Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 2,857,096 | Δ2,538 bp | coding (4‑2541/2562 nt) | mutS → | DNA mismatch repair protein MutS |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 2857096 | 2859633 | 2538 | 78 [0] | [0] 80 | mutS | DNA mismatch repair protein MutS |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 2857095 | 0 (0.000) | 77 (1.400) | 58/274 | 0.0 | 100% | coding (3/2562 nt) | mutS | DNA mismatch repair protein MutS |
? | NC_000913 | 2859634 = | 0 (0.000) | coding (2542/2562 nt) | mutS | DNA mismatch repair protein MutS |
GCCGCTACGCAAGTGGATGGTACGCAAATGTCTTTGCTGTCAGTACCAGAAGAAACTTCGCCTGCGGTCGAAGCTCTGGAAAATCTTGATCCGGATTCACTCACCCCGCGTCAGGCGCTGGAGTGGATTTATCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACG > NC_000913/2859502‑2859773 | catcaagaactcgccgttcgcttcttcccctgaaatgattaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGaa < 2:312672‑M2/8‑1 (MQ=255) aagaactcgccgttcgcttcttcccctgaaatgattaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGc > 2:150910‑M2/129‑140 (MQ=255) aagaactcgccgttcgcttcttcccctgaaatgattaactcaggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgcgc > 1:707205‑M2/129‑131 (MQ=255) aagaactcgccgttcgcttcttcccctgaaatgattaactcaggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgcgc < 2:707205‑M2/3‑1 (MQ=255) ctcgccgttcgcttcttcccctgaaatgattaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGgt < 1:310231‑M2/17‑1 (MQ=255) ctcgccgttcgcttcttcccctgaaatgattaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGgt > 1:146198‑M2/124‑140 (MQ=255) tcgccgttcgcttcttcccctgaaatgattaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGgtg > 2:896447‑M2/123‑140 (MQ=255) cgttcgcttcttcccctgaaatgattaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGaa < 2:112634‑M2/8‑1 (MQ=255) cgttcgcttcttcccctgaaatgattaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGaa > 1:112634‑M2/119‑126 (MQ=255) cgttcgcttcttcccctgaaatgattaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGa > 2:427369‑M2/119‑125 (MQ=255) cgttcgcttcttcccctgaaatgattaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGa < 1:427369‑M2/7‑1 (MQ=255) gcttcttcccctgaaatgattaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACaa < 2:146198‑M2/27‑1 (MQ=255) ttcccctgaaatgattaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTccc > 2:818836‑M2/109‑140 (MQ=255) cctgaaatgattaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATa < 1:818836‑M2/36‑1 (MQ=255) tgattaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCtttt > 1:763392‑M2/98‑140 (MQ=255) attaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGc > 1:141604‑M2/96‑140 (MQ=255) attaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGc > 2:50816‑M2/96‑140 (MQ=255) ttaactccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCt > 2:1009530‑M2/95‑140 (MQ=255) ctccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCg > 2:683474‑M2/91‑140 (MQ=255) tccggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCgg < 1:50816‑M2/51‑1 (MQ=255) cggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGa < 2:141604‑M2/53‑1 (MQ=255) cggtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGa < 2:570428‑M2/53‑1 (MQ=255) gtatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAat > 2:791970‑M2/86‑140 (MQ=255) tatcatgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAata < 1:791970‑M2/56‑1 (MQ=255) atgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTaa > 1:797390‑M2/81‑140 (MQ=255) atgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTaa < 2:763392‑M2/60‑1 (MQ=255) tgtgcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacatcccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAAc > 1:911304‑M2/80‑140 (MQ=255) gcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGAc > 1:235807‑M2/77‑140 (MQ=255) gcgccttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccacatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGAc < 2:989478‑M2/64‑1 (MQ=255) cttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACt > 2:339401‑M2/73‑140 (MQ=255) cttatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACt > 2:986456‑M2/73‑140 (MQ=255) tatgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGa > 2:618997‑M2/71‑140 (MQ=255) atgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGAc > 1:940839‑M2/70‑140 (MQ=255) tgtgattacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACg > 2:175682‑M2/69‑140 (MQ=255) ttacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGaataa > 1:1014236‑M2/64‑140 (MQ=255) tacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGaataaa > 1:1003607‑M2/63‑140 (MQ=255) tacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGaataaa > 2:1003208‑M2/63‑140 (MQ=255) tacaacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGaataaa > 2:89116‑M2/63‑140 (MQ=255) caacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGaataaaat > 1:111600‑M2/61‑140 (MQ=255) aacgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGaataaaata > 1:500960‑M2/60‑140 (MQ=255) acgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGaataaaataa > 2:20965‑M2/59‑140 (MQ=255) cgaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAat‑aaataaaa < 1:986456‑M2/83‑1 (MQ=255) gaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAAtaaaataaaa < 1:126808‑M2/84‑1 (MQ=255) gaaaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAAtaaaataaaa < 1:150910‑M2/84‑1 (MQ=255) aaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGaataa > 2:465057‑M2/55‑131 (MQ=255) aaataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGaataa < 1:465057‑M2/77‑1 (MQ=255) aataaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAaca < 2:578132‑M2/87‑1 (MQ=255) taaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACAcc < 2:1014236‑M2/89‑1 (MQ=255) taaaaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACAcc < 1:175682‑M2/89‑1 (MQ=255) aaaccatcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTg < 2:235807‑M2/92‑1 (MQ=255) tcacaccccatttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTataat > 1:252902‑M2/43‑140 (MQ=255) ttaatatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTa < 2:940839‑M2/109‑1 (MQ=255) atatcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTAttt > 1:37104‑M2/29‑140 (MQ=255) atcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTa > 2:257832‑M2/27‑140 (MQ=255) atcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCGGGGGGGGGTTTTTTTTACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTa < 1:896447‑M2/114‑1 (MQ=255) tcagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTAc < 2:797390‑M2/115‑1 (MQ=255) cagggaaccggacataaccccgtgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACa > 2:740515‑M2/25‑140 (MQ=255) cagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGaaa < 1:525224‑M2/104‑1 (MQ=255) cagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGaaa > 2:525224‑M2/25‑128 (MQ=255) cagggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACa > 1:375442‑M2/25‑140 (MQ=255) gggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTa < 1:245627‑M2/114‑1 (MQ=255) gggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTa > 2:245627‑M2/23‑136 (MQ=255) gggaaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAgg > 1:499761‑M2/23‑140 (MQ=255) aaccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTa < 1:618997‑M2/121‑1 (MQ=255) ccggacataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTaaa > 1:350069‑M2/18‑140 (MQ=255) cataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCAt < 1:683474‑M2/128‑1 (MQ=255) cataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCAt < 2:350069‑M2/128‑1 (MQ=255) ataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTa > 2:343325‑M2/12‑125 (MQ=255) ataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTa < 1:343325‑M2/114‑1 (MQ=255) ataaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATg < 1:556000‑M2/129‑1 (MQ=255) aaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAAcc > 1:237758‑M2/10‑135 (MQ=255) aaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAAcc < 2:237758‑M2/126‑1 (MQ=255) aaccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGcc < 1:578162‑M2/131‑1 (MQ=255) ccccatgCGCTTTAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCAt > 1:743589‑M2/8‑140 (MQ=255) ccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAAcc < 1:975473‑M2/126‑1 (MQ=255) ccccatgCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAAcc > 2:975473‑M2/8‑133 (MQ=255) gCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTacac > 1:913389‑M2/2‑140 (MQ=255) cGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACg < 2:111600/140‑1 (MQ=255) cGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACg < 2:1003607/140‑1 (MQ=255) cGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACg < 2:913389/140‑1 (MQ=255) | GCCGCTACGCAAGTGGATGGTACGCAAATGTCTTTGCTGTCAGTACCAGAAGAAACTTCGCCTGCGGTCGAAGCTCTGGAAAATCTTGATCCGGATTCACTCACCCCGCGTCAGGCGCTGGAGTGGATTTATCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACG > NC_000913/2859502‑2859773 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |