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gCATTATCGCC‑GC‑GGG‑TAAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGa > 1:234250/1‑125 (MQ=255) aTCGCC‑GC‑GGG‑TAAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCta < 2:1031162/140‑1 (MQ=255) tCGCC‑GC‑GGG‑TAAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCtat > 1:845310/1‑140 (MQ=255) cc‑gc‑GGG‑TAAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCtattat < 1:901598/140‑1 (MQ=255) c‑gc‑gGG‑TAAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAg > 1:41863/1‑125 (MQ=255) c‑gc‑gGG‑TAAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAg < 2:41863/125‑1 (MQ=255) c‑gc‑gGG‑TAAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTattatt > 2:20085/1‑140 (MQ=255) gc‑gGG‑TAAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCt < 1:502591/126‑1 (MQ=255) gc‑gGG‑TAAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCt > 2:502591/1‑126 (MQ=255) c‑gGG‑TAAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCt > 1:503957/1‑125 (MQ=255) c‑gGG‑TAAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCt < 2:503957/125‑1 (MQ=255) c‑gGG‑TAAAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGc > 2:719742/1‑140 (MQ=255) | ATTCAGACAAAAAGTACATTTTGAGGATGGTTATGGAACTGTATCTGGATACTTCAGACGTTGTTGCGGTGAAGGCGCTGTCACGTATTTTTCCGCTGGCGGGTGTGACCACTAACCCAAGCATTATCGCC‑GC‑GGG‑T‑AAAAAACCGCTGGATGTTGTGCTTCCGCAACTTCATGAAG‑CGATGGGCGGTCAGGGGCGTCTGTTTGCCCAGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGC > NC_000913/863610‑863880 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |