| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,805,650 | IS1 (+) +8 bp | 23.1% | coding (294‑301/798 nt) | waaP ← | lipopolysaccharide core heptose (I) kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3583428 = | NA (NA) | 17 (0.190) | 16/176 | NT | 21.0% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3805657 | 58 (0.700) | coding (294/798 nt) | waaP | lipopolysaccharide core heptose (I) kinase | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | 17 (0.190) | 16/170 | NT | 21.9% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3805650 = | 55 (0.690) | coding (301/798 nt) | waaP | lipopolysaccharide core heptose (I) kinase | |||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
GGGTTGACTGCCCAATCGGCACAATAATCTTCAAGGCTAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGCGTGCCACTCTCTGTCTGCGCCCAAAACGGGCATCC > NC_000913/3805553‑3805748 | ggTTGACTGCCCAATCGGCACAATAATCTTCAAGGCTAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCtt > 1:2018315/1‑99 (MQ=255) ggTTGACTGCCCAATCGGCACAATAATCTTCAAGGCTAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCtt > 1:1911215/1‑99 (MQ=255) gTTGACTGCCCAATCGGCACAATAATCTTCAAGGCTAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCttt > 2:169294/1‑99 (MQ=255) gTTGACTGCCCAATCGGCACAATAATCTTCAAGGCTAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCttt > 2:297413/1‑99 (MQ=255) ttGACTGCCCAATCGGCACAATAATCTTCAAGGCTAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCtttt > 1:1041178/1‑99 (MQ=255) ttGACTGCCCAATCGGCACAATAATCTTCAAGGCTAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCtttt < 1:158640/99‑1 (MQ=255) gtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCtttt > 1:220811‑M2/95‑99 (MQ=255) tGACTGCCCAATCGGCACAATAATCTTCAAGGCTAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCttttt < 1:1600509/99‑1 (MQ=255) tGACTGCCCAATCGGCACAATAATCTTCAAGGCTAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCttttt < 2:1033002/99‑1 (MQ=255) aCTGCCCAATCGGCACAATAATCTTCAAGGCTAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCg > 2:1925377/1‑99 (MQ=255) aCTGCCCAATCGGCACAATAATCTTCAAGGCTAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCg < 1:2378784/99‑1 (MQ=255) ctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTTTTTCGc > 1:915713‑M2/91‑99 (MQ=255) gCCCAATCGGCACAATAATCTTCAAGGCTAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCa > 1:1062458/1‑99 (MQ=255) ccAATCGGCACAATAATCTTCAAGGCTAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCaaa > 2:1184168/1‑99 (MQ=255) ttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTTTTTCGCCAAAcc > 2:436723‑M2/85‑99 (MQ=255) aTCGGCACAATAATCTTCAAGGCTAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGggtgatgc < 1:2212489‑M2/99‑9 (MQ=255) aTCGGCACAATAATCTTCAAGGCTAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGggtgatgc < 2:857640‑M2/99‑9 (MQ=255) aTCGGCACAATAATCTTCAAGGCTAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAAccc > 1:2279455/1‑99 (MQ=255) gCACAATAATCTTCAAGGCTAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATg < 1:1847684/99‑1 (MQ=255) acaATAATCTTCAAGGCTAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGcc > 1:470525/1‑99 (MQ=255) acaATAATCTTCAAGGCTAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGcc > 2:852373/1‑99 (MQ=255) caATAATCTTCAAGGCTAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGggtgatgctgccaac > 2:1391052‑M2/1‑84 (MQ=255) tcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCt > 2:2087017‑M2/76‑99 (MQ=255) ataatCTTCAAGGCTAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCtt > 1:293560/1‑99 (MQ=255) ataatCTTCAAGGCTAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCtt < 2:1815590/99‑1 (MQ=255) aatCTTCAAGGCTAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGggtgatgctgccaacttac > 1:1721951‑M2/1‑80 (MQ=255) aatCTTCAAGGCTAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCa < 1:424342/99‑1 (MQ=255) tggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCAt < 2:1687714‑M2/28‑1 (MQ=255) tCTTCAAGGCTAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCAtt < 2:2324832/99‑1 (MQ=255) ttCAAGGCTAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGt < 2:1041654/99‑1 (MQ=255) ctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTAt > 1:912419‑M2/67‑99 (MQ=255) aGGCTAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGggtgatgctgccaacttactgatttag > 2:288884‑M2/1‑72 (MQ=255) aGGCTAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCa > 1:899733/1‑99 (MQ=255) ggCTAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCaa > 2:215925/1‑99 (MQ=255) cTAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACg > 2:1200517/1‑99 (MQ=255) tAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGc < 1:1049290/99‑1 (MQ=255) aaTTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGcc < 1:1800030/99‑1 (MQ=255) ttGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCaa > 1:1015420/1‑99 (MQ=255) aagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAAc > 1:1984977‑M2/57‑99 (MQ=255) tgGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACAt > 1:1701768/1‑99 (MQ=255) ggAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCa > 2:2240135/1‑99 (MQ=255) ggAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCa < 1:2399032/99‑1 (MQ=255) aGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACt < 2:1370163/99‑1 (MQ=255) aGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACt > 2:2347447/1‑99 (MQ=255) gTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTc < 1:1787163/99‑1 (MQ=255) gTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTc > 2:1000070/1‑99 (MQ=255) tGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCa < 1:1180112/99‑1 (MQ=255) gagaTCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttttt < 2:713012‑M2/99‑45 (MQ=255) gagaTCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAg > 1:1666704/1‑99 (MQ=255) agaTCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAgg > 1:63127/1‑99 (MQ=255) agaTCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAgg > 1:543259/1‑99 (MQ=255) attatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCg > 1:28949‑M2/45‑99 (MQ=255) tCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgagg > 1:2131124‑M2/1‑51 (MQ=255) tCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGa < 1:2284392/99‑1 (MQ=255) gTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctcc > 1:1324608‑M2/1‑45 (MQ=255) gTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCTAACATCACTCAGGCGATGAATa > 1:776361/1‑99 (MQ=255) taataataaATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAg < 2:1687976/99‑1 (MQ=255) aataataaATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGc < 2:2237887/99‑1 (MQ=255) cataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGCg > 2:685817‑M2/35‑99 (MQ=255) cataaaacactatcaataagttggagtcattaccCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGCg > 2:1555454‑M2/35‑99 (MQ=255) ataataaATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGCg > 2:911370/1‑99 (MQ=255) ataataaATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGCg > 1:793833/1‑99 (MQ=255) aataaATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGCGTg > 2:374776/1‑99 (MQ=255) aataaATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGCGTg > 2:829132/1‑99 (MQ=255) aaacactatcaataagttggagtcattaccCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGCGTGcc > 2:2201101‑M2/31‑99 (MQ=255) acactatcaataagttggagtcattaccCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGCGTGCCAc > 2:1924596‑M2/29‑99 (MQ=255) aaTGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttc < 2:144101‑M2/99‑64 (MQ=255) atgCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtt < 2:68854‑M2/99‑68 (MQ=255) atgCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGCGTGCCActctc > 1:1603513/1‑99 (MQ=255) tgCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGCGTGCCActctct < 2:812650/99‑1 (MQ=255) caataagttggagtcattaccCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGCGTGCCACTCtctgt < 1:356608‑M2/78‑1 (MQ=255) gcgAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttcta > 1:2190568‑M2/1‑28 (MQ=255) gcgAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGCGTGCCACTCtctgtc > 2:48810/1‑99 (MQ=255) gcgAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGCGTGCCACTCtctgtc > 1:214496/1‑99 (MQ=255) gcgAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGCGTGCCACTCtctgtc < 2:1559960/99‑1 (MQ=255) aGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatca < 2:1608472‑M2/99‑75 (MQ=255) ttAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGCGTGCCACTCTCTGTCTgcgc > 2:1050567/1‑99 (MQ=255) ttggagtcattaccCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGCGTGCCACTCTCTGTCTGCGcc > 1:1233470‑M2/15‑99 (MQ=255) tAATGGATTTAACCCTTTTTCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagct > 1:1597338‑M2/1‑22 (MQ=255) tAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGCGTGCCACTCTCTGTCTGCGcc < 2:576635/99‑1 (MQ=255) gagtcattaccCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGCGTGCCACTCTCTGTCTGCGCCCaa > 1:623557‑M2/12‑99 (MQ=255) 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1:916068/99‑1 (MQ=255) accCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGCGTGCCACTCTCTGTCTGCGCCCAAAACGGGCa < 1:2155670‑M2/96‑1 (MQ=255) accCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGCGTGCCACTCTCTGTCTGCGCCCAAAACGGGCa > 2:1979694‑M2/4‑99 (MQ=255) accCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGCGTGCCACTCTCTGTCTGCGCCCAAAACGGGCa > 2:334388‑M2/4‑99 (MQ=255) accCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGCGTGCCACTCTCTGTCTGCGCCCAAAACGGGCa < 2:604543‑M2/96‑1 (MQ=255) cCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGCGTGCCACTCTCTGTCTGCGCCCAAAACGGGCATc < 1:2190937‑M2/98‑1 (MQ=255) cCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGCGTGCCACTCTCTGTCTGCGCCCAAAACGGGCATc < 1:2030780‑M2/98‑1 (MQ=255) cCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGCGTGCCACTCTCTGTCTGCGCCCAAAACGGGCATc < 1:1232023‑M2/98‑1 (MQ=255) cCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGCGTGCCACTCTCTGTCTGCGCCCAAAACGGGCATc < 2:1176924‑M2/98‑1 (MQ=255) cCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGCGTGCCACTCTCTGTCTGCGCCCAAAACGGGCATc < 1:1632207‑M2/98‑1 (MQ=255) cTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGCGTGCCACTCTCTGTCTGCGCCCAAAACGGGCATcc > 2:1235010/1‑99 (MQ=255) cTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGCGTGCCACTCTCTGTCTGCGCCCAAAACGGGCATcc < 1:1489520/99‑1 (MQ=255) | GGGTTGACTGCCCAATCGGCACAATAATCTTCAAGGCTAATTGTGGGAGTGAGATCTTCGGTAATAATAAATGATGCGCGAGTTAATGGATTTAACCCTTTTTCGCCAAACCCAATGCCCTTCATTGTATCAACGCCAACATCACTCAGGCGATGAATAGCGTGCCACTCTCTGTCTGCGCCCAAAACGGGCATCC > NC_000913/3805553‑3805748 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |