| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 560,056 | C→T | P120P (CCC→CCT) | sfmD → | putative fimbrial usher protein SfmD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 560,056 | 0 | C | T | 98.7% | 276.0 / ‑4.4 | 78 | P120P (CCC→CCT) | sfmD | putative fimbrial usher protein SfmD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (41/36); total (42/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.10e-01 | |||||||||||
ATGATGAGTTCATTGGTTCGCAGGATATCGTATTTGAATCGACAACAGAAAATACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCCGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCT > NC_000913/559920‑560188 | atgatgAGTTCATTGGTTCGCAGGATATCGTATTTGAATCGACAACAGAAAATACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAg > 2:702691/1‑140 (MQ=255)atgatgAGTTCATTGGTTCGCAGGATATCGTATTTGAATCGACAACAGAAAATACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAACAGTGCATTTCCTGAg > 2:156882/1‑140 (MQ=255) tgatgaGTTCATTGGTTCGCAGGATATCGTATTTGAATCGACAACAGAAAATACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGt > 1:27422/1‑140 (MQ=255) tGGTTCGCAGGATATCGTATTTGAATCGACAACAGAAAATACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCagcagc > 2:406575/1‑140 (MQ=255) tGGTTCGCAGGATATCGTATTTGAATCGACAACAGAAAATACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCagcagc < 2:414885/140‑1 (MQ=255) tGGTTCGCAGGATATCGTATTTGAATCGACAACAGAAAATACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCagcagc > 2:142195/1‑140 (MQ=255) ggTTCGCAGGATATCGTATTTGAATCGACAACAGAAAATACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAgcagca < 2:560735/140‑1 (MQ=255) gTTCGCAGGATATCGTATTTGAATCGACAACAGAAAATACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCaa > 1:18583/1‑140 (MQ=255) cGCATGATATCGTATTTGAATCGACAACAGAAAATACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAAc > 2:496275/1‑140 (MQ=255) atatCGTATTTGAATCGACAACAGAAAATACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAACAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATaaa < 1:156882/140‑1 (MQ=255) cGTATTTGAATCGACAACAGAAAATACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCa < 1:664586/140‑1 (MQ=255) aTTTGAATTGACAACAGAAAATACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCa > 2:520338/1‑140 (MQ=255) ttGAATCGACAACAGAAAATACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAAt < 1:203486/140‑1 (MQ=255) aTCGACAACAGAAAATACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTAc > 2:553667/1‑140 (MQ=255) tCGACAACAGAAAATACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACt < 1:702691/140‑1 (MQ=255) cGACAACAGAAAATACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTg < 1:945464/140‑1 (MQ=255) cGACAACAGAAAATACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTg < 2:27422/140‑1 (MQ=255) gACAACAGAAAATACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGa < 2:501892/140‑1 (MQ=255) aacaGAAAATACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAg < 1:142195/140‑1 (MQ=255) caGAAAATACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCt > 1:307029/1‑140 (MQ=255) aGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGTATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTg > 2:124430/1‑124 (MQ=255) aGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGTATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTg < 1:124430/124‑1 (MQ=255) ggTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGc < 2:220792/140‑1 (MQ=255) ggTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGc > 1:506024/1‑140 (MQ=255) ggTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGc > 2:334138/1‑140 (MQ=255) ggTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGc > 2:5788/1‑140 (MQ=255) tGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGa > 1:699421/1‑135 (MQ=255) tGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGa < 2:699421/135‑1 (MQ=255) tGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCca > 2:954980/1‑140 (MQ=255) aTAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCcaca > 2:509795/1‑140 (MQ=255) aGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACt > 1:998415/1‑140 (MQ=255) gTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACttt > 1:637925/1‑140 (MQ=255) gggTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGa < 1:954980/140‑1 (MQ=255) gTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGAtt < 2:998415/140‑1 (MQ=255) gTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGAtt > 2:155760/1‑140 (MQ=255) gCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGGAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAg > 2:615843/1‑140 (MQ=255) cTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGa < 1:553667/140‑1 (MQ=255) cTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGa < 1:155760/140‑1 (MQ=255) tGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGAt > 2:293206/1‑140 (MQ=255) tGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGAt > 1:249124/1‑140 (MQ=255) gTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATg < 2:249124/140‑1 (MQ=255) cAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGaa < 2:637925/140‑1 (MQ=255) gTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACAt > 2:992129/1‑140 (MQ=255) gTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACAt < 2:18583/140‑1 (MQ=255) gTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACAt > 2:188356/1‑140 (MQ=255) gTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACAt > 1:740412/1‑140 (MQ=255) ttcttGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGGAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACt < 1:615843/140‑1 (MQ=255) ttcttGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACt < 2:586194/140‑1 (MQ=255) ttcttGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACt < 1:704286/140‑1 (MQ=255) ttcttGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACt < 1:188356/140‑1 (MQ=255) ttcttGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACt < 1:334138/140‑1 (MQ=255) ttcttGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACt < 2:506024/140‑1 (MQ=255) ttcttGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACt < 2:740412/140‑1 (MQ=255) ttcttGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACAACACt < 1:619607/140‑1 (MQ=255) gAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACt > 2:84536/1‑135 (MQ=255) gAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACt < 1:84536/135‑1 (MQ=255) aaCGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCt > 2:761061/1‑140 (MQ=255) gAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAg > 1:770117/1‑140 (MQ=255) aaTTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGa < 2:307029/140‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGa > 1:310133/1‑140 (MQ=255) aaTTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGa < 2:559187/140‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGa > 2:210837/1‑140 (MQ=255) aTTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGAt > 1:130253/1‑140 (MQ=255) gCCTTAATAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCg < 1:293206/140‑1 (MQ=255) aaTAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCgttgtt > 2:400882/1‑140 (MQ=255) aaTAGCAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCgttgtt < 1:761061/140‑1 (MQ=255) cAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTa > 2:689342/1‑140 (MQ=255) cAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTa < 2:287283/140‑1 (MQ=255) cAGTGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTa > 1:684870/1‑140 (MQ=255) tGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAg < 2:28009/125‑1 (MQ=255) tGCATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAg > 1:28009/1‑125 (MQ=255) cATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATa < 2:959111/122‑1 (MQ=255) cATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATa > 1:959111/1‑122 (MQ=255) cATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCt > 2:135875/1‑140 (MQ=255) cATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCt > 2:761304/1‑140 (MQ=255) cATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCt > 1:457197/1‑140 (MQ=255) cATTTCCTGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCt > 2:156439/1‑140 (MQ=255) cATTTCCCGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCt > 1:1015174/1‑140 (MQ=255) | ATGATGAGTTCATTGGTTCGCAGGATATCGTATTTGAATCGACAACAGAAAATACAGGTGATAAATCAGGTGGGTTAATGCCCTGTTTTAACCAGGTACTTCTTGAACGAATTGGCCTTAATAGCAGTGCATTTCCCGAGTTAGCCCAGCAGCAAAACAATAAATGCATCAATTTACTGAAAGCTGTACCTGATGCCACAATTAACTTTGATTTTGCAGCGATGCGCCTGAACATCACTATTCCTCAGATAGCGTTGTTGAGTAGCGCT > NC_000913/559920‑560188 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |