| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 3,802,542 | IS5 (–) +4 bp | 8.7% | coding (514‑517/1020 nt) | waaO ← | UDP‑D‑glucose:(glucosyl)LPS alpha‑1,3‑glucosyltransferase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3652036 = | NA (NA) | 11 (0.120) | 10/176 | NT | 10.4% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 3802545 | 90 (1.030) | coding (514/1020 nt) | waaO | UDP‑D‑glucose:(glucosyl)LPS alpha‑1,3‑glucosyltransferase | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 3653230 | NA (NA) | 6 (0.070) | 6/174 | NT | 6.0% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3802542 = | 89 (1.030) | coding (517/1020 nt) | waaO | UDP‑D‑glucose:(glucosyl)LPS alpha‑1,3‑glucosyltransferase | |||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
TGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAA > NC_000913/3802444‑3802640 | aTAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAAc > 1:259228/1‑99 (MQ=255) aTAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAAc > 1:2304360/1‑99 (MQ=255) aGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGa > 1:876088/1‑99 (MQ=255) gCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATACGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATGCCCGCAACACCTAACGaa > 1:2207322/1‑99 (MQ=255) gaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACGAATg < 1:1546484‑M2/10‑1 (MQ=255) tGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGgc > 1:443902/1‑99 (MQ=255) cAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGgcgc > 1:678730/1‑99 (MQ=255) aaaCCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGtt < 2:1996860/99‑1 (MQ=255) aaaCCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGtt < 2:725963/99‑1 (MQ=255) aaCCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGttt < 1:2262475/99‑1 (MQ=255) aCCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGtttt < 2:822129/99‑1 (MQ=255) atgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACGAATGGGCGCGTTTTTc > 2:1519600‑M2/78‑99 (MQ=255) ctgAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCcca > 2:1493763/1‑99 (MQ=255) ctccgccCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGCTGTTAAATTAACCTTTAGCAATTCCCACAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTTacacca < 2:162816/97‑1 (MQ=255) aGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCccacca > 2:861048/1‑99 (MQ=255) gccgccCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAg < 2:2346004/99‑1 (MQ=255) gccgccCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAg > 2:871167/1‑99 (MQ=255) ccgccCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTCAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGt < 1:1145969/99‑1 (MQ=255) gccCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCa < 1:1350879/99‑1 (MQ=255) gccCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCa > 1:1258370/1‑99 (MQ=255) gccCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCa > 2:534843/1‑99 (MQ=255) cccATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAg > 1:734767/1‑99 (MQ=255) ccATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttc > 1:1676172‑M2/1‑69 (MQ=255) ccATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGc < 1:1588141/99‑1 (MQ=255) ccATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGc < 2:975914/99‑1 (MQ=255) cATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttct > 2:358998‑M2/1‑68 (MQ=255) cATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCt > 2:2393416/1‑99 (MQ=255) cATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCt < 1:522661/99‑1 (MQ=255) aTTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCtt > 1:612833/1‑99 (MQ=255) aTTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCtt > 1:603207/1‑99 (MQ=255) ttGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTg > 1:1107363/1‑99 (MQ=255) ttGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTg > 2:2377740/1‑99 (MQ=255) tGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGc < 1:328244/99‑1 (MQ=255) ggCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggct < 1:1432574‑M2/99‑37 (MQ=255) ggCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGccc > 1:2035715/1‑99 (MQ=255) gCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACATTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGATTGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCt > 2:73439/1‑99 (MQ=255) tctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTc < 2:1704263‑M2/43‑1 (MQ=255) gTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCt > 2:392911/1‑99 (MQ=255) gTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCt < 1:1124254/99‑1 (MQ=255) aTTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGt < 2:512825/99‑1 (MQ=255) aTTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGt < 2:1755080/99‑1 (MQ=255) ttAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTa > 1:2200386/1‑99 (MQ=255) tAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTaa < 2:821405/99‑1 (MQ=255) aaTCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTaac > 2:260769/1‑99 (MQ=255) aaTCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTaac > 1:1963064/1‑99 (MQ=255) aaTCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTaac < 2:850234/99‑1 (MQ=255) aTCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtca < 2:1651443‑M2/99‑47 (MQ=255) cAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTaacaac < 2:611044/99‑1 (MQ=255) cAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTaacaac > 1:849194/1‑99 (MQ=255) cAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTaacaac < 1:2043525/99‑1 (MQ=255) aaTAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAAcc > 2:652252/1‑99 (MQ=255) tAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCAt < 1:182165/99‑1 (MQ=255) aaaaaaCCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCAtt < 1:1125126/99‑1 (MQ=255) aaaaaaCCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCAtt < 1:900437/99‑1 (MQ=255) aaaaaaCCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCAtt > 2:2373076/1‑99 (MQ=255) aaaaaaCCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCAtt > 2:1349626/1‑99 (MQ=255) tgacaaacatgatctcagatcagggacttgttcgcaccttccCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTg > 2:2208162‑M2/43‑99 (MQ=255) aaaaaCCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTg > 2:986027/1‑99 (MQ=255) aaaCCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCg > 1:1638496/1‑99 (MQ=255) aCCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGAc > 2:573153/1‑99 (MQ=255) ggAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcat > 1:2247017‑M2/1‑39 (MQ=255) gTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtt < 1:1639864‑M2/99‑64 (MQ=255) gTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATc < 2:321936/99‑1 (MQ=255) ttAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCg > 2:1177311/1‑99 (MQ=255) atctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATCGCGACTTTATCg > 2:878915‑M2/32‑99 (MQ=255) tAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGt < 2:1230236/99‑1 (MQ=255) aaaGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTc > 1:1956393/1‑99 (MQ=255) aaaGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTc < 2:60894/99‑1 (MQ=255) aaGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCa > 2:2204319/1‑99 (MQ=255) aGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAg > 2:912414/1‑99 (MQ=255) tAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGa > 2:2271063/1‑99 (MQ=255) gtaCCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGa > 2:1411054/3‑99 (MQ=255) aCCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgat < 1:1141534‑M2/99‑73 (MQ=255) aCCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgat < 1:1729518‑M2/99‑73 (MQ=255) aCCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGaaa < 2:1678118/99‑1 (MQ=255) aCCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGaaa < 2:1149487/99‑1 (MQ=255) aCCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGaaa > 2:364016/1‑99 (MQ=255) aCCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGaaa > 1:1803048/1‑99 (MQ=255) aCCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGaaa > 2:1135397/1‑99 (MQ=255) ccTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAAt < 2:1854885/99‑1 (MQ=255) cTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATg > 1:12799/1‑99 (MQ=255) tttAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATga > 1:2118167/1‑99 (MQ=255) tttAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATga < 1:1302860/99‑1 (MQ=255) ttAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATgag > 1:1295853/1‑99 (MQ=255) gCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGaaa > 1:955361/1‑99 (MQ=255) gCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGaaa < 2:214058/99‑1 (MQ=255) cAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAaat < 1:178321/99‑1 (MQ=255) tgttcgcaccttccCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAaatt > 1:1470099‑M2/15‑99 (MQ=255) aTTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAaatta > 2:962245/1‑99 (MQ=255) ttCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAaattaa > 1:250242/1‑99 (MQ=255) ttCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAaattaa > 1:38454/1‑99 (MQ=255) cccGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAaattaatt < 2:2360528/99‑1 (MQ=255) ccGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAattaatta < 2:68959/99‑1 (MQ=255) ccGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAattaatta > 1:908162/1‑99 (MQ=255) cAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTg > 1:927181/1‑99 (MQ=255) aaCACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTgg < 1:2103392/99‑1 (MQ=255) acacCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGc > 2:1707954/1‑99 (MQ=255) cacCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCt < 1:2171346/99‑1 (MQ=255) ccTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttg < 1:2271513‑M2/99‑95 (MQ=255) cTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCaa < 2:1892987/99‑1 (MQ=255) | TGCAATAGCTCGTGCAGAAACCTGCTGAGCCGCCCATTGGGCAGTATTAATCAATAAAAAACCGGAGTTAAAGTAACCTTTAGCAATTCCCGCAACACCTAACGAATGGGCGCGTTTTTCCCACCAGTCAGCTTGCCCTTCTGTAACAACCATTGCGACTTTATCGTCAGGAAATGAGAAATTAATTAGTGGCTCAA > NC_000913/3802444‑3802640 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |