M1/96‑36 (MQ=255) tccgtGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgt > 2:539353‑M1/3‑63 (MQ=255) tGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtga < 2:1341440‑M1/99‑41 (MQ=255) ccGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaa < 1:1552198‑M1/99‑43 (MQ=255) cGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaat < 2:1852844‑M1/99‑44 (MQ=255) ggTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaatt > 2:866972‑M1/1‑55 (MQ=255) gTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattg < 1:1325148‑M1/99‑46 (MQ=255) gTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattg > 2:912627‑M1/1‑54 (MQ=255) ttGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgt > 1:312665‑M1/1‑53 (MQ=255) ttGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgt < 2:638065‑M1/99‑47 (MQ=255) ttGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgt < 1:1818100‑M1/99‑47 (MQ=255) tgtgAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgtt < 1:1954643‑M1/99‑48 (MQ=255) gtgAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgtta < 2:39981‑M1/99‑49 (MQ=255) tgAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttat > 2:2360008‑M1/1‑50 (MQ=255) tgAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttat > 1:1863715‑M1/1‑50 (MQ=255) gaagaaAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatc < 2:1478391‑M1/99‑51 (MQ=255) aagaaAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatcc < 1:2490166‑M1/99‑52 (MQ=255) aagaaAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatcc > 1:264358‑M1/1‑48 (MQ=255) aagaaAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatcc > 2:2173819‑M1/1‑48 (MQ=255) agaaAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccg > 1:137168‑M1/1‑47 (MQ=255) aaaaaGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgct > 1:895119‑M1/1‑45 (MQ=255) aaaGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctca < 1:670958‑M1/99‑57 (MQ=255) aaGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcac > 2:2085294‑M1/1‑42 (MQ=255) aaGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcac > 2:1298212‑M1/1‑42 (MQ=255) aGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcaca > 2:1702324‑M1/1‑41 (MQ=255) gTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaa > 2:1943546‑M1/1‑40 (MQ=255) gTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaa < 2:1803652‑M1/99‑60 (MQ=255) tGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtgatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaat < 1:1413556‑M1/99‑61 (MQ=255) gAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaatt < 1:2219730‑M1/99‑62 (MQ=255) aaTGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattc > 2:107145‑M1/1‑37 (MQ=255) atgatgTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattcc < 1:399859‑M1/99‑64 (MQ=255) atgatgTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattcc > 2:2402382‑M1/1‑36 (MQ=255) atgatgTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattcc > 2:1436055‑M1/1‑36 (MQ=255) tgatgTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattcca > 1:1186008‑M1/1‑35 (MQ=255) tgatgTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattcca > 2:2489880‑M1/1‑35 (MQ=255) atgTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccaca < 2:1900026‑M1/99‑67 (MQ=255) atgTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccaca > 2:2315851‑M1/1‑33 (MQ=255) atgTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccaca < 2:1202526‑M1/99‑67 (MQ=255) tgTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacac < 1:355607‑M1/99‑68 (MQ=255) tAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaa > 1:2264711‑M1/1‑30 (MQ=255) tAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaa > 2:95586‑M1/1‑30 (MQ=255) gCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaaca < 1:159397‑M1/99‑72 (MQ=255) ccGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacat < 2:444055‑M1/99‑73 (MQ=255) ccGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacat < 1:440670‑M1/99‑73 (MQ=255) cGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacata > 1:1000052‑M1/1‑26 (MQ=255) cGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacata < 2:1751663‑M1/99‑74 (MQ=255) tCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacg > 2:1153778‑M1/1‑24 (MQ=255) tCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacg > 1:1904952‑M1/1‑24 (MQ=255) cAAGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacga < 1:529879‑M1/99‑77 (MQ=255) aaGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgag > 2:2447798‑M1/1‑22 (MQ=255) aGTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagc < 1:1997643‑M1/99‑79 (MQ=255) gTTGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagcc < 1:2399081‑M1/99‑80 (MQ=255) ttGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccg > 1:760698‑M1/1‑19 (MQ=255) ttGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccg > 2:775796‑M1/1‑19 (MQ=255) ttGTCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccg < 1:2355652‑M1/99‑81 (MQ=255) tCATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaa > 1:1230239‑M1/1‑16 (MQ=255) cATAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaag < 1:716142‑M1/99‑85 (MQ=255) tAATTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagca < 2:1989673‑M1/99‑87 (MQ=255) aaTTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcat > 2:1390506‑M1/1‑12 (MQ=255) aaTTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcat < 2:124940‑M1/99‑88 (MQ=255) aTTGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcata > 2:490967‑M1/1‑11 (MQ=255) ttGGTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagc > 1:483913‑M1/1‑10 (MQ=255) ggTACCGAgctcgaattcgtaatcatgtcatagctgtttcctgtgtgaaattgttatccgctcacaattccacacaacatacgagccggaagcataaag > 1:1636288‑M1/1‑8 (MQ=255) | GTATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTTCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGAATCAGACAATTGACGGCTTGACGGAGTAGCATAGGGTTTGCAGAATCCCTGCTTCGTCCATTTGACAGGCACATTATGCAAGCATTGCTGGAACA > NC_000913/71176‑71370 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |