| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,401,544 | T→C | S597G (AGC→GGC) | csrD ← | regulator of CsrB and CsrC decay |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,401,544 | 0 | T | C | 98.7% | 286.0 / ‑4.4 | 78 | S597G (AGC→GGC) | csrD | regulator of CsrB and CsrC decay |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (40/37); total (41/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.53e-01 | |||||||||||
TGAATATTTTTTCACGTTAGTATCAAGTGGCTGTGAGGACGCGAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTGGTAC > NC_000913/3401410‑3401672 | tgAATATTTTTTCACGTTAGTATCAAGTGGCTGTGAGGACGCGAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTcc > 1:1045879/1‑140 (MQ=255)tgAATATTTTTTCACGTTAGTATCAAGTGGCTGTGAGGACGCGAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTcc > 2:29764/1‑140 (MQ=255) tttttttCACGTTAGTATCAAGTGGCTGTGAGGACGCAAAAAAACCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAg < 2:414705/139‑1 (MQ=255) atTTTTTCACGTTAGTATCAAGTGGCTGTGAGGACGCGAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAg < 2:140353/140‑1 (MQ=255) cACGTTAGTATCAAGTGGCTGTGAGGACGCGAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACTGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCtt > 2:504130/1‑140 (MQ=255) tAGTATCAAGTGGCTGTGAGGACGCGAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTccacc > 2:313512/1‑140 (MQ=255) aTCAAGGGGCTGTGAGGACGCAAAAAACCCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGc < 2:665025/140‑1 (MQ=255) aGTGGCTGTGAGGACGCGAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTg > 2:874125/1‑140 (MQ=255) tGGCTGTGAGGACGCGAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGaa > 2:422969/1‑140 (MQ=255) gCTGTGAGGACGCGAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAAcc > 2:548233/1‑140 (MQ=255) gCTGTGAGGACGCGAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAAcc > 2:1124581/1‑140 (MQ=255) gCTGTGAGGACGCGAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAAcc > 1:362713/1‑140 (MQ=255) gCTGTGAGGACGCGAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAAcc > 2:848663/1‑140 (MQ=255) cTGTGAGGACGCGAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACca < 1:848663/140‑1 (MQ=255) cTGTGAGGACGCGAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACca < 1:92349/140‑1 (MQ=255) cTGTGAGGACGCGAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACca > 2:1023442/1‑140 (MQ=255) cTGTGAGGACGCGAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACca > 2:92349/1‑140 (MQ=255) gtgAGGACGCGAAAAAACCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACcagc < 1:451876/140‑1 (MQ=255) tgAGGACGCGAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACcagca > 2:63559/1‑140 (MQ=255) gAGGACGCGAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACcagcag < 1:331963/140‑1 (MQ=255) gAGGACGCGAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACcagcag < 1:579599/140‑1 (MQ=255) gcgAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGtt > 2:728039/1‑140 (MQ=255) acccccTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTc < 1:589054/138‑1 (MQ=255) gCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCa < 1:313512/140‑1 (MQ=255) cccGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCaa < 1:1023442/140‑1 (MQ=255) cGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATg > 2:968529/1‑140 (MQ=255) aaCACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGa < 1:23329/140‑1 (MQ=255) acacTGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGAc < 1:504130/140‑1 (MQ=255) acacCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGAc < 2:1045879/140‑1 (MQ=255) acacCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGAc < 1:728039/140‑1 (MQ=255) acCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCa < 1:29764/140‑1 (MQ=255) cgcgCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGc > 1:584855/1‑140 (MQ=255) gcgcTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGcc > 2:195263/1‑140 (MQ=255) gcgcTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGcc > 2:976624/1‑140 (MQ=255) gcgcTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGcc > 1:415069/1‑140 (MQ=255) gcgcTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGcc > 1:140052/1‑140 (MQ=255) gcgcTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGcc > 2:844347/1‑140 (MQ=255) gcgcTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGcc > 1:593501/1‑140 (MQ=255) gcgcTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGcc > 2:663280/1‑140 (MQ=255) cgcTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCGCGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGccc > 2:570031/1‑140 (MQ=255) cgcTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGAc < 2:253285/134‑1 (MQ=255) cgcTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGAc > 1:253285/1‑134 (MQ=255) cgcTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGccc > 2:942363/1‑140 (MQ=255) cgcTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGccc > 2:233510/1‑140 (MQ=255) cTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCg > 1:523923/1‑140 (MQ=255) gAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGa < 1:968529/140‑1 (MQ=255) gAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGa < 1:388059/140‑1 (MQ=255) aaTCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGAt < 2:584855/140‑1 (MQ=255) aaTCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGAt > 2:664886/1‑140 (MQ=255) aaTCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGAt < 1:233510/140‑1 (MQ=255) aaTCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGAt < 1:742936/140‑1 (MQ=255) aaTCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGAt < 2:140052/140‑1 (MQ=255) aaTCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGAt > 1:586599/1‑140 (MQ=255) tCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTg > 2:766655/1‑140 (MQ=255) tCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTg < 1:706346/140‑1 (MQ=255) tGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAg > 1:720824/1‑140 (MQ=255) tGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAg > 2:219754/1‑140 (MQ=255) tGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAg > 1:878703/1‑140 (MQ=255) tGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAg > 2:138804/1‑140 (MQ=255) tGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAg > 2:617925/1‑140 (MQ=255) gCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGt < 1:548233/140‑1 (MQ=255) gCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGt < 2:880370/140‑1 (MQ=255) ccACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTa > 2:751958/1‑140 (MQ=255) cGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCa < 1:950346/140‑1 (MQ=255) ttCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACa > 2:564340/1‑140 (MQ=255) cgcgAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACAtt > 2:1111486/1‑140 (MQ=255) cgAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTaa < 2:362713/140‑1 (MQ=255) ccGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGAt < 1:766655/140‑1 (MQ=255) ccGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGAt < 2:1146944/140‑1 (MQ=255) ccGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGAt < 1:564340/140‑1 (MQ=255) ccGGTGGCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGAt < 1:422969/140‑1 (MQ=255) ggCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAAc < 1:942363/140‑1 (MQ=255) ggCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAAc < 1:219754/140‑1 (MQ=255) ggCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAAc < 1:138804/140‑1 (MQ=255) gCGTAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACt < 1:1124581/140‑1 (MQ=255) tAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGAt < 1:243800/131‑1 (MQ=255) tAAACCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGAt > 2:243800/1‑131 (MQ=255) aaCCTGGGTGCCGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTGGTAc > 2:474449/1‑140 (MQ=255) | TGAATATTTTTTCACGTTAGTATCAAGTGGCTGTGAGGACGCGAAAAAATCCCCTTGCCCGCCTGTAACACCGCGCTGAATCAGGGTCTGCCACTCGCTTCGCGAACGCACGCCGGTGGCGTAAACCTGGGTGCTGGTCCCGGAGCAGGCTTCCACCAGGCTTTGAACCAGCAGCTGGTTCTCCGTTCGCTTCTCAATGTTTCTGACCAGCCCCGGATGGAGCTTGAGTAACTCAACATTAAGTTCTTTGATCCAACTGGTAC > NC_000913/3401410‑3401672 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |