| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,185,025 | G→T | 6.6% | G1261C (GGT→TGT) | rpoB → | RNA polymerase subunit beta |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,185,025 | 0 | G | T | 6.6% | 651.5 / 27.3 | 166 | G1261C (GGT→TGT) | rpoB | RNA polymerase subunit beta |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (81/74); new base T (6/5); total (87/79) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.39e-01 | |||||||||||
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
GTTACATGTACATGCTGAAACTGAACCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCAGCATACACCCTGCAGGAAATGCTCACCGT > NC_000913/4184927‑4185122 | gTTACATGTACATGCTGAAACTGAACCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGggtg > 1:2719586/1‑99 (MQ=255) ttACATGTACATGCTGAAACTGAACCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGggtgg > 2:280207/1‑99 (MQ=255) acatgtacatgCTGAAACTGAACCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTa < 2:417019/99‑1 (MQ=255) atgtacatgCTGAAACTGAACCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTTGTAAg > 1:3009380/1‑99 (MQ=255) atgtacatgCTGAAACTGAACCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAg > 2:294498/1‑99 (MQ=255) atgtacatgCTGAAACTGAACCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAg < 1:2938404/99‑1 (MQ=255) gtacatgCTGAAACTGAACCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGc > 1:1121429/1‑99 (MQ=255) tacatgCTGAAACTGAACCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGca > 2:3139454/1‑99 (MQ=255) tacatgCTGAAACTGAACCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGca > 1:2590830/1‑99 (MQ=255) acatgCTGAAACTGAACCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGcac > 1:2488449/1‑99 (MQ=255) atgCTGAAACTGAACCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAg < 2:3469064/99‑1 (MQ=255) tgCTGAAACTGAACCACCTGGTCGACGACAAGATGCGCGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGt < 2:2806878/99‑1 (MQ=255) tgCTGAAACTGAACCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGt > 2:770062/1‑99 (MQ=255) cTGAAACTGAACCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTc > 2:3253258/1‑99 (MQ=255) cTGAAACTGAACCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTc > 2:1812550/1‑99 (MQ=255) tGAAACTGAACCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCg > 2:2638811/1‑99 (MQ=255) tGAAACTGAACCACCTGGTCGAAGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCg > 1:981623/1‑99 (MQ=255) gAAACTGAACCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCgg < 2:743483/99‑1 (MQ=255) gAAACTGAACCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCgg < 2:1651960/99‑1 (MQ=255) aaaCTGAACCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCggt < 1:2474699/99‑1 (MQ=255) aaCTGAACCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCggtg > 1:169082/1‑99 (MQ=255) aaCTGAACCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCggtg > 1:124028/1‑99 (MQ=255) aaCTGAACCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCggtg > 2:1017137/1‑99 (MQ=255) cTGAACCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCggtggt < 1:677217/99‑1 (MQ=255) cTGAACCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCggtggt < 2:2513216/99‑1 (MQ=255) tGAACCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTTGTAAGGCACAGTTCGGTGGTc > 1:1591953/1‑99 (MQ=255) gAACCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCa < 2:3516405/99‑1 (MQ=255) gAACCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCa < 2:512463/99‑1 (MQ=255) gAACCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCa > 2:2060952/1‑99 (MQ=255) gAACCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCa > 2:847109/1‑99 (MQ=255) aaCCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAg < 1:195691/99‑1 (MQ=255) aaCCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAg < 2:1833192/99‑1 (MQ=255) caccTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGt > 1:842057/1‑99 (MQ=255) caccTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGt > 2:3320587/1‑99 (MQ=255) caccTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGt > 2:1135645/1‑99 (MQ=255) caccTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGt > 1:1274438/1‑99 (MQ=255) accTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGtt < 1:827615/99‑1 (MQ=255) tGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCg > 2:1175495/1‑99 (MQ=255) gTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCggg > 1:2073413/1‑99 (MQ=255) gacgacAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGgag < 1:1375530/99‑1 (MQ=255) cgacAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGAt > 2:89948/1‑99 (MQ=255) cgacAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGAt > 2:2460115/1‑99 (MQ=255) gacAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATg < 1:466930/99‑1 (MQ=255) acAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATgg > 1:941057/1‑99 (MQ=255) acAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATgg > 1:3529148/1‑99 (MQ=255) acAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATgg < 2:2146595/99‑1 (MQ=255) acAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATgg > 1:1566563/1‑99 (MQ=255) cAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGa < 1:1341749/99‑1 (MQ=255) aaGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGaa > 1:1630567/1‑99 (MQ=255) aGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAg > 1:2574544/1‑99 (MQ=255) aTGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAgtg > 2:1430188/1‑99 (MQ=255) aTGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAgtg < 1:1065892/99‑1 (MQ=255) cACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTgg < 1:2505378/99‑1 (MQ=255) cACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTgg < 2:1789700/99‑1 (MQ=255) aCGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTggg < 2:2188234/99‑1 (MQ=255) cgcgcgTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGgc > 2:3343226/1‑99 (MQ=255) cgTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTg < 2:1511214/99‑1 (MQ=255) ttCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGa > 2:3211968/1‑99 (MQ=255) ccACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAg < 1:528115/99‑1 (MQ=255) ccACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAg < 1:614221/99‑1 (MQ=255) cACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGc > 1:518189/1‑99 (MQ=255) aCCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCa > 1:1466480/1‑99 (MQ=255) ccGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCAt > 1:775154/1‑99 (MQ=255) ccGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCAt > 1:3135076/1‑99 (MQ=255) cGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATa > 2:3167068/1‑99 (MQ=255) cGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATa < 2:2268202/99‑1 (MQ=255) ggTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTTGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATAc > 1:1570536/1‑99 (MQ=255) ttCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTTGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACgg > 2:3097763/1‑99 (MQ=255) ttCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACgg < 1:3278224/99‑1 (MQ=255) tCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGgc < 2:3284667/99‑1 (MQ=255) cTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGgcg > 2:1592465/1‑99 (MQ=255) ttACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGgcgc < 1:2576829/99‑1 (MQ=255) ttACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGgcgc > 1:3348826/1‑99 (MQ=255) aCAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCgcag < 1:921826/99‑1 (MQ=255) cAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCgcagc < 1:3200134/99‑1 (MQ=255) aGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTTGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCgcagca < 2:2322858/99‑1 (MQ=255) aGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCgcatca > 1:1629208/1‑99 (MQ=255) aGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCgcagca < 2:2604572/99‑1 (MQ=255) ccTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCAGCATa < 2:2777879/99‑1 (MQ=255) cTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCAGCATac < 1:1008166/99‑1 (MQ=255) gTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCAGCATACAcc < 2:230061/99‑1 (MQ=255) gTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCAGCATACAcc > 2:2141443/1‑99 (MQ=255) gTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCAGCATACAcc > 1:1466877/1‑99 (MQ=255) ttACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCAGCATACAccc < 2:1948636/99‑1 (MQ=255) ttACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCAGCATACAccc < 2:2650238/99‑1 (MQ=255) tACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCAGCATACACCCt < 1:456698/99‑1 (MQ=255) tACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCAGCATACACCCt < 2:2352437/99‑1 (MQ=255) aCTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCAGCATACACCCTg < 1:1623490/99‑1 (MQ=255) aCTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCAGCATACACCCTg > 1:253867/1‑99 (MQ=255) cagcagCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCAGCATACACCCTGCAg > 2:298741/1‑99 (MQ=255) gcagcCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCAGCATACACCCTGCAGGa > 2:980620/1‑99 (MQ=255) gcagcCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCAGCATACACCCTGCAGGa > 1:129592/1‑99 (MQ=255) gcagcCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCAGCATACACCCTGCAGGa > 1:2884535/1‑99 (MQ=255) agcCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCAGCATACACCCTGCAGGaaa < 1:3484714/99‑1 (MQ=255) cGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCAGCATACACCCTGCAGGAAATGc > 1:1637210/1‑99 (MQ=255) tGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCAGCATACACCCTGCAGGAAATGCTCa < 1:1945344/99‑1 (MQ=255) gggTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGTTGGAAGCATACGGCGCAGCATACACCCTGCAGGAAATGCTCAc > 1:1601094/1‑99 (MQ=255) gggTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCAGCATACACCCTGCAGGAAATGCTCAc < 1:2543955/99‑1 (MQ=255) tggtAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCAGCATACACCCTGCAGGAAATGCTCACCGt < 1:1516794/99‑1 (MQ=255) tggtAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCAGCATACACCCTGCAGGAAATGCTCACCGt < 2:1573921/99‑1 (MQ=255) | GTTACATGTACATGCTGAAACTGAACCACCTGGTCGACGACAAGATGCACGCGCGTTCCACCGGTTCTTACAGCCTGGTTACTCAGCAGCCGCTGGGTGGTAAGGCACAGTTCGGTGGTCAGCGTTTCGGGGAGATGGAAGTGTGGGCGCTGGAAGCATACGGCGCAGCATACACCCTGCAGGAAATGCTCACCGT > NC_000913/4184927‑4185122 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |