New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2868098 = | 78 (0.780) | 3 (0.030) | 3/176 | NT | 3.7% | coding (656/1140 nt) | nlpD | murein hydrolase activator NlpD |
? | NC_000913 | = 3131340 | NA (NA) | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
ATGTACTGCTGACAGTCGGCTCGGTTGTGCTTGCTGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTTGTGCAGGCTTGATCACAACTCCTTGC > NC_000913/2868000‑2868196 | aTGTACTGCTGACAGTCGGCTCGGTTGTGCTTGCTGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGt < 1:1138271/99‑1 (MQ=255) tGTACTGCTGACAGTCGGCTCGGTTGTGCTTGCTGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGtt < 1:417989/99‑1 (MQ=255) gTACTGCTGACAGTCGGCTCGGTTGTGCTTGCTGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTa > 2:1809174/1‑99 (MQ=255) gTACTGCTGACAGTCGGCTCGGTTGTGCTTGCTGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTa < 1:2399380/99‑1 (MQ=255) gTACTGCTGACAGTCGGCTCGGTTGTGCTTGCTGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTa > 1:1844990/1‑99 (MQ=255) tACTGCTGACAGTCGGCTCGGTTGTGCTTGCTGTTGGTACCGCTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAg < 2:1613484/99‑1 (MQ=255) ctgctgACAGTCGGCTCGGTTGTGCTTGCTGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCa < 2:1625334/99‑1 (MQ=255) ctgctgACAGTCGGCTCGGTTGTGCTTGCTGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCa > 1:1611389/1‑99 (MQ=255) tgctgACAGTCGGCTCGGTTGTGCTTGCTGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCAc < 2:1666387/99‑1 (MQ=255) tgctgACAGTCGGCTCGGTTGTGCTTGCTGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCAc < 2:2364023/99‑1 (MQ=255) tgctgACAGTCGGCTCGGTTGTGCTTGCTGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCAc > 1:1030041/1‑99 (MQ=255) ctgACAGTCGGCTCGGTTGTGCTTGCTGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCActc > 2:455113/1‑99 (MQ=255) ctgACAGTCGGCTCGGTTGTGCTTGCTGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCActc < 2:1104338/99‑1 (MQ=255) tgACAGTCGGCTCGGTTGTGCTTGCTGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCActct > 1:1656345/1‑99 (MQ=255) tgACAGTCGGCTCGGTTGTGCTTGCTGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCActct > 2:2262042/1‑99 (MQ=255) aCAGTCGGCTCGGTTGTGCTTGCTGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGt > 2:2116972/1‑99 (MQ=255) aCAGTCGGCTCGGTTGTGCTTGCTGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGt < 2:733203/99‑1 (MQ=255) cAGTCGGCTCGGTTGTGCTTGCTGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGtt < 2:695228/99‑1 (MQ=255) cAGTCGGCTCGGTTGTGCTTGCTGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGtt > 1:2090192/1‑99 (MQ=255) cAGTCGGCTCGGTTGTGCTTGCTGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGtt > 2:1757769/1‑99 (MQ=255) gTCGGCTCGGTTGTGCTTGCTGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCa > 1:454532/1‑99 (MQ=255) gTCGGCTCGGTTGTGCTTGCTGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCa > 1:104391/1‑99 (MQ=255) tCGGCTCGGTTGTGCTTGCTGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCAc < 1:1406871/99‑1 (MQ=255) cTCGGTTGTGCTTGCTGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGa < 1:2193364/99‑1 (MQ=255) cTCGGTTGTGCTTGCTGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGa < 1:257949/99‑1 (MQ=255) ggTTGTGCTTGCTGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGa < 1:335491/99‑1 (MQ=255) ggTTGTGCTTGCTGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGa < 2:1026330/99‑1 (MQ=255) gtgCTTGCTGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCa < 2:2476610/99‑1 (MQ=255) gcttgctGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGa < 1:2288045/99‑1 (MQ=255) gcttgctGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGa > 2:2087683/1‑99 (MQ=255) gcttgctGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGa > 2:344706/1‑99 (MQ=255) cttgctGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGaa < 1:2209972/99‑1 (MQ=255) cttgctGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGaa < 1:2187359/99‑1 (MQ=255) ttgctGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAAt > 1:1722075/1‑99 (MQ=255) ttgctGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAAt < 2:1222016/99‑1 (MQ=255) ttGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGAGGTCGCTGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTaa > 2:987220/1‑99 (MQ=255) tGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAAt < 2:1558135/99‑1 (MQ=255) tACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGt > 2:385805/1‑99 (MQ=255) tACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGt > 2:1341723/1‑99 (MQ=255) tACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGt < 2:1415815/99‑1 (MQ=255) gTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGt > 2:2108300/1‑99 (MQ=255) gTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGt < 2:1633083/99‑1 (MQ=255) aCAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGc < 1:1535149/99‑1 (MQ=255) aGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGa < 1:66196/99‑1 (MQ=255) aGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGa < 1:1463102/99‑1 (MQ=255) ggCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGAc > 2:552129/1‑99 (MQ=255) ggCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGAc > 2:161120/1‑99 (MQ=255) gcTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCa > 2:565241/1‑99 (MQ=255) cTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCaa < 2:1164929/99‑1 (MQ=255) cTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCaa < 1:2107266/99‑1 (MQ=255) tgACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAg > 1:1560337/1‑99 (MQ=255) gACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGc < 2:840926/99‑1 (MQ=255) aCCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCa > 2:922232/1‑99 (MQ=255) ccGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCaa < 2:1459795/99‑1 (MQ=255) ccGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCaa < 2:2377657/99‑1 (MQ=255) tGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACgg < 2:588410/99‑1 (MQ=255) tGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACgg < 1:1996526/99‑1 (MQ=255) cgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTg > 2:1657110‑M1/34‑99 (MQ=255) gaagaatttccccgcttattcgcaccttccTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGaa < 2:477567‑M1/69‑1 (MQ=255) cAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAAt < 2:1168121/99‑1 (MQ=255) agaatttccccgcttattcgcaccttccTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAAtt < 1:145932‑M1/71‑1 (MQ=255) gTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAAttt > 1:2376613/1‑99 (MQ=255) gTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAAttt > 2:27772/1‑99 (MQ=255) tGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTtg < 2:1618862/99‑1 (MQ=255) ggCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTtgt > 2:2237206/1‑99 (MQ=255) gCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTtgtg > 2:673637/1‑99 (MQ=255) cTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTTGTGc > 1:130272/1‑99 (MQ=255) ttgttgTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTTGTGCa > 1:2438754/1‑99 (MQ=255) ttgttgTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTTGTGCa > 2:2570767/1‑99 (MQ=255) tgttgtTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTTGTGCAg > 2:195454/1‑99 (MQ=255) tgttgtTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTTGTGCAg > 2:1572708/1‑99 (MQ=255) ttgttCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTTGTGCAGGc < 2:2038237/99‑1 (MQ=255) ttgttCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTTGTGCAGGc < 2:569969/99‑1 (MQ=255) ttgttCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTTGTGCAGGc > 2:2521811/1‑99 (MQ=255) tgttCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTTGTGCAGGCt < 2:2222067/99‑1 (MQ=255) gttCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTTGTGCAGGCtt < 2:1968690/99‑1 (MQ=255) gttCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTTGTGCAGGCtt > 1:1664683/1‑99 (MQ=255) tCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTTGTGCAGGCTTGa < 2:1493808/99‑1 (MQ=255) tCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTTGTGCAGGCTTGa < 2:186773/99‑1 (MQ=255) tCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTTGTGCAGGCTTGa < 2:797392/99‑1 (MQ=255) ggCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTTGTGCAGGCTTGATc > 1:63694/1‑99 (MQ=255) gCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTTGTGCAGGCTTGATca > 1:2082374/1‑99 (MQ=255) gCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTTGTGCAGGCTTGATca > 1:1311795/1‑99 (MQ=255) cAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTTGTGCAGGCTTGATcac > 2:771446/1‑99 (MQ=255) aCATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTTGTGCAGGCTTGATCACaa > 2:578199/1‑99 (MQ=255) aTTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTTGTGCAGGCTTGATCACAACt > 1:608166/1‑99 (MQ=255) aTTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTTGTGCAGGCTTGATCACAACt < 2:1287039/99‑1 (MQ=255) ttttGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTTGTGCAGGCTTGATCACAACTc > 2:495518/1‑99 (MQ=255) ttttGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTTGTGCAGGCTTGATCACAACTc < 1:1322938/99‑1 (MQ=255) ttttGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATCTTGTGCAGGCTTGATCAGAACTc > 2:859477/1‑99 (MQ=255) tGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTTGTGCAGGCTTGATCACAACTCCtt < 2:1441619/99‑1 (MQ=255) tGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTTGTGCAGGCTTGATCACAACTCCtt < 1:1836857/99‑1 (MQ=255) tGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTTGTGCAGGCTTGATCACAACTCCtt < 2:1690131/99‑1 (MQ=255) tGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTTGTGCAGGCTTGATCACAACTCCtt < 1:704367/99‑1 (MQ=255) ttAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTTGTGCAGGCTTGATCACAACTCCTTGc < 1:575632/99‑1 (MQ=255) | ATGTACTGCTGACAGTCGGCTCGGTTGTGCTTGCTGTTGGTACCGTTACAGGCGCTGTGACCGTGGTCGCAGTTGGCTTGTTGTTCGGCAACATTTTGTTAGCACTCTGTTCACCCGAAGACTCAGAATACGTAATTGTCGGTTGCGACGCAACAGCAACGGTGGAATTTTGTGCAGGCTTGATCACAACTCCTTGC > NC_000913/2868000‑2868196 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |