New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3395127 | 85 (0.890) | 3 (0.040) | 3/146 | NT | 3.2% | coding (1132/3801 nt) | yhdP | AsmA2 domain‑containing protein |
? | NC_000913 | 3395995 = | 109 (1.380) | coding (264/3801 nt) | yhdP | AsmA2 domain‑containing protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
CGGTAATAATTTCCATTGCTTCCAGGCCAGATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGTTTCGCGGCCAGCGGGCGTATGCCCTCCAGGCCTGCCAGCT > NC_000913/3395032‑3395225 | cGGTAATAATTTCCATTGCTTCCAGGCCAGATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGtt > 2:1889677/1‑99 (MQ=255) ataatTTCCATTGCTTCCAGGCCAGATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCt < 2:1223182/99‑1 (MQ=255) taatTTCCATTGCTTCCAGGCCAGATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCtt < 2:1144289/99‑1 (MQ=255) taatTTCCATTGCTTCCAGGCCAGATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCtt > 2:237992/1‑99 (MQ=255) atTTCCATTGCTTCCAGGCCAGATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGc > 2:707803/1‑99 (MQ=255) atTTCCATTGCTTCCAGGCCAGATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGc < 1:8306/99‑1 (MQ=255) tttCCATTGCTTCCAGGCCAGATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGcc < 2:1574108/99‑1 (MQ=255) tttCCATTGCTTCCAGGCCAGATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGcc < 1:43315/99‑1 (MQ=255) tCCATTGCTTCCAGGCCAGATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGc < 2:1133975/99‑1 (MQ=255) tCCATTGCTTCCAGGCCAGATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGc < 2:402554/99‑1 (MQ=255) cATTGCTTCCAGGCCAGATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTc < 2:1769045/99‑1 (MQ=255) cATTGCTTCCAGGCCAGATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTc < 1:143106/99‑1 (MQ=255) cATTGCTTCCAGACCAGATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTc > 2:2057379/1‑99 (MQ=255) aTTGCTTCCAGGCCAGATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCg > 2:1787510/1‑99 (MQ=255) ttGCTTCCAGGCCAGATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCgg > 1:1395200/1‑99 (MQ=255) ttGCTTCCAGGCCAGATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCgg > 2:184546/1‑99 (MQ=255) gCTTCCAGGCCAGATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGtt > 1:548795/1‑99 (MQ=255) gCTTCCAGGCCAGATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGtt > 2:806975/1‑99 (MQ=255) cTTCCAGGCCAGATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTtg > 2:1621352/1‑99 (MQ=255) cTTCCAGGCCAGATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTtg < 1:1197030/99‑1 (MQ=255) cTTCCAGGCCAGATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTtg < 2:2301283/99‑1 (MQ=255) ttCCAGGCCAGATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTGAATCTTGCCGCTCGGTtgt < 2:2109807/99‑1 (MQ=255) tCCAGGCCAGATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTtgtg < 2:412593/99‑1 (MQ=255) aGGCCAGATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTgg > 1:1134688/1‑99 (MQ=255) ggCCAGATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGa < 1:1581939/99‑1 (MQ=255) gCCAGATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAg > 2:2479722/1‑99 (MQ=255) ccAGATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAgc < 1:1697503/99‑1 (MQ=255) cAGATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAgcg > 1:426043/1‑99 (MQ=255) gATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGcc < 1:980888/99‑1 (MQ=255) gATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGcc > 2:1752449/1‑99 (MQ=255) gATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGcc > 1:1629729/1‑99 (MQ=255) aTCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGGGTGGAGCGCCa > 2:615693/1‑99 (MQ=255) tCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCaa > 2:1199650/1‑99 (MQ=255) cGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCaaa < 2:2008329/99‑1 (MQ=255) gCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAAc > 2:1560952/1‑99 (MQ=255) cTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACa < 2:2209096/99‑1 (MQ=255) tCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCTTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTGTTATTGCCCCTCGATTGTGTGGAGCGCAAAACAt > 2:1909171/1‑99 (MQ=255) aCGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCAc > 2:1470200/1‑99 (MQ=255) aCGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCAc > 2:69878/1‑99 (MQ=255) aCGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCAc < 2:2048003/99‑1 (MQ=255) cGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCAcc < 2:350408/99‑1 (MQ=255) aTGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCa > 1:2472286/1‑99 (MQ=255) tGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAg > 1:918822/1‑99 (MQ=255) tGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCa > 1:461922/1‑99 (MQ=255) aaaaCGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAgg > 1:823848/1‑99 (MQ=255) aaaaCGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAgg > 2:1445995/1‑99 (MQ=255) aaaaCGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAgg < 1:253781/99‑1 (MQ=255) aaaCGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGt > 1:2248012/1‑99 (MQ=255) aaCGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTg < 1:1344474/99‑1 (MQ=255) gTCTTGTCTGCCGCGTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTaacgcgtttaaccgaaaattcg < 1:258817‑M1/63‑23 (MQ=255) gTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTaacgcgtttaaccgaaaattcg > 2:258817‑M1/1‑41 (MQ=255) gTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGt < 2:266239/99‑1 (MQ=255) gTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGt > 1:1111045/1‑99 (MQ=255) gTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGt < 1:1163529/99‑1 (MQ=255) gTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGt > 1:306/1‑99 (MQ=255) tCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGtt > 2:1839261/1‑99 (MQ=255) tGTCTGCCGCCTGGAACGGGGTGTCCAGCGCCAGAGTGTTAATTTTGCCGCTCGGTTGTGTGGGGCGCAAAACAGCACCAAGTAAAGGTGAACGTTTcg < 2:626345/99‑1 (MQ=255) gTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGTTTcgc < 2:1860903/99‑1 (MQ=255) tCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGTTTcgcg < 1:1406160/99‑1 (MQ=255) tCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGTTTcgcg > 2:1040068/1‑99 (MQ=255) cgccTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGTTTCGCGGCCAg < 1:2208654/99‑1 (MQ=255) gccTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGTTTCGCGGCCAGc > 2:2417903/1‑99 (MQ=255) tGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGTTTCGCGGCCAGCggg < 2:1441551/99‑1 (MQ=255) aGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGTTTCGCGGCCAGCGGGCGt > 1:1018160/1‑99 (MQ=255) gCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGTTTCGCGGCCAGCGGGCGTa > 1:2117675/1‑99 (MQ=255) gCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGTTTCGCGGCCAGCGGGCGTa > 1:155532/1‑99 (MQ=255) gCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGTTTCGCGGCCAGCGGGCGTa < 1:1261024/99‑1 (MQ=255) gggATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGTTTCGCGGCCAGCGGGCGTATg > 2:1926835/1‑99 (MQ=255) gggATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGTTTCGCGGCCAGCGGGCGTATg > 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tCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGTTTCGCGGCCAGCGGGCGTATGCCCTcc > 2:2459413/1‑99 (MQ=255) ccAGCGCTAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGTTTCGCGGCCAGCGGGCGTATGCCCTCCa < 1:711265/99‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGAGTaacgcgtttaaccgaaaattcgccgccatcttttagttctgcacggatgtcgtgtgcttcaagcgtcgggccaaaattctgccagc > 1:474987‑M1/1‑13 (MQ=255) cAGCGCCAGAGTaacgcgtttaaccgaaaattcgccgccatcttttagttctgcacggatgtcgtgtgcttcaagcgtcgggccaaaattctgccagct > 2:2256166‑M1/1‑12 (MQ=255) aGCGCCAGAGTaacgcgtttaaccgaaaattcgccgccatcttttagttctgcacggatgtcgtgtgcttcaagcgtcgggccaaaattctgccagctg > 1:829982‑M1/1‑11 (MQ=255) gcgcCAGAGTaacgcgtttaaccgaaaattcgccgccatcttttagttctgcacggatgtcgtgtgcttcaagcgtcgggccaaaattctgccagctgg > 2:155756‑M1/1‑10 (MQ=255) gcgcCAGAGTaacgcgtttaaccgaaaattcgccgccatcgtttagttctgcacggatgtcgtgtgcttcaagcgtcgggccaaaattctgccagctgg > 2:2483252‑M1/1‑10 (MQ=255) gcgcCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGTTTCGCGGCCAGCGGGCGTATGCCCTCCAGGc > 1:2414762/1‑99 (MQ=255) cgcCAGAGTaacgcgtttaaccgaaaattcgccgccatcttttagttctgcacggatgtcgtgtgcttcaagcgtcgggccaaaattctgccagctggc < 1:1270918‑M1/99‑91 (MQ=255) ccAGAGTgacgcgtttaaccgaaaattcgccgccatcttttagttctgcacggatgtcgtgtgcttcaagcgtcgggccaaaattctgccagctggctg > 1:371963‑M1/1‑7 (MQ=255) ccAGAGTaacgcgtttaaccgaaaattcgccgccatcttttagttctgcacggatgtcgtgtgcttcaagcgtcgggccaaaattctgccagctggctg > 2:49451‑M1/1‑7 (MQ=255) ccAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGTTTCGCGGCCAGCGGGCGTATGCCCTCCAGGCCTg < 2:1042528/99‑1 (MQ=255) agagTaacgcgtttaaccgaaaattcgccgccatcttttagttctgcacggatgtcgtgtgcttcaagcgtcgggccaaaattctgccagctggctgag > 1:89685‑M1/1‑5 (MQ=255) gagTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGTTTCGCGGCCAGCGGGCGTATGCCCTCCAGGCCTGCCa > 2:2508849/1‑99 (MQ=255) gagTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGTTTCGCGGCCAGCGGGCGTATGCCCTCCAGGCCTGCCa > 2:1929382/1‑99 (MQ=255) gagTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGTTTCGCGGCCAGCGGGCGTATGCCCTCCAGGCCTGCCa > 2:65688/1‑99 (MQ=255) gagTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGTTTCGCGGCCAGCGGGCGTATGCCCTCCAGGCCTGCCa > 2:2360351/1‑99 (MQ=255) agTaacgcgtttaaccgaaaattcgccgccatcttttagttctgcacggatgtcgtgtgcttcaagcgtcgggccaaaattctgccagctggctgagag < 2:1398957‑M1/99‑97 (MQ=255) agTaacgcgtttaaccgaaaattcgccgccatcttttagttctgcacggatgtcgtgtgcttcaagcgtcgggccaaaattctgccagctggctgagag > 1:2349387‑M1/1‑3 (MQ=255) agTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGTTTCGCGGCCAGCGGGCGTATGCCCTCCAGGCCTGCCAg > 2:1285053/1‑99 (MQ=255) agTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGTTTCGCGGCCAGCGGGCGTATGCCCTCCAGGCCTGCCAg < 1:1303359/99‑1 (MQ=255) gTaacgcgtttaaccgaaaattcgccgccatcttttagttctgcacggatgtcgtgtgcttcaagcgtcgggccaaaattctgccagctggctgagagc < 1:2024122‑M1/99‑98 (MQ=255) tgtTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGTTTCGCGGCCAGCGGGCGTATGCCCTCCAGGCCTGCCAGCt > 1:2196775/1‑99 (MQ=255) taacgcgtttaaccgaaaattcgccgccatcttttagttctgcacggatgtcgtgtgcttcaagcgtcgggccaaaattctgccagctggctgagagct < 2:1714725‑M1/99‑99 (MQ=255) | CGGTAATAATTTCCATTGCTTCCAGGCCAGATCGCTCCACGATGCCTGAAAACGGGTCTTGTCTGCCGCCTGAAGCGGGATATCCAGCGCCAGAGTGTTAATCTTGCCGCTCGGTTGTGTGGAGCGCCAAACATCACCCAGTGCAGGTGAAAGTTTCGCGGCCAGCGGGCGTATGCCCTCCAGGCCTGCCAGCT > NC_000913/3395032‑3395225 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |