| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,803,909 | IS5 (–) +4 bp | 56.6% | coding (226‑229/1080 nt) | waaB ← | UDP‑D‑galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide‑1, 6‑D‑galactosyltransferase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2288919 = | NA (NA) | 49 (0.540) | 40/176 | NT | 55.2% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3803912 | 38 (0.440) | coding (226/1080 nt) | waaB | UDP‑D‑galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide‑1, 6‑D‑galactosyltransferase | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2290113 | NA (NA) | 50 (0.550) | 41/174 | NT | 55.6% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3803909 = | 38 (0.440) | coding (229/1080 nt) | waaB | UDP‑D‑galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide‑1, 6‑D‑galactosyltransferase | |||||
CACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2290015‑2290113‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAATATTGGAAAATGAACATGAGTATTTAATACCTTCCAGCCATCCCTTATC > NC_000913/3803909‑3804002 CACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC > 2:785461/1‑99CACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC < 1:1351844/99‑1CACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC < 2:2411662/99‑1CACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC < 2:191737/99‑1 gCTGTCGGCGAAGGTAGGTTGGTGACGCATGATGAGCGCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGGTCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 2:933330/98‑1 ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 1:2358005/99‑1 ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 1:943252/99‑1 ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 1:2165155/99‑1 ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 1:964672/99‑1 ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 2:1474709/99‑1 ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT > 2:1553031/1‑99 CTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT > 2:1206220/1‑99 CTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT > 1:2094774/1‑99 CTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT > 2:389293/1‑99 CTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT < 1:446151/99‑1 TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 2:1115132/99‑1 TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA > 2:724259/1‑99 TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 1:1169050/99‑1 GTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAG < 1:971558/99‑1 GTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAG > 1:781593/1‑99 TCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGA > 2:1547375/1‑99 CGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAG < 1:1272218/99‑1 AGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAA > 1:116453/1‑99 GGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAAT > 1:123745/1‑99 GGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAAT > 1:2310820/1‑99 GTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATA < 2:530149/99‑1 GTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTT < 2:1545447/99‑1 GTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTT > 1:651028/1‑99 TTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTT > 1:1600146/1‑99 TGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCC > 2:1713970/1‑99 ACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCG > 1:2230843/1‑99 ACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCG > 1:18387/1‑99 CTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGA < 1:877485/99‑1 ATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGC > 1:2270355/1‑99 ATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGC < 1:2410249/99‑1 TGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCA < 2:2046754/99‑1 ATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAA < 2:1561461/99‑1 CCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACC < 1:229144/99‑1 CTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTA > 2:2382092/1‑99 TGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAA > 1:328887/1‑99 GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAA > 2:1962468/1‑99 TATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAA < 2:688771/99‑1 TATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAA < 2:1970415/99‑1 TATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAA < 2:1415291/99‑1 TATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAA < 1:238882/99‑1 TATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAA < 2:1536159/99‑1 ATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAAT > 1:2255573/1‑99 TGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAATA > 1:849047/1‑99 TGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAATA < 2:184943/99‑1 CTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAATATTG < 2:994249/99‑1 AGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAATATTGGAAA > 1:952247/1‑99 GATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAATATTGGAAAA > 1:2312639/1‑99 ACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAATATTGGAAAATGAA < 2:227990/99‑1 ACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAATATTGGAAAATGAA > 1:2040274/1‑99 CAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAATATTGGAAAATGAAC > 1:1835047/1‑99 AACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAATATTGGAAAATGAACAT > 2:620476/1‑99 ACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAATATTGGAAAATGAAGATG > 1:2181975/1‑99 ACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAATATTGGAAAATGAACATG > 2:619017/1‑99 GATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAATATTGGAAAATGAACATGAGTA < 1:1661467/99‑1 CATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAATATTGGAAAATGAACATGAGTATTTAA < 1:2329460/99‑1 TATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAATATTGGAAAATGAACATGAGTATTTAATA > 2:891843/1‑99 TATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAATATTGGAAAATGAACATGAGTATTTAATA > 2:2306815/1‑99 TATCAGGGACTTGTTCACACCTTCCGGGGAGCAGGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAATATTGGAAAATCAACATGAGTATTTAATA < 2:589017/99‑1 TCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAATATTGGAAAATGAACATGAGTATTTAATACC > 1:1337089/1‑99 GGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAATATTGGAAAATGAACATGAGTATTTAATACCTTC > 1:164029/1‑99 ACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGATTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAATATTGGAAAATGAACATGAGTATTTAATACCTTCCAG > 2:230295/1‑99 TTCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAATATTGGAAAATGAACATGAGTATTTAATACCTTCCAGCCATC < 2:1961653/99‑1 TCGCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAATATTGGAAAATGAACATGAGTATTTAATACCTTCCAGCCATCC < 1:1415052/99‑1 GCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAATATTGGAAAATGAACATGAGTATTTAATACCTTCCAGCCATCCCT > 1:2193273/1‑99 GCACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAATATTGGAAAATGAACATGAGTATTTAATACCTTCCAGCCATCCCT > 1:856027/1‑99 CACCTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAATATTGGAAAATGAACATGAGTATTTAATACCTTCCAGCCATCCCTT > 1:426642/1‑99 CTTCCTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAATATTGGAAAATGAACATGAGTATTTAATACCTTCCAGCCATCCCTTATC < 1:357614/99‑1 CACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2290015‑2290113‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cTTAGAGCATGAATATGTTTCGCCCGACGCAAAAAACCTAAACGAATATTGGAAAATGAACATGAGTATTTAATACCTTCCAGCCATCCCTTATC > NC_000913/3803909‑3804002 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |