Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,487,156 | A→G | intergenic (+193/‑79) | hrpA → / → ydcF | ATP‑dependent RNA helicase HrpA/DUF218 domain‑containing protein YdcF |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,487,156 | 0 | A | G | 100.0% | 49.2 / NA | 15 | intergenic (+193/‑79) | hrpA/ydcF | ATP‑dependent RNA helicase HrpA/DUF218 domain‑containing protein YdcF |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (0/15); total (0/15) |
ATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGTTAAGGACATACGATTTCCTCCTTTCAGAGTGCTCCGCTTCTCACTATTATCTCACGCAGTATTCTTAAGGGAACGATAAGGAGGAACCATGAACATTACCCCGTTTCCGACGCTTTCGCCGGCAACTATAGATGCCATAAATG > NC_000913/1487021‑1487289 | attaATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGTTAAGGACATGCGAt < 1:604587/140‑1 (MQ=255) cGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGTTAAGGACATGCGATTTCCTCCTTTCag < 1:671256/140‑1 (MQ=255) gggTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGTTAAGGACATGCGATTTCCTCCTTTCAGAGTGCt < 1:280511/140‑1 (MQ=255) gggTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGTTAAGGACATGCGATTTCCTCCTTTCAGAGTGCt < 1:9329/140‑1 (MQ=255) tAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGTTAAGGACATGCGATTTCCTCCTTTCAGAGTGCTCCg < 2:199182/140‑1 (MQ=255) aaaTTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGTTAAGGACATGCGATTTCCTCCTCTCAGAGTGCTCCGCtt < 2:793471/140‑1 (MQ=255) aaTTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGTTAAGGACATGCGATTTCCTCCTTTCAGAGTGCTCCGCTtc < 2:731499/140‑1 (MQ=255) aTTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGTTAAGGACATGCGATTTCCTCCTTTCAGAGTGCTCCGCTtct < 1:375784/140‑1 (MQ=255) tCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGTTAAGGACATGCGATTTCCTCCTTTCAGAGTGCTCCGCTTCTCa < 2:797/140‑1 (MQ=255) aTTCAGAAAAATAAAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGTTAAGGACATGCGATTTCCTCCTTTCAGAGTGCTCCGCTTCTCACtatta < 2:262638/140‑1 (MQ=255) ttCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGTTAAAGAAAAGCGAATTTCTCCTTTTTGAGTGCTCCCCCTCTCCCtattat > 1:535808/1‑140 (MQ=255) aaaaTACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGTTAAGGACATGCGATTTCCTCCTTTCAGAGTGCTCCGCTTCTCACTATTATCTCACg < 1:53930/140‑1 (MQ=255) gctgcAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGTTAAGGACATGCGATTTCCTCCTTTCAGAGTGCTCCGCTTCTCACTATTATCTCACGCAGTATTCTTAAggg < 1:479405/140‑1 (MQ=255) aGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGCTAAAGACAAGCGATTTTCTCCTTTTCTAAGGCGCCGCCTCTCCCTATTATTTTTCGCCGAATTCTTTAAAGAAAGAAAAAGAGGGAACAAGaaaaata > 2:583014/1‑135 (MQ=255) gCTTGCGGAGTGGCGGTTAAGGACATGCGATTTCCTCCTTTCAGAGTGCTCCGCTTCTCACTATTATCTCACGCAGTATTCTTAAGGGAACGATAAGGAGGAACCATGAACATTACCCCGTTTCCGACGCTTTCGCCGGc < 1:29696/140‑1 (MQ=255) aaGGACATGCGATTTCCTCCTTTCAGAGTGCTCCGCTTCTCACTATTATCTCACGCAGTATTCTTAAGGGAACGATAAGGAGGAACCATGAACATTACCCCGTTTCCGACGCTTTCGCCGGCAACTATAGATGCCATaaa < 1:23764/140‑1 (MQ=255) ggACATGCGATTTCCTCCTTTCAGAGTGCTCCGCTTCTCACTATTATCTCACGCAGTATTCTTAAGGGAACGATAAGGAGGAACCATGAACATTACCCCGTTTCCGACGCTTTCGCCGGCAACTATAGATGCCATAAATg < 2:535808/140‑1 (MQ=255) | ATTAATTCTAAAACGGTAAGGGTAAAAATTCAGGAATTCAGAAAAATACAATTCTCTGCTGCAAGATGAATAATGTTTATCTACAGCATTTCCTTAAAAGATATGTCAGGCTTGCGGAGTGGCGGTTAAGGACATACGATTTCCTCCTTTCAGAGTGCTCCGCTTCTCACTATTATCTCACGCAGTATTCTTAAGGGAACGATAAGGAGGAACCATGAACATTACCCCGTTTCCGACGCTTTCGCCGGCAACTATAGATGCCATAAATG > NC_000913/1487021‑1487289 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |