| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,544,618 | G→A | A76V (GCC→GTC) | bioH ← | pimeloyl‑acyl carrier protein methyl ester esterase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,544,618 | 0 | G | A | 97.6% | 145.3 / ‑5.2 | 42 | A76V (GCC→GTC) | bioH | pimeloyl‑acyl carrier protein methyl ester esterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (24/17); minor base C (1/0); total (25/17) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCGGCCACTCGTCACGAGCACTAAAACAAGGTGACGACGCCACGGTGACCAGCGCCTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATG > NC_000913/3544490‑3544752 | ccGGCCACTCGTCACGAGCACTAAAACAAGGTGACGACGCCACGGTGACCAGCGCCTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGt < 2:606809/140‑1 (MQ=255)ccGGCCACTCGTCACGAGCACTAAAACAAGGTGACGACGCCACGGTGACCAGCGCCTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGt < 2:341452/140‑1 (MQ=255) gCCACTCGTCACGAGCACTAAAACAAGGTGACGACGCCACGGTGACCAGCGCCTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGTGcc < 2:143984/140‑1 (MQ=255) gCCACTCGTCACGAGCACTAAAACAAGGTGACGACGCCACGGTGACCAGCGCCTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGTGcc > 2:28625/1‑140 (MQ=255) cTCGTCACGAGCACTAAAACAAGGTGACGACGCCACGGTGACCAGCGCCTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGtt > 2:643378/1‑140 (MQ=255) cACTAAAACAAGGTGACGACGCCACGGTGACCAGCGCCTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCt < 1:264479/140‑1 (MQ=255) cACTAAAACAAGGTGACGACGCCACGGTGACCAGCGCCTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCt < 2:164854/140‑1 (MQ=255) cACTAAAACAAGGTGACGACGCCACGGTGACCAGCGCCTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCt < 1:625052/140‑1 (MQ=255) cTAAAACAAGGTGACGACGCCACGGTGACCAGCGCCTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTc > 2:590792/1‑140 (MQ=255) aaCAAGGTGACGACGCCACGGTGACCAGCGCCTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGcc < 2:717430/140‑1 (MQ=255) cgacgCCACGGTGACCAGCGCCTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCaa > 1:158307/1‑140 (MQ=255) gacgCCACGGTGACCAGCGCCTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAg > 1:146869/1‑140 (MQ=255) ccACGGTGACCAGCGCCTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGAc > 2:501016/1‑140 (MQ=255) aCGGTGACCAGCGCCTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAg < 1:137168/140‑1 (MQ=255) aCCAGCGCCTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCAcc > 2:571254/1‑140 (MQ=255) aCCAGCGCCTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCAcc > 2:267218/1‑140 (MQ=255) aCCAGCGCCTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCAcc < 2:158307/140‑1 (MQ=255) gcCTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGCCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATcc > 2:160074/1‑140 (MQ=255) ccTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACTGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATccc > 1:314912/1‑140 (MQ=255) ccTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATccc < 1:28625/140‑1 (MQ=255) gAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCgg > 1:308361/1‑140 (MQ=255) cGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACg > 1:554108/1‑140 (MQ=255) cGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGt > 1:384807/1‑140 (MQ=255) aTCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTcaac > 1:725928/1‑140 (MQ=255) aTCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTcaac > 1:238611/1‑140 (MQ=255) aTCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTcaac > 1:251760/1‑140 (MQ=255) tCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTcaaca < 1:571254/140‑1 (MQ=255) tCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTcaaca > 1:400034/1‑140 (MQ=255) tGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAg < 2:238611/140‑1 (MQ=255) cTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTg > 1:132138/1‑140 (MQ=255) cTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTg > 1:489537/1‑140 (MQ=255) gCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAg > 1:204860/1‑140 (MQ=255) gACTCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTa < 1:632292/140‑1 (MQ=255) tCCAGCCTAACCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGt > 2:736841/1‑140 (MQ=255) aaCCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCg > 2:374104/1‑124 (MQ=255) aaCCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCg < 1:374104/124‑1 (MQ=255) aaCCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTc > 1:221469/1‑140 (MQ=255) aaCCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTc > 1:787801/1‑140 (MQ=255) aCCAAATGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCa > 2:637052/1‑140 (MQ=255) aaaTGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATg < 1:643378/140‑1 (MQ=255) aaaTGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATg < 2:163383/140‑1 (MQ=255) aaaTGACTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAACCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATg < 2:237526/140‑1 (MQ=255) | CCGGCCACTCGTCACGAGCACTAAAACAAGGTGACGACGCCACGGTGACCAGCGCCTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATG > NC_000913/3544490‑3544752 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |