Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,619,235 | C→T | 77.4% | T39I (ACC→ATC) | marR → | DNA‑binding transcriptional repressor MarR |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,619,235 | 0 | C | T | 77.4% | 219.4 / 61.9 | 93 | T39I (ACC→ATC) | marR | DNA‑binding transcriptional repressor MarR |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (10/11); new base T (31/41); total (41/52) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.04e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 |
TTCAATGAAATTATTCCATTGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCAC > NC_000913/1619141‑1619330 | ttCAATGAAATTATTCCATTGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATcgcg > 1:433987/1‑99 (MQ=255) cAATGAAATTATTCCATTGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGc < 1:164471/99‑1 (MQ=255) aaTGAAATTATTCCATTGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGca < 1:1801920/99‑1 (MQ=255) aaTGAAATTATTCCATTGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGca > 2:1762528/1‑99 (MQ=255) aaTGAAATTATTCCATTGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGca > 1:722218/1‑99 (MQ=255) tGAAATTATTCCATTGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGcaca < 2:153519/99‑1 (MQ=255) tGAAATTATTCCATTGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGcaca > 1:878799/1‑99 (MQ=255) aaaTTATTCCATTGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGt < 1:2023520/99‑1 (MQ=255) attattCCATTGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGttt < 2:706353/99‑1 (MQ=255) attattCCATTGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGttt < 1:2033229/99‑1 (MQ=255) attattCCATTGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGttt > 2:601957/1‑99 (MQ=255) ttattCCATTGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTa > 1:1111500/1‑99 (MQ=255) attCCATTGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAg < 1:1869484/99‑1 (MQ=255) ttCCATTGGGTCGCATAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAgg < 2:1559561/99‑1 (MQ=255) cATTGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGtgc > 2:1059026/1‑99 (MQ=255) cATTGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGtgc < 1:866290/99‑1 (MQ=255) aTTGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGtgct > 1:418139/1‑99 (MQ=255) ttGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGtgctc < 2:972654/99‑1 (MQ=255) ttGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGtgctc < 2:441483/99‑1 (MQ=255) ttGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGtgctc > 1:974094/1‑99 (MQ=255) tGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGtgctct < 1:604174/99‑1 (MQ=255) gTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGtgctctgct > 1:1180632/1‑99 (MQ=255) tCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGtgctctgctc > 1:1200868/1‑99 (MQ=255) tCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGtgctctgctc < 1:829091/99‑1 (MQ=255) tCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGtgctctgctc < 2:274677/99‑1 (MQ=255) cTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTAt > 1:902560/1‑99 (MQ=255) ttAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATc < 2:2053692/99‑1 (MQ=255) aTCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGc > 1:1938938/1‑99 (MQ=255) aTCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGc > 2:399820/1‑99 (MQ=255) aTCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGc < 2:78229/99‑1 (MQ=255) aTCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGc > 1:2304182/1‑99 (MQ=255) tCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCt > 1:1995600/1‑99 (MQ=255) tCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCt > 2:1415924/1‑99 (MQ=255) cATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTgc > 2:326208/1‑99 (MQ=255) tatGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTgcgc > 1:1042670/1‑99 (MQ=255) tatGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTgcgc < 2:1822464/99‑1 (MQ=255) tatGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTgcgc > 1:1596457/1‑99 (MQ=255) tGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCgcgg > 2:2064686/1‑99 (MQ=255) tAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCgtg < 1:1638523/99‑1 (MQ=255) aaTCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCgtgt > 2:1445245/1‑99 (MQ=255) aTCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTa > 2:356587/1‑99 (MQ=255) gaagaaAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTAc < 2:724571/99‑1 (MQ=255) agaaagaTCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTc < 2:1641858/99‑1 (MQ=255) agaaagaTCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTc > 1:488694/1‑99 (MQ=255) gaaagaTCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTcc > 2:1295978/1‑99 (MQ=255) gaaagaTCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTcc > 1:745957/1‑99 (MQ=255) aaagaTCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCg > 1:301731/1‑99 (MQ=255) aaagaTCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCg > 1:1076240/1‑99 (MQ=255) agaTCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGt < 1:131884/99‑1 (MQ=255) agaTCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGt > 2:501194/1‑99 (MQ=255) gaTCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGtt < 1:936627/99‑1 (MQ=255) gaTCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGtt < 2:2134490/99‑1 (MQ=255) aTCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTg > 2:589373/1‑99 (MQ=255) aTCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTg > 1:1561226/1‑99 (MQ=255) tCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGa > 1:1819123/1‑99 (MQ=255) tCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGa > 2:266113/1‑99 (MQ=255) cGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGaa < 1:1151302/99‑1 (MQ=255) gCCTGCTTAACGGGTGTCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGGGGCGTGTATTACTCCGGTTGAAc < 2:832032/99‑1 (MQ=255) gCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGaa < 2:804448/99‑1 (MQ=255) gCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGaa > 2:1436630/1‑99 (MQ=255) cTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGaaa < 1:1634779/99‑1 (MQ=255) cTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGaaa < 2:801840/99‑1 (MQ=255) ttAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGaaaa < 2:413474/99‑1 (MQ=255) tAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGaaaaa < 2:1216886/99‑1 (MQ=255) aaCGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAg < 1:1679534/99‑1 (MQ=255) aaCGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAg > 2:964772/1‑99 (MQ=255) aaCGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAg < 1:251496/99‑1 (MQ=255) aCGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAgg < 2:1925867/99‑1 (MQ=255) cGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGt < 1:113407/99‑1 (MQ=255) gAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTa < 1:1329246/99‑1 (MQ=255) aGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTAt < 1:1750086/99‑1 (MQ=255) aGTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTAt < 2:839875/99‑1 (MQ=255) gTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTAtt < 1:1407608/99‑1 (MQ=255) gTATCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTAtt > 2:694709/1‑99 (MQ=255) aTCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTgt < 2:901485/99‑1 (MQ=255) aTCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTgt < 1:1693112/99‑1 (MQ=255) aTCTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTgt < 2:1920205/99‑1 (MQ=255) cTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTgtcg < 1:2404959/99‑1 (MQ=255) cTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTgtcg < 2:1826234/99‑1 (MQ=255) cTGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTgtcg < 1:1208984/99‑1 (MQ=255) tGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTgtcgg < 1:568850/99‑1 (MQ=255) tGTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTgtcgg < 1:938640/99‑1 (MQ=255) gTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTgtcggt < 1:2154889/99‑1 (MQ=255) gTCTCCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTgtcggt < 1:1730929/99‑1 (MQ=255) tctcCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTgtcggtc < 2:1510976/99‑1 (MQ=255) tctcCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTgtcggtc < 1:1328289/99‑1 (MQ=255) ctcCGCTGGATATTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTgtcggtcg > 2:689580/1‑99 (MQ=255) gATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGa < 1:2200878/99‑1 (MQ=255) gATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGa > 1:1214357/1‑99 (MQ=255) atatTATCGCGGCAGAGTATAAGGCACTCCGGGCTGTCCGCAGCGCGCCATGTATCAGTACGGTTGAAGTGAAAAAGGTAGTGTCGGTCGACCTGagag > 2:2360898/1‑99 (MQ=255) atatTATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAg < 1:163020/99‑1 (MQ=255) tattatCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGc > 1:872117/1‑99 (MQ=255) ttATCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCAc > 1:1616797/1‑99 (MQ=255) ttACCGCGGCACAGGTTGAGTTGCTCTGCTCTATCCGCGGCGCGGCGTGTATTACTGCGGTTGGACTGAGAAGGGTATTGGCGGTCGCCCTGGGTGCAc > 2:776158/1‑99 (MQ=255) | TTCAATGAAATTATTCCATTGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCAC > NC_000913/1619141‑1619330 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |