New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 71275 | 120 (1.130) | 10014 (98.550) +GCTC |
157/168 | NT | 99.0% | intergenic (+10/‑76) | araC/yabI | DNA‑binding transcriptional dual regulator AraC/DedA family protein YabI |
? | NC_000913 | 366286 = | 102 (0.960) | coding (20/3075 nt) | lacZ | beta‑galactosidase |
Only 100 of 12839 total aligned reads displayed.
ATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTTCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/71178‑71275 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTG > NC_000913/366286‑366384 |||| TTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGC > 2:1053760/1‑99 TTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGC > 1:2003844/1‑99 TTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCT < 1:1331699/99‑1 TTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCT < 1:254595/99‑1 AAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAA > 1:2111413/1‑99 AAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAAT < 1:1381607/99‑1 AATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATt < 2:840606/99‑2 TGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATtcg > 1:1162656/1‑96 ACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAA < 2:2071995/99‑1 CCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAAT > 2:614423/1‑99 GGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCA < 2:1610485/99‑1 GGGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCA < 2:724804/99‑1 GGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT < 2:2638798/99‑1 GGGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT > 1:2428438/1‑99 GGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCATG > 1:177746/1‑99 GGCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCATG > 2:177873/1‑99 GCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCATGt < 1:1434621/99‑2 GCCAGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCATGt < 2:433177/99‑2 AGCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCATGtcat < 1:204962/99‑5 GCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATA > 2:2528162/1‑99 GCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATA > 2:1231371/1‑99 GCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATA > 2:2179265/1‑99 GCCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATA < 1:841350/99‑1 CCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAG < 2:2304413/99‑1 CCCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAG < 1:895389/99‑1 CCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGC < 2:1005119/99‑1 CCGAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGC < 2:2122834/99‑1 GAGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTG > 2:3030562/1‑99 AGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGT > 1:2711805/1‑99 AGCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGT > 1:2979939/1‑99 GCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTT < 1:100000/99‑1 GCGAGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTT > 1:1277274/1‑99 AGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCC < 2:321234/99‑1 AGTTCCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCC > 1:1490718/1‑99 tcCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGT < 1:2324579/97‑1 GTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTG > 1:2817874/1‑99 GTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTG > 1:373855/1‑99 TGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGA > 1:1898470/1‑99 TGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGA > 2:2419699/1‑99 CCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAA > 2:285465/1‑99 CGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAAT < 2:1953781/99‑1 GGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATT > 2:1501290/1‑99 GTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTG < 1:579827/99‑1 TTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGT > 1:2930370/1‑99 TTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGT < 1:2269130/99‑1 GTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTA > 2:128574/1‑99 GTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTA < 1:476778/99‑1 TGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTAT > 1:1046856/1‑99 TGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTAT > 1:1670251/1‑99 GAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATC > 2:1341390/1‑99 GAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATC < 1:2219278/99‑1 AAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCC > 2:1896072/1‑99 AAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCC < 2:247913/99‑1 AAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCT > 2:2748392/1‑99 AAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCT < 2:894808/99‑1 AAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCT < 2:497654/99‑1 AAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCT < 2:1724211/99‑1 AAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTC > 2:2907624/1‑99 AAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCA < 1:735030/99‑1 AAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCA > 1:110719/1‑99 AAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCA > 2:1663065/1‑99 GTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAA < 1:2485411/99‑1 AATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTC > 2:155939/1‑99 AATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTC < 1:527515/99‑1 ATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCC > 2:2696218/1‑99 ATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCC > 1:2606615/1‑99 ATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCC > 1:1840662/1‑99 TGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCA > 1:2657789/1‑99 TGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCA > 1:316369/1‑99 TGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCA < 1:427330/99‑1 TAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAA > 1:2772202/1‑99 TAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAA > 2:1167956/1‑99 TAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAA < 2:2010514/99‑1 GCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACA < 2:1109026/99‑1 CGTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATA < 1:950788/99‑1 ggagAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATAC < 1:1615846/95‑1 GTCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATAC < 2:674222/99‑1 TCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACc > 2:2810428/1‑98 TCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACG < 2:2365753/99‑1 TCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACG > 1:2164628/1‑99 TCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACG > 2:2976344/1‑99 TCAAGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACG > 1:1222276/1‑99 AGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGC < 1:789841/99‑1 AGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGC > 1:62694/1‑99 AGTTGTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGC > 1:2371193/1‑99 GTCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGA < 2:554948/99‑1 TCATAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAA > 2:779393/1‑99 TAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCTTGTTTGAAATTGTTATCGGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCA > 2:1447736/1‑99 TAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCA > 1:3022316/1‑99 TAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCA < 1:1551594/99‑1 TAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCA < 1:1947913/99‑1 TAATTGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCA > 2:942569/1‑99 tacCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTG < 2:1390843/96‑1 acCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGT < 2:2581169/97‑1 acCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGT > 1:1721959/3‑99 cCGAGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTA > 2:382214/2‑99 AGCTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAG > 2:2238823/1‑99 CTCGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCC < 2:1838678/99‑1 CGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTG < 1:2876189/99‑1 CGAATTCGTAATCAT‑GTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTG < 1:680625/99‑1 |||| ATTTAAAAAATGCACCGGGGCCAGCCCGAGCGAGTTTCGTGCCGGTTGTGAAGAAAAAGTGAATGATGTAGCCGTCAAGTTGTCATAATTGGTAACGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/71178‑71275 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTG > NC_000913/366286‑366384 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |