| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,255,616 | A→G | V284A (GTC→GCC) | plsB ← | glycerol‑3‑phosphate 1‑O‑acyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,255,616 | 0 | A | G | 98.9% | 321.2 / ‑4.8 | 88 | V284A (GTC→GCC) | plsB | glycerol‑3‑phosphate 1‑O‑acyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (49/38); total (50/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 | |||||||||||
ATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATG > NC_000913/4255481‑4255746 | atatGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGtt < 1:1114730/140‑1 (MQ=255)atatGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGtt > 2:1268037/1‑140 (MQ=255) tatGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTg < 2:582090/140‑1 (MQ=255) gcggcgGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATg < 2:560061/140‑1 (MQ=255) cggcggCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGc > 2:1103239/1‑140 (MQ=255) gcggcACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGccc > 2:684613/1‑140 (MQ=255) gCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGt < 1:69817/140‑1 (MQ=255) ccccTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTc < 2:827192/140‑1 (MQ=255) ccccTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTc > 1:418933/1‑140 (MQ=255) cTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGt < 2:1204344/140‑1 (MQ=255) tGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGt > 1:148960/1‑130 (MQ=255) tGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGt < 2:148960/130‑1 (MQ=255) tGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGtt > 2:882338/1‑140 (MQ=255) tACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTa < 2:847203/125‑1 (MQ=255) tACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTa > 1:847203/1‑125 (MQ=255) tACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGt > 2:671657/1‑140 (MQ=255) tACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGt > 1:737779/1‑140 (MQ=255) aGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGaa > 1:1105708/1‑140 (MQ=255) aGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGaa < 2:239417/140‑1 (MQ=255) aGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGaa < 2:1185754/140‑1 (MQ=255) aCGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGcc < 1:882338/140‑1 (MQ=255) cGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGccc > 1:665396/1‑140 (MQ=255) gTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATATGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCa > 2:196219/1‑140 (MQ=255) aaGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGa > 2:1237861/1‑140 (MQ=255) aaGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGa > 1:509219/1‑140 (MQ=255) agcagcAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACg < 1:1268037/140‑1 (MQ=255) gcagcaGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACgg < 1:1237861/140‑1 (MQ=255) cagcagGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGgt < 1:1167450/140‑1 (MQ=255) agcagGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGgtc < 2:737779/140‑1 (MQ=255) cagGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGgtcag > 2:338396/1‑140 (MQ=255) cagGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGgtcag > 2:746134/1‑140 (MQ=255) cagGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGgtcag > 1:722318/1‑140 (MQ=255) cagGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGgtcag > 1:890750/1‑140 (MQ=255) gTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGc > 1:945069/1‑140 (MQ=255) aTGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGaaa > 2:1060009/1‑139 (MQ=255) tgtgACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAatc > 2:84485/1‑140 (MQ=255) tgtgACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAatc > 1:452895/1‑140 (MQ=255) gtgACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAatca > 1:1066240/1‑140 (MQ=255) tgACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAatcat > 2:267489/1‑140 (MQ=255) aCTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCAtct < 1:483270/140‑1 (MQ=255) tGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGtcagtcag < 1:778213/127‑1 (MQ=255) tGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGtcagtcag > 2:778213/1‑127 (MQ=255) tGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCg > 1:392566/1‑140 (MQ=255) tGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCg > 1:306157/1‑140 (MQ=255) acaTATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTcgc < 2:509219/140‑1 (MQ=255) acaTATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTcgc < 1:1103239/140‑1 (MQ=255) tataCCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTcgccgc > 2:310327/1‑140 (MQ=255) taCCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCaa < 1:84485/140‑1 (MQ=255) taCCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCaa < 2:306157/140‑1 (MQ=255) taCCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCaa < 1:306187/140‑1 (MQ=255) taCCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCaa < 1:338396/140‑1 (MQ=255) taCCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCaa < 1:479745/140‑1 (MQ=255) cAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAAtt < 2:692141/129‑1 (MQ=255) cAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAAtt > 1:692141/1‑129 (MQ=255) cAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCa > 1:437667/1‑136 (MQ=255) cAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCa < 2:437667/136‑1 (MQ=255) aGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAAtctc > 2:3770/1‑140 (MQ=255) aGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAAtctc > 2:663009/1‑140 (MQ=255) aGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAAtctc < 2:1105708/140‑1 (MQ=255) cTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGGGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCtt > 2:742416/1‑140 (MQ=255) tCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTcgccg > 2:786514/1‑130 (MQ=255) tCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTcgccg < 1:786514/130‑1 (MQ=255) tCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCaa < 1:760740/133‑1 (MQ=255) tCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCaa > 2:760740/1‑133 (MQ=255) tCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTc > 1:634250/1‑140 (MQ=255) tCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTc > 2:470676/1‑140 (MQ=255) tCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTc > 1:270905/1‑140 (MQ=255) tCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTc > 2:659084/1‑140 (MQ=255) tCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGGGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTc > 2:1418478/1‑140 (MQ=255) 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gAACGCGCTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCtgctgc > 1:579205/1‑140 (MQ=255) cTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCttttt < 2:392566/140‑1 (MQ=255) cTCAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCttttt > 1:197746/1‑140 (MQ=255) cAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCa < 2:722318/140‑1 (MQ=255) cAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCa < 2:634250/140‑1 (MQ=255) cAGCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCa < 2:1066240/140‑1 (MQ=255) gCGTTATGGGCGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATg < 1:663009/140‑1 (MQ=255) | ATATGCGGCGGCACCAGCCCCTGGTGATACAGCACGTAAGAAAGCAGCAGGTAGTCCATGTGACTGCGGTGGCAAGGCACATATACCAGCTCATGACCGTCGTGGGCCAGCTGGCGAACGCGCTCAGCGTTATGGACGTTGATGCCCTGGTAAAGTCGGTTCCAGGTGAAGCCCAGAATACGGTCAGTCAGGCGAATCATCTCGTAAGAGAAATTCGCCGCAATCTCTTCCATCAGTGCAATCGCGTTCTGCTGCGCTTTTTCATG > NC_000913/4255481‑4255746 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |