Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,594,568 | A→G | V52A (GTA→GCA) | lgoT ← | galactonate:H(+) symporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,594,568 | 0 | A | G | 100.0% | 57.1 / NA | 17 | V52A (GTA→GCA) | lgoT | galactonate:H(+) symporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (5/12); total (5/12) |
AGTTGCGCAATCCCGTAAGCGAGTGAAAACACGGAGAGCAAAGCGCCGATTTCGGTGGCACTTAATCCCAATTCTTCACGAATCGTTAAATTTGCTACCGACAGCGAACTGCGGTCGAGATAATTGATTACCGCCGC‑AAAAAATAATAACAACATGGCGGTGGTTTGAATGCGTTTAATTCGGGTACTGCGTTGAACTAATCCATCTGGTGGCACGGGAATATCTGCCGACGAAGATGGAGTAAATGAAGAACGCGGATCGATG > NC_000913/4594439‑4594702 | aGTTGCGCAATCCCGTAAGCGAGTGAAAACACGGAGAGCAAAGCGCCGATTTCGGTGGCACTTAATCCCAATTCTTCACGAATCGTTAAATTTGCTACCGACAGCGAACTGCGGTCGAGATAATTGATTGccgccg < 2:65756/136‑1 (MQ=255) aGTTGCGCAATCCCGTAAGCGAGTGAAAACACGGAGAGCAAAGCGCCGATTTCGGTGGCACTTAATCCCAATTCTTCACGAATCGTTAAATTTGCTACCGACAGCGAACTGCGGTCGAGATAATTGATTGccgccg > 1:65756/1‑136 (MQ=255) gTAAGCGAGTGAAAACACGGAGAGCAAAGCGCCGATTTCGGTGGCACTTAATCCCAATTCTTTACGAATCGTTAAATTTGCTACCGACAGCGAACTGCGGTCGAGATAATTGATTGCCGCCGC‑AAAAAATAATAacaaca < 1:260448/140‑1 (MQ=255) gTAAGCGAGTGAAAACACGGAGAGCAAAGCGCCGATTTCGGTGGCACTTAATCCCAATTCTTCACGAATCGTTAAATTTGCTACCGACAGCGAACTGCGGTCGAGATAATTGATTGCCGCCGC‑AAAAAATAATAacaaca < 1:181161/140‑1 (MQ=255) aaGCGAGTGAAAACACGGAGAGCAAAGCGCCGATTTCGGTGGCACTTAATCCCAATTCTTCACGAATCGTTAAATTTGCTACCGACAGCGAACTGCGGTCGAGATAATTGATTGCCGCCGC‑AAAAAATAATAACAACATg > 1:210022/1‑140 (MQ=255) gAGTGAAAACACGGAGAGCAAAGCGCCGATTTCGGTGGCACTTAATCCCAATTCTTCACGAATCGTTAAATTTGCTACCGACAGCGAACTGCGGTCGAGATAATTGATTGCCGCCGC‑AAAAAATAATAACAACATGGCgg < 2:264225/140‑1 (MQ=255) aGTGAAAACACGGAGAGCAAAGCGCCGATTTCGGTGGCACTTAATCCCAATTCTTCACGAATCGTTAAATTTGCTACCGACAGCGAACTGCGGTCGAGATAATTGATTGCCGCCGC‑AAAAAATAATAACAACATGGCggt > 1:104106/1‑140 (MQ=255) agagCAAAGCGCCGATTTCGGTGGCACTTAATCCCAATTCTTCACGAATCGTTAAATTTGCTACCGACAGCGAACTGCGGTCGAGATAATTGATTGCCGCCGC‑AAAAAATAATAACAACATGGCGGTGGTTTGAATGCGt < 2:210022/140‑1 (MQ=255) agCAAAGCGCCGATTTCGGTGGCACTTAATCCCAATTCTTCACGAATCGTTAAATTTGCTACCGACAGCGAACTGCGGTCGAGATAATTGATTGCCGCCGC‑AAAAAATAATAACAACATGGCGGTGGTTTGAATGCGttt < 2:104106/140‑1 (MQ=255) aaaGCGCCGATTTCGGTGGCACTTAATCCCAATTCTTCACGAATCGTTAAATTTGCTACCGACAGCGAACTGCGGTCGAGATAATTGATTGCCGCCGC‑AAAAAATAATAACAACATGGCGGTGGTTTGAATGCGTTTAAt < 2:74951/140‑1 (MQ=255) aTTTCGGTGGCACTTAATCCCAATTCTTCACGAATCGTTAAATTTGCTACCGACAGCGAACTGCGGTCGAGATAATTGATTGCCGCCGC‑AAAAAATAATAACAACATGGCGGTGGTTTGAATGCGTTTAATTCGGGTACt > 1:266948/1‑140 (MQ=255) ggCACTTAATCCCAATTCTTCACGAATCGTTAAATTTGCTACCGACAGCGAACTGCGGTCGAGATAATTGATTGCCGCCGCAAAAAAATAATAACAACATGGCGGTGGTTTGAATGCGTTTAATTCGGGTACTGCGTTGa < 2:330245/140‑1 (MQ=255) ttcttcACGAATCGTTAAATTTGCTACCGACAGCGAACTGCGGTCGAGATAATTGATTGCCGCCGC‑AAAAAATAATAACAACATGGCGGTGGTTTGAATGCGTTTAATTCGGGTACTGCGTTGAACTAATCCATCtggtg > 2:346871/1‑140 (MQ=255) ttcACGAATCGTTAAATTTGCTACCGACAGCGAACTGCGGTCGAGATAATTGATTGCCGCCGC‑AAAAAATAATAACAACATGGCGGTGGTTTGAATGCGTTTAATTCGGGTACTGCGTTGAACTAATCCATCTGGTGGCa < 1:346871/140‑1 (MQ=255) aTCGTTAAATTTGCTACCGACAGCGAACTGCGGTCGAGATAATTGATTGCCGCCGC‑AAAAAATAATAACAACATGGCGGTGGTTTGAATGCGTTTAATTCGGGTACTGCGTTGAACTAATCCATCTGGTGGCACGGGAat < 1:324208/140‑1 (MQ=255) tCGAGATAATTGATTGCCGCCGC‑AAAAAATAATAACAACATGGCGGTGGTTTGAATGCGTTTAATTCGGGTACTGCGTTGAACTAATCCATCTGGTGGCACGGGAATATCTGCCGACGAAGATGGAGTAAATGAAGAAcg < 1:121635/140‑1 (MQ=255) tGATTGCCGCCGC‑AAAAAATAATAACAACATGGCGGTGGTTTGAATGCGTTTAATTCGGGTACTGCGTTGAACTAATCCATCTGGTGGCACGGGAATATCTGCCGACGAAGATGGAGTAAATGAAGAACGCGGATCGATg < 1:104739/140‑1 (MQ=255) | AGTTGCGCAATCCCGTAAGCGAGTGAAAACACGGAGAGCAAAGCGCCGATTTCGGTGGCACTTAATCCCAATTCTTCACGAATCGTTAAATTTGCTACCGACAGCGAACTGCGGTCGAGATAATTGATTACCGCCGC‑AAAAAATAATAACAACATGGCGGTGGTTTGAATGCGTTTAATTCGGGTACTGCGTTGAACTAATCCATCTGGTGGCACGGGAATATCTGCCGACGAAGATGGAGTAAATGAAGAACGCGGATCGATG > NC_000913/4594439‑4594702 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |