| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,111,747 | 0 | G | T | 27.5% | 134.3 / 22.8 | 51 | N156K (AAC→AAA) | yiiQ | DUF1454 domain‑containing protein YiiQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/1); new base T (0/14); total (36/15) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.16e-11 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CTTTTTGTCATTTATTCAAACCTTC‑AAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTT‑T‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGATG > NC_000913/4111608‑4111885 | ctttTTGTCATTTATTCAAACCTTC‑AAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTT‑T‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACgtttg > 1:1043886/1‑140 (MQ=255) ttGTCATTTATTCAAACCTTC‑AAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTT‑T‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGtttt > 1:1318058/1‑140 (MQ=255) ttGTCATTTATTCAAACCTTC‑AAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTT‑T‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGtttt > 1:733365/1‑140 (MQ=255) ttGTCATTTATTCAAACCTTC‑AAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTT‑T‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGtttt > 1:276161/1‑140 (MQ=255) ttGTCATTTATTCAAACCTTC‑AAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTT‑T‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGtttt > 1:225366/1‑140 (MQ=255) ttGTCATTTATTCAAACCTTC‑AAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTT‑T‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGtttt > 1:1078559/1‑140 (MQ=255) tttATTCAAACCTTC‑AAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTT‑T‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCccg > 1:818516/1‑140 (MQ=255) tttATTCAAACCTTC‑AAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTT‑T‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCccg > 1:107947/1‑140 (MQ=255) ttATTC‑AACCTTCAAAGCGATTCAGATAGCCCCAGCTAAATCGGTTCAACGGCGAAGCCCCCCCCTTTT‑T‑CCCTTTTGTCCGCAAAAACAAAACGCAGTCCCCCTTCTGTCTCGGTGTAAT‑ACTTTTTTTTTTcccccgc < 2:1318058/140‑4 (MQ=255) aTTCAAACCTTC‑AAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTT‑T‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCccgccg > 1:1023000/1‑140 (MQ=255) ttaaacccTTC‑AAGCGATTCAGATAGCCCCAGTTTAATCGGTTCAACAGCG‑AGGGCCGCCCCTTTGT‑GGCGGTTGTCCGCAACAACATATCGCATTCCCCCTTTTGTCTGGGTGAAATAAGTTTTTTTTTTCCCCGCCGt < 2:1178983/134‑1 (MQ=255) aCCTTC‑AAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTT‑T‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTtagta > 2:1240686/1‑140 (MQ=255) aCCTTC‑AAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTT‑T‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTtagta > 1:712206/1‑140 (MQ=255) aCCTTC‑AAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTT‑T‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTtagta > 1:539807/1‑140 (MQ=255) tC‑AAGCGATTCAGATACCGCCATTTAAATCGTTAAAAAAGAGAAGGTCCCCCCTTTT‑C‑CGCGGTTTCCCGCAAAAACATACCGCTGTCCCCCTTCTGTCTCGGTTTAATACCTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGa < 2:1023000/140‑1 (MQ=255) c‑AAGCAATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTT‑T‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGAc > 1:278641/1‑140 (MQ=255) aaGCTATTAAAATAGCCCCAGTTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGCCACCCCTTTT‑C‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTCCCCCTTCTGTCTGGGTGTAATAACTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACt < 2:1078559/140‑1 (MQ=255) ttCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTT‑T‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGtt > 1:397232/1‑140 (MQ=255) atggccccAGTTTAATCGTTTCAACAGCGAAGGTCACCCCTTTT‑T‑CGCCGTTGCCCGCGAAAAAATACCGCAGTCCCCCTTCTGTCTGGGTGTAATATCGTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTc < 2:833036/134‑1 (MQ=255) ggccccAGCTTAATCGTTCAAACAGC‑AAGGGCCCCCCCTTT‑TCCGCCTTTGCCCGCAAAAAAAAAACGCGGTGCCCCTTTTGTCTGGGTGTAATACTTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTg < 2:539807/136‑1 (MQ=255) gcgcCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTT‑T‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTgg > 1:203007/1‑140 (MQ=255) cgcCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTT‑T‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGc > 1:1195263/1‑140 (MQ=255) gcCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTT‑T‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCt > 1:833036/1‑140 (MQ=255) cAGCTTAATCGGTCAAACAGCGAAGGCCACCCCCTTT‑T‑CGCCGTTGCCCGCAAAAACAAAACGCAGTCCCCCTTCGGCCTCGTTGTAATACTTTTTGTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCttt < 2:712206/140‑1 (MQ=255) gCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTT‑T‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCTCCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCTCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTtgt > 1:457654/1‑140 (MQ=255) gCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTT‑T‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCTCCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTtgt > 2:695654/1‑140 (MQ=255) cTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTT‑T‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTtgtg > 2:984070/1‑140 (MQ=255) tCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTT‑T‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCAt > 1:337354/1‑140 (MQ=255) aCAGCGAAGGCCACCCCTTTT‑C‑CGCCGTTGCCCGCGAAAACATAACGCAGTCCCCCTTCTGTCTCGGTTAAATATCTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTaa < 2:818516/140‑1 (MQ=255) cAGCGAAGGTCAGCCCCTTT‑T‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAAt > 1:1313639/1‑140 (MQ=255) cGAAGGTCAGCCCCTTT‑T‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATggg > 1:394963/1‑140 (MQ=255) agggTCACCCCTTTT‑C‑CGCCGTTGCCCGCGACAACATAACGCGGTGCCCTTTCTTTCTGGGTGTAATATTTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGt < 2:1195263/138‑1 (MQ=255) aaGGTCCCCCCTTTT‑C‑CCCCGTTGCCCGCAACAACAAACCGCAGTCCCCTTTCTGTCTGGGTGAAATAATTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGt < 2:337354/140‑1 (MQ=255) aaGGTCAGCCCCTTT‑T‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGt > 1:416252/1‑140 (MQ=255) aaGGTCAGCCCCTTT‑T‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGt > 1:438467/1‑140 (MQ=255) aaGGTCAGCCCCTTT‑T‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGt > 1:1060725/1‑140 (MQ=255) aaGGTCACCCCTTTT‑T‑CCCCGTTGCCCGAGAAAACATAACGCAGTGCCCCTTCTCTCTGGGTGTAATAGCGTTTTTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGt < 2:713460/140‑1 (MQ=255) aaGGCCACCCCTTTT‑C‑CGCCGTTGCCCGCAAAAACATAACGCGGTCCCCCTTCTGTCTGGGTTAAATACTTTTTTTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGt < 2:438467/140‑1 (MQ=255) aaggcccccccTTT‑TCCCCCTTTGCCCGCAAAAACATACCGCAGTCCCCTTTCTGTCTCGGTTTAAAAACTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGt < 2:394963/133‑1 (MQ=255) tCACCCCTTTT‑C‑CGCCGTCGCCCCCCACAACATACCGCGGTGCCCCTTGTGCCCCGGTGTAATACCGTTTGTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAgt < 2:1304941/140‑1 (MQ=255) tt‑t‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATc > 1:1186244/1‑140 (MQ=255) tt‑t‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATc > 1:24946/1‑140 (MQ=255) tttccccGCAAAAACATACCGCAGTGCCCCTTCTGTCTGGGTGTAATAATTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTg < 2:1043928/135‑1 (MQ=255) ttGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGc > 2:1263057/1‑140 (MQ=255) cccGCAACAACATACCGCAGTGCCCCTTCTGTCTGGGTGTAATAACTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCAt < 2:396119/139‑1 (MQ=255) ccGCCAAAACATAACGCGGTGCACCTTCTGTCTGGGTGAAATAATTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATg < 2:278641/140‑1 (MQ=255) gCAGTCCCCCTTCTGTCTGGGTATAATACTTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAgctttc < 2:1043886/140‑1 (MQ=255) tGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAgctttcgctt > 1:78584/1‑140 (MQ=255) cTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTcgcg > 2:1006640/1‑140 (MQ=255) gTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCttt > 2:479632/1‑140 (MQ=255) gTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCttt > 2:785421/1‑140 (MQ=255) ggTGTAATACCTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGct < 1:1150510/140‑1 (MQ=255) ggTGTAATAACTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGct < 2:1337266/140‑1 (MQ=255) ggTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGct > 2:29482/1‑140 (MQ=255) gtgaAATAACTTTTTTTTTCCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGctc < 2:107947/140‑1 (MQ=255) tgtAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGctct > 1:1299549/1‑140 (MQ=255) tgtAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGctct > 1:482922/1‑140 (MQ=255) ataaCGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGcc > 1:809925/1‑140 (MQ=255) cGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTg > 2:815421/1‑140 (MQ=255) tttgtttTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGa > 1:478669/1‑140 (MQ=255) tttgtttTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGa > 2:668022/1‑140 (MQ=255) tttgtttTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGa > 1:1354575/1‑140 (MQ=255) tttgtttTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGa > 2:1322199/1‑140 (MQ=255) tgtttTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGATg > 1:1113698/1‑140 (MQ=255) | CTTTTTGTCATTTATTCAAACCTTC‑AAGCGATTCAGATAGCGCCAGCTTAATCGGTTCAACAGCGAAGGTCAGCCCCTTT‑T‑CGCCGTTGTCCGCGACAACATAACGCAGTGCACCTTCTGTCTCGGTGTAATAACGTTTGTTTTTCCCCGCCGTTAGTAGCGACTGCAGTTTTTTCTGGCTTTGTGTTTTGGTCATTAATGGGGTGAGTGTGCGGATCACCGCTGCCATGTATTCCTGAGCTTTCGCTTTCGCGGCTTTTTGCTCTGGCCCCTGGATG > NC_000913/4111608‑4111885 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |