| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,560,455:1 | +G | 100% | pseudogene (151/758 nt) | glpR ← | DNA‑binding transcriptional repressor GlpR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,560,455 | 1 | . | G | 97.7% | 351.1 / ‑1.1 | 86 | pseudogene (151/758 nt) | glpR | DNA‑binding transcriptional repressor GlpR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/1); new base G (33/51); total (34/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
GGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑C‑CAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGA > NC_000913/3560360‑3560547 | gggCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑cgca < 2:1781850/99‑4 (MQ=255) cGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGa > 1:158637/1‑99 (MQ=255) gATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGAt < 2:2200276/99‑1 (MQ=255) gATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGAt < 2:2333262/99‑1 (MQ=255) gATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGAt > 1:1543904/1‑99 (MQ=255) gATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGAt > 2:2341922/1‑99 (MQ=255) gcTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGt < 2:1744698/99‑1 (MQ=255) gcTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGt < 2:648075/99‑1 (MQ=255) tctTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGttt < 2:2134164/99‑1 (MQ=255) ttttCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGc < 1:1287972/99‑1 (MQ=255) ttcttcGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTc < 1:2358876/99‑1 (MQ=255) ttcGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGc > 2:545184/1‑99 (MQ=255) ttcGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGc > 1:2010872/1‑99 (MQ=255) tcGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGcc < 1:1145986/99‑1 (MQ=255) gTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGc > 2:1906272/1‑99 (MQ=255) gTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGc < 2:763888/99‑1 (MQ=255) gTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGc < 2:192614/99‑1 (MQ=255) cTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTc < 1:1275315/99‑1 (MQ=255) tGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCa > 2:1438389/1‑99 (MQ=255) tGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCa > 1:2369040/1‑99 (MQ=255) tGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCa < 2:1994104/99‑1 (MQ=255) gggTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCAt > 2:265244/1‑99 (MQ=255) ggTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCAtt > 2:464535/1‑99 (MQ=255) tGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGa > 1:1709489/1‑99 (MQ=255) gCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAgg < 1:1726125/99‑1 (MQ=255) gCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAgg < 1:1607324/99‑1 (MQ=255) gCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAgg < 1:2385788/99‑1 (MQ=255) ccTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGt < 1:1058266/99‑1 (MQ=255) cTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTc > 2:1299749/1‑99 (MQ=255) ttGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTcg > 1:118424/1‑99 (MQ=255) gATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCgcggc > 1:856173/1‑99 (MQ=255) aTCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCgcggcg > 1:304646/1‑99 (MQ=255) aTCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCgcggcg > 2:252642/1‑99 (MQ=255) gCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAg < 1:1228123/99‑1 (MQ=255) ccACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGt < 1:623454/99‑1 (MQ=255) cACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTc < 2:849631/99‑1 (MQ=255) cACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTc < 2:1577347/99‑1 (MQ=255) cACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTc < 2:1361491/99‑1 (MQ=255) aCGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCt < 2:2511294/99‑1 (MQ=255) aCGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCt > 2:1020040/1‑99 (MQ=255) cGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTg < 1:2006237/99‑1 (MQ=255) tgtTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGc < 2:1117403/99‑1 (MQ=255) tgtTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGc < 1:307845/99‑1 (MQ=255) tgtTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGc < 1:2206380/99‑1 (MQ=255) tgtTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGc < 1:1561247/99‑1 (MQ=255) tttAACCGAAGAGGAAGGCAGCACTGAACCGCGACGATGTA‑C‑CATGATCATGTTTTGCTCCGCCAGCTCGGTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCAGGCt < 2:863123/98‑1 (MQ=255) gtTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCt < 2:940050/99‑1 (MQ=255) ttAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTg > 1:632962/1‑99 (MQ=255) ttAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTg > 2:296916/1‑99 (MQ=255) ttAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTg > 1:2455190/1‑99 (MQ=255) aCCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACg < 2:1659307/99‑1 (MQ=255) cGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGga < 2:802292/99‑1 (MQ=255) gAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGgag > 1:322744/1‑99 (MQ=255) aaCTGGAAGTCAGCGCTGTACGGCCATGATG‑GCC‑CAGGATCAGGTTTTGTTCCGCCAGATCATTGAGGTCACGGCGAATAGTCTGCGGGCTATCGgaga > 2:81933/1‑99 (MQ=255) aCTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGaa > 2:1307041/1‑99 (MQ=255) cTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGaaa < 1:1223664/99‑1 (MQ=255) tGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAAt > 2:1610349/1‑99 (MQ=255) tGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAAt > 1:491575/1‑99 (MQ=255) gAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGc < 2:1547558/99‑1 (MQ=255) aaGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGct > 2:631420/1‑99 (MQ=255) aaGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGct < 1:2457433/99‑1 (MQ=255) aGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGctc < 1:584476/99‑1 (MQ=255) aGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGctc < 1:1506089/99‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGctct < 1:1680473/99‑1 (MQ=255) ggCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGctct < 1:2270889/99‑1 (MQ=255) gCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTa > 1:2499879/1‑99 (MQ=255) cAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTAc < 2:1794812/99‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTAc < 1:490996/99‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTAc < 1:210045/99‑1 (MQ=255) cAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTAc < 2:233196/99‑1 (MQ=255) gccgcACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGc < 2:1053407/99‑1 (MQ=255) gccgcACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGc < 2:2328039/99‑1 (MQ=255) gccgcACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGc < 2:1197969/99‑1 (MQ=255) gcACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGctct > 2:110085/1‑99 (MQ=255) cACCGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCtt > 2:397334/1‑99 (MQ=255) ccGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCg < 1:206207/99‑1 (MQ=255) cGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCgg < 2:1342796/99‑1 (MQ=255) cGCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCgg < 2:1309592/99‑1 (MQ=255) gCCATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGt > 2:459385/1‑99 (MQ=255) ccATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTa > 1:2220842/1‑99 (MQ=255) ccATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTa < 2:2139698/99‑1 (MQ=255) ccATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTa > 1:728918/1‑99 (MQ=255) cATGATG‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTAc < 2:1870860/99‑1 (MQ=255) atgatg‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACt < 2:1262116/99‑1 (MQ=255) tgatg‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTg > 2:1714002/1‑99 (MQ=255) gatg‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGa < 1:2486456/99‑1 (MQ=255) gatg‑G‑CGCAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGa > 1:641863/1‑99 (MQ=255) | GGGCGATGCGCTCTTTTTCTTCGGTCTGGGTGGCCTTGCGATCGTGCCACGGCGTGTTAACCGAACTGGAAGGCAGCGCCGCACCGCCATGATG‑G‑C‑CAGGATCAGGTTTTGCTCCGCCAGCTCATTGAGGTCGCGGCGAATAGTCTGCGGGCTGACGGAGAAATGCTCTACCAGCTCTTCGGTACTGA > NC_000913/3560360‑3560547 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |